[發(fā)明專利]一種鑒定豫西黑豬品種的特異分子身份證及其應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202210816818.5
• 申請(qǐng)日: 2022-07-12
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN114959069A
• 公開(kāi)（公告）日: 2022-08-30
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 李新建;李秀領(lǐng);李聰;段棟棟;韓雪蕾;王克君;喬瑞敏
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/6888
• 分類號(hào): C12Q1/6888;G16B20/20;G16B20/50;G16B30/00;G16B40/00;G16B45/00
• 代理公司: 鄭州優(yōu)盾知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 41125
• 代理人: 冉珊敏

本發(fā)明屬于豬品種鑒定領(lǐng)域，涉及豫西黑豬種質(zhì)資源，特別是指一種鑒定豫西黑豬品種的特異分子身份證及其應(yīng)用。通過(guò)SNP分子標(biāo)記對(duì)確山黑豬品種進(jìn)行研究，采用生物信息學(xué)技術(shù)綜合分析，并將研究結(jié)果進(jìn)行初步驗(yàn)證，構(gòu)建豫西黑豬的品種特異性分子標(biāo)記，可簡(jiǎn)單明了地區(qū)分豫西黑豬與其他地方豬品種間的差異，可用于豫西黑豬品種的真?zhèn)舞b定和遺傳關(guān)系分析，為豫西黑豬品種的知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù)提供了有效的科學(xué)依據(jù)。在豫西黑豬品種鑒定評(píng)價(jià)時(shí)，只需將豫西黑豬品種與已有特異性分子身份證比較分析，即可確定其是否為豫西黑豬品種。這大大降低了豫西黑豬種質(zhì)資源鑒定評(píng)價(jià)的時(shí)間和費(fèi)用，提高了豫西黑豬品種鑒定評(píng)價(jià)的效率。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于豬品種鑒定領(lǐng)域，涉及豫西黑豬種質(zhì)資源，特別是指一種鑒定豫西黑豬品種的特異分子身份證及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

豫西黑豬分布在河南省三門峽市，是以優(yōu)良地方豬：南陽(yáng)黑豬、二花臉豬、萊蕪豬和西方商品豬：杜洛克豬作為基礎(chǔ)群，世代培育而成，具有繁殖力強(qiáng)、肉質(zhì)好、抗病性高、耐粗飼等優(yōu)良特征。在優(yōu)勢(shì)品種的選育過(guò)程中，需要探索新的技術(shù)和手段為優(yōu)良品種的培育提供保障。如何快速高效的對(duì)畜禽品種進(jìn)行分子識(shí)別和品種鑒定，成為品種能夠在生產(chǎn)中進(jìn)行開(kāi)發(fā)利用和可持續(xù)發(fā)展的關(guān)鍵。對(duì)地方品種的有效保護(hù)和合理開(kāi)發(fā)，將有助于河南省養(yǎng)豬業(yè)的可持續(xù)發(fā)展和家畜資源多樣性的豐富。特別是對(duì)地方豬品種的特異性遺傳結(jié)構(gòu)和表征的研究，將有助于根據(jù)品種遺傳情況制定對(duì)每個(gè)品種的保護(hù)計(jì)劃，促進(jìn)對(duì)地方豬品種的具體保護(hù)。保存每個(gè)品種的獨(dú)特變異、基因和特征對(duì)于維持生物多樣性和適應(yīng)未來(lái)環(huán)境變化極為重要。因此，利用生物信息技術(shù)鑒定河南地方豬品種獨(dú)特的遺傳特征是準(zhǔn)確保護(hù)地方豬種質(zhì)遺傳資源的重要部分。

隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，芯片測(cè)序技術(shù)成為高通量SNP分型的有力工具。與此同時(shí)，在動(dòng)物受到長(zhǎng)期的自然選擇和人工選擇時(shí)，會(huì)在其基因組上留下相應(yīng)的遺傳印記。這些遺傳印記通常被稱為選擇信號(hào)。選擇信號(hào)的研究是基于基因組到表型概念的一種研究策略。由于我國(guó)地方豬種表型記錄的缺乏和種群規(guī)模小，對(duì)家畜種質(zhì)特征的分析日益成為一種重要的方法。為了實(shí)現(xiàn)批量檢測(cè)豫西黑豬，本課題組進(jìn)行了長(zhǎng)期的探索。

發(fā)明內(nèi)容

為實(shí)現(xiàn)上述目的，本發(fā)明提出一種鑒定豫西黑豬品種的特異分子身份證及其應(yīng)用。

本發(fā)明的技術(shù)方案是這樣實(shí)現(xiàn)的：

一種鑒定豫西黑豬品種的特異分子身份證，所述SNP位點(diǎn)為豫西黑豬品種間等位基因頻率較高的SNP位點(diǎn)集合。

優(yōu)選的，所述SNP位點(diǎn)位于豬參考基因組EnsemblSscrofa 11.1版本。

所述SNP位點(diǎn)的集合包括CNC10013894位點(diǎn)G/A、CNC10014056位點(diǎn)C/T、CNC10020115位點(diǎn)T/C、CNC10020130位點(diǎn)A/C、CNC10020514位點(diǎn)C/T、CNC10023146位點(diǎn)、CNC10023149位點(diǎn)、CNC10031517位點(diǎn)、CNC10031852位點(diǎn)、CNC10032441位點(diǎn)、CNC10042061位點(diǎn)、CNC10042622位點(diǎn)、CNC10050243位點(diǎn)、CNC10050264位點(diǎn)、CNC10050750位點(diǎn)、CNC10050761位點(diǎn)、CNC10061222位點(diǎn)、CNC10061407位點(diǎn)、CNC10062206位點(diǎn)、CNC10062339位點(diǎn)、CNC10062741位點(diǎn)、CNC10070087位點(diǎn)、CNC10071263位點(diǎn)、CNC10081973位點(diǎn)、CNC10082066位點(diǎn)、CNC10090634位點(diǎn)、CNC10090641位點(diǎn)、CNC10090931位點(diǎn)、CNC10091691位點(diǎn)、CNC10111302位點(diǎn)、CNC10130645位點(diǎn)、CNC10133474位點(diǎn)、CNC10134130位點(diǎn)、CNC10140524位點(diǎn)、CNC10140877位點(diǎn)、CNC10151220位點(diǎn)、CNC10151229位點(diǎn)、CNC10151231位點(diǎn)、CNC10152118位點(diǎn)和CNC10171124位點(diǎn)。