[發(fā)明專利]蛋白質結構預測方法、裝置、電子設備及存儲介質

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202210501193.3
• 申請日: 2022-05-09
• 公開（公告）號: CN115881210A
• 公開（公告）日: 2023-03-31
• 發(fā)明（設計）人: 孟金濤;鄭良振;林明智;王晟
• 申請（專利權）人: 上海智峪生物科技有限公司
• 主分類號: G16B15/00
• 分類號: G16B15/00;G16B30/10
• 代理公司: 深圳紫藤知識產(chǎn)權代理有限公司 44570
• 代理人: 汪阮磊

1.一種蛋白質結構預測方法，其特征在于，包括：

采用多個數(shù)據(jù)庫同時對待測蛋白質的待測氨基酸序列進行多序列比對，得到所述待測蛋白質對應的序列比對特征數(shù)據(jù)；

在所述序列比對特征數(shù)據(jù)中確定出所述待測蛋白質對應的多個目標氨基酸序列，并對所述多個目標氨基酸序列進行長度排序，得到序列排序結果；

根據(jù)所述序列排序結果確定多個目標模型；

在每一所述目標模型中輸入對應的目標氨基酸序列，輸出每一所述目標氨基酸序列對應的非松弛結構模型；

根據(jù)所述每一所述目標氨基酸序列對應的非松弛結構模型確定所述待測蛋白質的蛋白質結構。

2.根據(jù)權利要求1所述的蛋白質結構預測方法，其特征在于，所述采用多個數(shù)據(jù)庫同時對待測蛋白質的待測氨基酸序列進行多序列比對，得到所述待測蛋白質對應的序列比對特征數(shù)據(jù)，包括：

確定采用所述多個數(shù)據(jù)庫同時對待測蛋白質的待測氨基酸序列進行多序列比對時產(chǎn)生的中間數(shù)據(jù)；

根據(jù)所述中間數(shù)據(jù)確定出所述序列比對特征數(shù)據(jù)，刪除所述中間數(shù)據(jù)。

3.根據(jù)權利要求1所述的蛋白質結構預測方法，其特征在于，在所述根據(jù)所述序列排序結果確定多個目標模型之前，所述方法還包括：

確定多個預編譯模型分別對應的預設序列長度范圍；

所述根據(jù)所述序列排序結果確定多個目標模型，包括：

根據(jù)所述排序結果和所述預設序列長度范圍在所述多個預編譯模型中確定出所述目標模型。

4.根據(jù)權利要求3所述的蛋白質結構預測方法，其特征在于，所述根據(jù)所述排序結果和所述預設序列長度范圍在所述多個預編譯模型中確定出所述目標模型，包括：

在所述排序結果中確定每一所述目標氨基酸序列對應的長度；

根據(jù)每一所述目標氨基酸序列對應的長度在所述預設序列長度范圍中確定出每一所述目標氨基酸序列所屬的目標預設序列長度范圍；

將所述目標預設序列長度范圍對應的預編譯模型確定為所述目標模型。

5.根據(jù)權利要求1所述的蛋白質結構預測方法，其特征在于，所述在每一所述目標模型中輸入對應的目標氨基酸序列，輸出每一所述目標氨基酸序列對應的非松弛結構模型，包括：

確定每一所述目標模型對應的至少一個所述目標氨基酸序列；

加載所述目標模型，將至少一個所述目標氨基酸序列輸入至所述目標模型中，輸出每一所述目標氨基酸序列對應的非松弛結構模型。

6.根據(jù)權利要求5所述的蛋白質結構預測方法，其特征在于，所述目標模型包括多個目標子模型，所述加載所述目標模型，將至少一個所述氨基酸序列輸入至所述目標模型中，輸出每一所述目標氨基酸序列對應的非松弛結構模型，包括：

同時加載所述多個目標子模型，依次將所述至少一個目標氨基酸序列同時輸入至所述多個目標子模型中；

獲取每一所述目標子模型輸出的非松弛結構模型。

7.根據(jù)權利要求1所述的蛋白質結構預測方法，其特征在于，所述根據(jù)所述每一所述目標氨基酸序列對應的非松弛結構模型確定所述待測蛋白質的蛋白質結構，包括：

對每一所述目標氨基酸序列對應的非松弛結構模型進行力場松弛處理，得到每一所述目標氨基酸序列對應的松弛結構模型；

根據(jù)每一所述目標氨基酸序列對應的松弛結構模型確定所述待測蛋白質的蛋白質結構。

8.根據(jù)權利要求7所述的蛋白質結構預測方法，其特征在于，所述對每一所述目標氨基酸序列對應的非松弛結構模型進行力場松弛處理，得到每一所述目標氨基酸序列對應的松弛結構模型，包括：

對每一所述目標氨基酸序列的非松弛結構模型對應的所有原子進行力場松弛處理，得到每一所述目標氨基酸序列對應的松弛結構模型。