[發(fā)明專利]基于DNA甲基化的基因點(diǎn)位篩選方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202210718641.5 | 申請日： | 2022-06-23 |
| 公開（公告）號： | CN115083520A | 公開（公告）日： | 2022-09-20 |
| 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人： | 李琦;潘常春;劉海春;王宏武 | 申請（專利權(quán)）人： | 上海交通大學(xué) |
| 主分類號： | G16B20/40 | 分類號： | G16B20/40;G16B30/10;G16B40/20;G06K9/62;G06N3/04 |
| 代理公司： | 上海劍秋知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31382 | 代理人： | 徐浩俊 |
| 地址： | 200240 *** | 國省代碼： | 上海;31 |
| 權(quán)利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 基于 dna 甲基化 基因 篩選 方法 | ||
1.一種基于DNA甲基化的基因點(diǎn)位篩選方法，其特征在于，所述方法包括：
1)通過元學(xué)習(xí)獲得基因點(diǎn)位篩選模型的初始化參數(shù)；
2)基于步驟1)獲得的初始化參數(shù)重新訓(xùn)練基因點(diǎn)位篩選模型。
2.如權(quán)利要求1所述的基于DNA甲基化的基因點(diǎn)位篩選方法，其特征在于，所述方法還包括：對所述的DNA甲基化數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理。
3.如權(quán)利要求2的基于DNA甲基化的基因點(diǎn)位篩選方法，其特征在于，所述預(yù)處理包括：清洗處理、和/或等分位數(shù)標(biāo)準(zhǔn)化處理、和/或分段處理。
4.如權(quán)利要求1所述的基于DNA甲基化的基因點(diǎn)位篩選方法，其特征在于，所述基因點(diǎn)位篩選模型包括權(quán)重門控層、全連接層和softmax層。
5.如權(quán)利要求4所述的基于DNA甲基化的基因點(diǎn)位篩選方法，其特征在于，所述全連接層為四層。
6.如權(quán)利要求4所述的基于DNA甲基化的基因點(diǎn)位篩選方法，其特征在于，在步驟1)中，所獲得的初始化參數(shù)為所述的全連接層的參數(shù)；在步驟2)中，重新訓(xùn)練點(diǎn)位篩選模型時(shí)僅更新所述的權(quán)重門控層的參數(shù)。
7.如權(quán)利要求4所述的基于DNA甲基化的基因點(diǎn)位篩選方法，其特征在于，所述方法還包括：添加權(quán)重門控層的L1范數(shù)以獲得稀疏結(jié)果，并添加完全連接層的參數(shù)的L2范數(shù)以限制模型的復(fù)雜性。
8.如權(quán)利要求1所述的基于DNA甲基化的基因點(diǎn)位篩選方法，其特征在于，所述基因點(diǎn)位為精神分裂癥基因點(diǎn)位。
9.如權(quán)利要求1所述的基于DNA甲基化的基因點(diǎn)位篩選方法，其特征在于，所述方法還包括：將獲得的特征選擇結(jié)果進(jìn)行分類處理。
10.如權(quán)利要求9所述的基于DNA甲基化的基因點(diǎn)位篩選方法，其特征在于，所述分類處理為：將特征選擇的結(jié)果進(jìn)行壓縮編碼輸入到線性SVM分類器中進(jìn)行分類。
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