[發明專利]一種基因突變相關蛋白質N-糖基化的結構特異分析方法

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• 申請號: 202210736371.0
• 申請日: 2022-06-27
• 公開（公告）號: CN115326945A
• 公開（公告）日: 2022-11-11
• 發明（設計）人: 馬浩偉
• 申請（專利權）人: 漢諾生物科技（蘇州）有限公司
• 主分類號: G01N30/02
• 分類號: G01N30/02;G01N30/72;G01N30/86
• 代理公司: 蘇州國誠專利代理有限公司 32293
• 代理人: 李小葉

1.一種基因突變相關蛋白質N-糖基化的結構特異分析方法，其特征在于，包括如下步驟：

(1)基于現有的理論蛋白質數據庫中被注釋突變位點的蛋白質，篩選和建立基因突變相關N-糖肽理論數據庫；

(2)基于該基因突變相關N-糖肽理論數據庫，對待測樣本N-糖肽通過液相色譜-質譜聯用分析方法獲得的數據組進行數據庫定性定量搜索；

(3)基于串級質譜結構指紋信息對所鑒定的N-糖肽的N-糖基化位點和N-連接糖序列結構進行確認；

(4)基于所確認的特征多肽序列篩選基因突變相關N-糖蛋白。

2.根據權利要求1所述的一種基因突變相關蛋白質N-糖基化的結構特異分析方法，其特征在于，步驟(1)的具體過程為：基于現有的理論蛋白質數據庫文件，遴選出被注釋突變位點的蛋白質；將已突變氨基酸替換原始氨基酸并生成帶突變氨基酸的新氨基酸序列；對新氨基酸序列進行N-糖基化序列子的篩選；將新氨基酸序列的N-糖基化序列子與原氨基酸序列的N-糖基化序列子進行對比，篩選出基因突變相關N-糖蛋白，建立基因突變相關N-糖肽理論數據庫。

3.根據權利要求2所述的一種基因突變相關蛋白質N-糖基化的結構特異分析方法，其特征在于，基因突變相關N-糖肽理論數據庫的建立依據蛋白質酶切規則，并結合理論N-連接糖數據庫。

4.根據權利要求2所述的一種基因突變相關蛋白質N-糖基化的結構特異分析方法，其特征在于，基因突變形式包括但不限于MUTAGEN、VAR_SEQ以及VARIANT。

5.根據權利要求1所述的一種基因突變相關蛋白質N-糖基化的結構特異分析方法，其特征在于，所述串級質譜結構指紋信息包括特征氨基酸序列碎片離子、翻譯后修飾位點決定性碎片離子和翻譯后修飾結構診斷碎片離子。

6.根據權利要求5所述的一種基因突變相關蛋白質N-糖基化的結構特異分析方法，其特征在于，在進行數據庫定性定量搜索時，前體離子和碎片離子質譜允許偏差20ppm，并基于靶向-誘餌搜索控制假陽性不大于1％。

7.根據權利要求5所述的一種基因突變相關蛋白質N-糖基化的結構特異分析方法，其特征在于，在進行數據庫定性定量搜索時，控制基于位點決定性碎片離子的位點打分和基于結構診斷碎片離子的結構打分均不小于1。

8.根據權利要求1所述的一種基因突變相關蛋白質N-糖基化的結構特異分析方法，其特征在于，所述理論蛋白質數據庫為UniProt蛋白質數據庫。