[發明專利]一種用于胃癌輔助診斷的SNP標志物及其應用

有效

• 申請號: 202210465533.1
• 申請日: 2022-04-29
• 公開（公告）號: CN114941030B
• 公開（公告）日: 2023-05-05
• 發明（設計）人: 沈洪兵;靳光付;胡志斌;馬紅霞;戴俊程;朱猛;江玥;顏財旺;汪天培
• 申請（專利權）人: 南京醫科大學
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 南京天華專利代理有限責任公司 32218
• 代理人: 劉成群;徐冬濤

本發明屬于基因工程及腫瘤醫學領域，公開了一種用于胃癌輔助診斷的SNP標志物及其應用。該標志物為rs7366775、rs72706172、rs138554234、rs9841504、rs11937064、rs11098765、rs10074991、rs77651534、rs36012714、rs863241、rs114080964、rs28749114、rs9381024、rs2294693、rs1679709、rs2585177、rs10105842、rs10087426、rs7849280、rs10509670、rs11187838和rs11851309的組合。該診斷試劑盒有較好效果。

發明領域

本發明屬于基因工程及腫瘤醫學領域，涉及胃癌輔助診斷相關的SNP標志物及其應用。

背景技術

胃癌是全球最常見的消化道惡性腫瘤，其發病率占惡性腫瘤的第五位，死亡率居第二位。據國際癌癥研究署(IARC)估計，2018年全球胃癌新發病例103.3萬人，占全部癌癥新發病例的5.7％；胃癌死亡人數78.3萬，占全部癌癥死亡病例的8.2％。在我國，胃癌年齡標化發病率為22.7/10萬，胃癌死亡率僅次于肺癌居我國惡性腫瘤第二位，每年46.4萬人死于胃癌，約占全球胃癌死亡人數的47％。胃癌起病隱匿、進展迅速、預后較差，生存率低，嚴重影響患者健康，給家庭和社會帶來了沉重的疾病負擔。胃癌患者的預后與確診時的分期密切相關，進展期胃癌術后5年生存率低于30％，而早期胃癌在積極治療后5年生存率超過90％。然而由于胃癌缺乏特異性癥狀和體征，目前我國早期胃癌檢出率不到10％，大多數患者首診時已經是中晚期。隨著人口基數的不斷增大和胃癌期望壽命的延長，胃癌患病和死亡人數，將在未來相當長一段時期內給我國帶來嚴重的負擔，由此可見，如何精準識別早期胃癌、降低其發病率和死亡率已成為一個亟待解決的重大公共衛生問題。

胃癌是一種慢性復雜性疾病，是環境和遺傳因素長期共同作用的結果，其形成是一個多因素、多階段、復雜的過程，從慢性萎縮性胃炎、腸化生、不典型增生等癌前病變最終進展為胃癌。不過目前其確切發病機制還不是很清楚。遺傳流行病學研究表明，個體遺傳因素在胃癌發生發展中發揮重要的作用，不同的個體對環境暴露的反應存在易感性差異，這種易感性目前被認為是由個體的遺傳因素所決定的。雙生子研究表明，胃癌的遺傳度為22％，提示遺傳因素在胃癌的發生發展中扮演極其重要的角色。單核苷酸多態性(Singlenucleotide?polymorphism，SNP)是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態性，包括轉換、顛換、缺失和插入。SNP是人類可遺傳的變異中最常見的一種，它的存在被認為賦予了個體不同的表型和性狀，并且影響個體對疾病(包括腫瘤)的易感性、以及對藥物的反應性等，有助于深入闡明胃癌發生發展的分子機制，而且通過對潛在的胃癌特異遺傳標志物的鑒定，更有利于胃癌的早期發現、精準預防和個體化治療。

目前，胃癌初步診斷的方法主要包括病史詢問、體格檢查、實驗室檢查、胃腸X線檢查、纖維內窺鏡檢查、脫落細胞學檢查、B超以及CT檢查、腫瘤標記物檢測等。鑒別診斷主要依靠X線鋇餐造影、胃鏡和活組織病理檢查。但臨床常用的X線鋇餐造影和纖維內窺鏡檢查仍存在許多弊端，如難以發現較小的腫瘤或癌前病變、檢查存在盲區以及報告假陰性或假陽性結果等。雖然病理活組織檢查是胃癌診斷的金標準，但由于需要做胃鏡取胃部組織，具有侵入性，不適宜作為臨床健康篩查的手段。

利用疾病易感的SNP譜早期輔助診斷疾病的發生，不僅靈敏、準確和快速，具有廣闊的應用前景，而且通過SNP譜的構建，還可以實現對疾病作出前瞻性的“基因診斷”。近年來，利用SNP早期輔助診斷疾病的發生發展已經成為臨床和科研工作者的研究熱點，在包括胃癌在內的常見重大疾病早期輔助診斷上的應用價值已初見端倪。然而，目前還沒有將SNP應用于胃癌輔助診斷的報道，若能篩選出胃癌的易感SNP作為生物標志物，并研制相應的診斷試劑盒，對我國胃癌的早期診斷和篩查必將是一次有力的推動，能夠有效識別高危人群并針對性進行管理，從而降低胃癌發病率和死亡率，也為其藥物篩選、藥效評價及靶向治療開辟了新的途徑。

發明內容