[發明專利]辣椒細胞質雄性不育育性恢復基因InDel標記、特異性引物及其應用

有效

• 申請號: 202210700780.5
• 申請日: 2022-06-20
• 公開（公告）號: CN114921586B
• 公開（公告）日: 2023-04-14
• 發明（設計）人: 聶智星;朱為民;陳建瑛;宋云鵬
• 申請（專利權）人: 上海市農業科學院;杭州市農業科學研究院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/686
• 代理公司: 南京華恒專利代理事務所(普通合伙) 32335
• 代理人: 裴素艷

本發明公開了一種辣椒細胞質雄性不育育性恢復基因InDel標記、特異性引物及其應用，所述InDel標記包括P06gInDel?79和P06gInDel?81，位于辣椒參考基因組Zunla?1?V2.0的6號染色體上，對應物理位置分別為Chr06:215,419,754..215,420,003和Chr06:215,498,219..215,498,426，用于檢測上述InDel標記的引物分別為P06gInDel?79?F/P06gInDel?79?R和P06gInDel?81?F/P06gInDel?81?R。利用本發明中的InDel標記和篩選方法，可在種質資源中快速篩選新的辣椒保持系和恢復系，從而加快辣椒雜交種選育進程。

技術領域

本發明屬于辣椒育種領域，尤其涉及一種辣椒細胞質雄性不育（Cytoplasmicmale?sterility，CMS）育性恢復基因InDel標記、特異性引物及其應用。

背景技術

中國是全球最大的辣椒生產國，其中90%以上辣椒品種是雜交種。由CMS系、保持系和恢復系組成的“三系”雜交制種體系是辣椒雜交種制種的重要方法之一。該方法可以顯著降低生產成本，提高雜交種純度。“三系”雜交種的育性穩定是其大面積推廣的重要保證，恢復系中的基因對其起著關鍵作用。

在辣椒“三系”雜交育種中，恢復系和不育系是雜交種選育的基礎。新的恢復系和不育系的篩選通常通過與已有CMS系測交，觀察后代F₁的育性進行確定。這至少需要2個生長季節的時間，且F₁的育性可能會存在環境條件的影響，通過此種方法的選育效率較低，準確性需要在不同的生長環境中驗證。近年來，分子標記輔助選擇逐漸在育種實踐中得到有效應用。在精細定位恢復基因的基礎上，獲得與育性恢復基因共分離的分子標記，可在種質資源中篩選新的保持系和恢復系，利用新篩選出的保持系作為父本，對原CMS系連續回交4代以上，即可獲得新的不育系。通過分子標記輔助選擇可以節省育種時間，加快辣椒雜交種選育進程。

發明內容

發明目的：為了解決上述問題，本發明的目的在于提供一種辣椒細胞質雄性不育育性恢復基因InDel標記、特異性引物及其應用，該InDel標記可用于辣椒分子標記輔助育種，篩選新的保持系和恢復系。

技術方案：本發明的目的可通過如下技術方案實現：

一種辣椒細胞質雄性不育育性恢復基因InDel標記，所述InDel標記包括P06gInDel-79和P06gInDel-81，位于辣椒參考基因組Zunla-1?V2.0的6號染色體上，對應物理位置分別為Chr06:?215,419,754..215,420,003和Chr06:?215,498,219..215,498,426。

所述的辣椒細胞質雄性不育育性恢復基因InDel標記的特異性引物，所述特異性引物的序列如下所示：

InDel標記P06gInDel-79：

上游引物P06gInDel-79-F：5′-GAGGGTCTTCCTATGTTTGTCC-3′，SEQ?ID?NO.1；

下游引物P06gInDel-79-R：5′-TGCACGAATGAACAGTAAACCA-3′，SEQ?ID?NO.2；

InDel標記P06gInDel-81：

上游引物P06gInDel-81-F：5′-TCATTCCCTTTTTCCAGCTCTG-3′，SEQ?ID?NO.3；

下游引物P06gInDel-81-R：5′-ACAGGGGTGTTATGGGTGATT-3′，SEQ?ID?NO.4。

一種試劑盒，包含所述的特異性引物。

所述的InDel標記、所述的特異性引物或所述的試劑盒在辣椒分子標記輔助育種中的應用。