[發明專利]一種基于妊娠中期失眠產婦腦脊液脂質組學代謝物預測新生兒異常體重的分析方法在審
| 申請號: | 202210517277.6 | 申請日: | 2022-05-12 |
| 公開(公告)號: | CN114910597A | 公開(公告)日: | 2022-08-16 |
| 發明(設計)人: | 王帆;王登蘭;沈娟娟;宋春;李慧;李夢潔 | 申請(專利權)人: | 新疆醫科大學第二附屬醫院 |
| 主分類號: | G01N30/88 | 分類號: | G01N30/88;G01N30/72;G01N30/86 |
| 代理公司: | 北京華仁聯合知識產權代理有限公司 11588 | 代理人: | 周明新 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 妊娠 中期 失眠 產婦 腦脊液 脂質組學 代謝物 預測 新生兒 異常 體重 分析 方法 | ||
本發明涉及生物信息技術領域,尤其涉及一種基于妊娠中期失眠產婦腦脊液脂質組學代謝物預測新生兒異常體重的分析方法。其技術方案包括:S1、樣品制備:收集CSF進行處理;S2、超高效液相色譜?質譜檢測分析;S3、數據分析:提取數據,通過正交偏最小二乘判別分析和配對樣本T檢驗對數據進行分析,獲得兩組之間的差異性代謝物,并對這些物質結合已有文獻報道進行初步鑒定和驗證。本發明可以綜合地體現CSF代謝產物的變異狀況,可用于參與妊娠中期失眠引起新生兒異常體重的特異性脂質化合物,通過分析脂質化合物涉及的信號通路,制定相應臨床防治策略和檢測指標,對妊娠期失眠引起新生兒異常體重的早期預測和預后提供有利的技術支持。
技術領域
本發明涉及生物信息技術領域,具體涉及一種基于妊娠中期失眠產婦腦脊液脂質組學代謝物預測新生兒異常體重的分析方法。
背景技術
妊娠中期失眠高發,與新生兒異常體重的發生密切相關。出生時體重偏輕或巨大兒,在新生兒時易發生低血糖,低體溫,易感染,呼吸窘迫綜合癥,伴發先天性心臟病等風險,進入兒童期后,存在認知能力低下,學習困難,行為異常,身材矮小等,成年后,出現超重、肥胖、糖脂代謝異常,高血壓及糖尿病等疾病的發病率增高。新生兒異常體重的發生涉及個體的多個方面,且失眠可直接致使脂代謝異常,尋找并確定妊娠中期失眠引起新生兒異常體重的特異性靶標,同時在妊娠中期有足夠的時間可干預胎兒體重,而在妊娠晚期對胎兒體重的干預時間短,治療新生兒異常體重的效果欠佳,由此制定適合臨床的預防與干預策略。
代謝組學是一種高靈敏度,高通量分析方法,可用于研究病理生理狀態下低分子量代謝物的特征變化。脂質是一類多樣化的分子,在細胞內能量的貯存、細胞結構以及信號傳遞方面都有著重要的作用。脂質組學是代謝組學的一個重要分支,通過鑒定并詳細分析脂質代謝物對生物體、組織或細胞以及與其相互作用的分子與在生物體系中的多重作用。超高效液相色譜-質譜(LC/MS)聯用技術作為脂質組學分析中廣泛采用的技術之一,具有高分離度、高速度和高靈敏度的特點。
以往研究中,常采用交叉驗證方法建立代謝物篩選模型,特點是將樣本的代謝組數據分為兩個部分,其中一部分用來建立模型,另一部分用來評價模型的預測能力,根據預測能力的好壞選擇模型參數,從而確定最終模型。但是這種建模方法存在一定缺陷:判別模型預測能力的不是獨立樣本。因為在建模過程中所有樣本都會被用來建立模型,所以該過程存在一定程度的非獨立性,干擾了模型預測能力的判別和模型預測誤差的估計。缺乏完全獨立性的建??茖е逻^擬合的可能,這樣的模型不能真實有效地反映代謝組數據的信息,從而對標記物的篩選出現偏差。
本方法基于使用妊娠中期失眠孕婦腦脊液(CSF)代謝組學分析方法,包括收集新生兒體重正常的妊娠中期失眠孕婦CSF與新生兒體重異常的妊娠中期失眠孕婦CSF樣本,處理后經色譜柱分離,并采用質譜檢測分析,再進行LC/MS檢測分析后提取并對齊儀器原始數據,獲得無噪音干擾、可用于統計分析的數據。對數據進行分析得到代謝組輪廓,建立雙重交叉驗證篩選模型,篩選新生兒體重正常與新生兒體重異常的妊娠中期失眠孕婦CSF脂質差異特異性標記物。
發明內容
本發明提供了一種基于妊娠中期失眠產婦腦脊液脂質組學代謝物預測新生兒異常體重的分析方法,解決了以上所述的技術問題。
本發明解決上述技術問題的方案如下:
一種基于妊娠中期失眠產婦腦脊液脂質組學代謝物預測新生兒異常體重的分析方法,包括以下步驟:
S1、樣品制備:收集行剖宮產手術中孕婦進行腰椎穿刺抽取CSF1ml置于生化管中,放置4℃冰箱中,當日分裝,儲存于-80℃低溫冷凍儲存箱,待樣本收齊后統一后,進行處理;
S2、超高效液相色譜-質譜檢測分析:將CSF樣本經色譜柱分離,并采用質譜檢測分析;
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