[發明專利]長鏈非編碼RNA AC022164.1在肺癌預后中的應用在審
| 申請號: | 202210868438.6 | 申請日: | 2022-07-22 |
| 公開(公告)號: | CN115044678A | 公開(公告)日: | 2022-09-13 |
| 發明(設計)人: | 曾添晟;賴國鋒;陸家雯;梁美;馮雪;高文輝 | 申請(專利權)人: | 廣州齊凱基因科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886;G16B20/00;G16H70/40 |
| 代理公司: | 廣州幫專高智知識產權代理事務所(特殊普通合伙) 44674 | 代理人: | 顏德昊 |
| 地址: | 510000 廣東省*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 長鏈非 編碼 rna ac022164 肺癌 預后 中的 應用 | ||
本發明提出了一種長鏈非編碼RNA AC022164.1在肺癌預后中的應用。本發明鑒定了一個新的lncRNA AC022164.1在肺癌中顯著低表達,并且AC022164.1的低表達與肺癌的不良預后顯著相關。AC022164.1的表達也是肺癌預后的獨立保護因子,因此AC022164.1可能成為有前途的肺癌預后標志物。此外,本研究還初步探索了AC022164.1在肺癌中的作用機制,通過構建ceRNA網絡發現AC022164.1在肺癌中與69個microRNA和66個mRNA共同作用影響肺癌的發生發展。此外,AC022164.1還可能參與多條信號通路以影響肺癌的發生發展。
技術領域
本發明涉及長鏈非編碼RNA AC022164.1在肺癌預后中的應用。
背景技術
肺癌是全球癌癥死亡的第一大原因。肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)是非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中最常見的亞型。在過去的幾十年里,LUAD的臨床治療已經發展出多種治療方法,包括手術、化療、放療、靶向治療、免疫治療以及多種治療方法的結合。如今,針對幾種致癌驅動因子(如EGFR和BRAF)的靶向治療以及針對免疫檢查點(如PD-1或PD-L1)的免疫治療取得了顯著的成功。但LUAD患者5年生存率仍低于20%。因此,尋找可靠的預后標志物對肺癌患者的預后管理以及治療方法的開發具有重要作用。
長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNAs,lncRNAs)由超過200個核苷酸組成,其編碼蛋白質的能力有限或沒有。近年來的研究表明lncRNAs在腫瘤發生和腫瘤發展中的調節作用。在肺癌中,lncRNA HOTAIR的功能已被廣泛研究,然而還有大量lncRNA在肺癌中的功能仍未知。因此,本研究旨在鑒別新型lncRNA作為肺癌預后標志物并進一步探討其作用機制。
發明內容
本發明鑒定了一個新的lncRNA AC022164.1在肺癌中顯著低表達,并且AC022164.1的低表達與肺癌的不良預后顯著相關。AC022164.1的表達也是肺癌預后的獨立保護因子,因此AC022164.1可能成為有前途的肺癌預后標志物。此外,本研究還初步探索了AC022164.1在肺癌中的作用機制,通過構建ceRNA網絡發現AC022164.1在肺癌中與69個microRNA和66個mRNA共同作用影響肺癌的發生發展。此外,AC022164.1還可能參與多條信號通路以影響肺癌的發生發展。總而言之,本研究鑒定了一個新型lncRNA AC022164.1有望成為有效的肺癌預后預測因子,為肺癌的預后管理和療法開發提供依據。
附圖說明
圖1為本發明的GEPIA分析;
圖2為AC022164.1的表達與肺癌的預后之間的關系;(A)TCGA-LUAD隊列中AC022164.1高表達組和低表達組的OS卡普蘭-邁耶曲線;(B)GEO-LUAD隊列中AC022164.1高表達組和低表達組的OS卡普蘭-邁耶曲線;(C)AC022164.1在TCGA-LUAD隊列和GTEX隊列兩種不同樣本類型中的表達情況;D)多因素分析;
圖3為不同AC022164.1表達組的臨床特征,X軸是AC022164.1高表達組的頻率,y軸是AC022164.1低表達組的頻率;
圖4為AC022164.1表達在肺癌中的作用機制;(A)差異基因火山圖;(B)KEGG通路分析;(C)GSEA分析;
圖5為ceRNA網絡圖;
圖6為列線圖及矯正曲線圖。
具體實施方式
為讓本領域的技術人員更加清晰直觀的了解本發明,下面將結合附圖,對本發明作進一步的說明。
研究方法
1.研究隊列
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