[發明專利]一種SESN2基因SNP標記檢測藏雞經濟性狀的方法及其應用

在審

• 申請號: 202210467306.2
• 申請日: 2022-04-29
• 公開（公告）號: CN114657268A
• 公開（公告）日: 2022-06-24
• 發明（設計）人: 李志雄;陳立英;吳錦波;林亞秋;熊燕
• 申請（專利權）人: 西南民族大學;阿壩藏族羌族自治州畜牧科學技術研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 成都坤倫厚樸專利代理事務所(普通合伙) 51247
• 代理人: 吳亦雨

本發明屬于分子生物學檢測領域，具體涉及一種SESN2基因SNP標記檢測藏雞經濟性狀的方法及其應用。具體技術方案為：一種影響藏雞性狀的SNP分子標記，所述SNP分子標記位于藏雞SESN2基因對參考序列Genbank Accession No.NC_052554的第8644位點的堿基處，突變堿基為C或T。本發明首次發現，藏雞SESN2基因第8644位處，如果發生C?T突變，會直接關系到是否出現RsaI酶切位點；且CT基因型的個體，各方面的經濟性狀均有明顯提升。因此，利用該突變位點可簡單、快速、準確、高效地檢測藏雞的經濟性狀，并可直接應用到藏雞選育中，以提升藏雞的經濟性能。

技術領域

本發明屬于分子生物學檢測領域，具體涉及一種SESN2基因SNP標記檢測藏雞經濟性狀的方法及其應用。

背景技術

單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism，SNP)是指基因組DNA序列由于單個核苷酸的變化而引起的多態性，主要包括堿基的轉換、顛換、插入和缺失等。SNP屬于第三代分子標記，具有高密度、和易于檢測等優點，已廣泛應用于生物遺傳多樣性及分子遺傳育種研究。

分子育種，分子標記輔助選擇(molecularmark-assistselection，MAS)，是借助DNA分子標記對育種材料進行選擇，進而實現對畜禽性狀的品種改良。在畜禽育種中，如果選出與經濟性狀密切相關的DNA標記，則有望提高選種準確性，提高選育效率和效果。

SESN2(Hi95)是進化保守的應激誘導基因SESN家族的主要成員之一。SESN2參與動物代謝、衰老、肌肉和神經退行性病變、應對遺傳毒性的壓力、癌癥發生等生物學過程；在對抗動物氧化應激反應、阻止肌肉萎縮和維持肌肉完整性中也具有重要作用。

發明內容

本發明的目的是提供一種SESN2基因SNP標記檢測藏雞經濟性狀的方法及其應用。

為實現上述發明目的，本發明所采用的技術方案是：一種影響藏雞性狀的SNP分子標記，所述SNP分子標記位于藏雞SESN2基因對參考序列Genbank Accession No.NC_052554的第8644位點的堿基處，突變堿基為C或T。

優選的，所述SNP分子標記的基因型為CC、CT或TT中的任意一種。

相應的，所述SNP分子標記在檢測藏雞經濟性狀或藏雞選育中的應用。

相應的，包含所述SNP分子標記的試劑盒或檢測試紙或檢測試劑。

優選的，所述試劑盒或檢測試紙或檢測試劑中至少包括用于擴增所述SNP分子標記的特異性引物對。

優選的，所述引物對包括：

上游引物如SEQ ID NO：1所示；下游引物：如SEQ ID NO：2所示。

相應的，所述試劑盒或檢測試紙或檢測試劑在檢測藏雞性狀中的應用。

優選的，所述應用包括如下步驟：

(1)獲取待檢測藏雞的血液；

(2)從血液中提取基因組DNA；

(3)將基因組DNA進行PCR擴增，獲得PCR擴增產物；

(4)將PCR擴增產物進行酶切、電泳、分析，確定待測藏雞的所述SNP分子標記的基因型。

優選的，所述PCR擴增的反應體系包括：2×Buffer、擴增所述SNP分子標記的特異性引物對、Taq DNA聚合酶、DNA模板。

優選的，所述PCR擴增的反應程序包括：95℃預變性3min；再進行36個如下循環：94℃變性30s，63℃退火30s，72℃延伸30s；循環結束后，再72℃延伸5min。