[發(fā)明專利]基于質(zhì)譜流式技術(shù)的肝癌篩查模型的建立方法

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202210458107.5
• 申請日: 2022-04-27
• 公開（公告）號: CN114937493A
• 公開（公告）日: 2022-08-23
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 梁廷波;章琦;葉茅
• 申請（專利權(quán)）人: 浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院
• 主分類號: G16H50/20
• 分類號: G16H50/20;G16B40/00;G01N15/14;G01N33/574;G01N33/68
• 代理公司: 北京盛凡佳華專利代理事務(wù)所(普通合伙) 11947
• 代理人: 張歡

1.一種基于質(zhì)譜流式技術(shù)的肝癌篩查模型的建立方法，其特征在于，包括以下步驟：

用Ficoll分離法處理外周血樣獲得PBMC，并對PBMC進行質(zhì)譜流式分析，獲得流式分析數(shù)據(jù)集；

通過隨機森林算法處理流式分析數(shù)據(jù)集，以細胞表面標志物陰性比例和亞群比例作為建模特征，進行特征篩選，得到肝癌篩查模型。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于質(zhì)譜流式技術(shù)的肝癌篩查模型的建立方法，其特征在于，特征篩選具體為：根據(jù)特征最高得分選擇特征，從陰性、陽性樣本中分別隨機選擇300例樣本，建立隨機森林模型，并且采用10折交叉驗證方法，得到每個特征的平均特征重要性，重復(fù)1000次，則每個特征都會有1000個特征重要性值，統(tǒng)計每個特征的特征重要性大于0.01的個數(shù)，如果大于400，則該特征被選擇，被選擇的特征作為建模需要的特征。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于質(zhì)譜流式技術(shù)的肝癌篩查模型的建立方法，其特征在于，還包括篩選出13個細胞表面標志物包括CD14、CD152、CD183、CD25、CD278、CD33、CD39、CD4、CD45RA、CD56、CD85j、CD86、CD8α，以及16個細胞亞群包括Myeloid cells/HLA-DR-、Lymphocytes/CD3+/CD4+、Lymphocytes/CD3+/CD4+/ICOS+、Lymphocytes/CD3+/CD4+/CD197+,CD45RA+、Lymphocytes/CD3+/CD4+/CD197-,CD45RA-、HLA-DR+CD38+CD4+T cells、Lymphocytes/CD3+/CD4+/HLA-DR-,CD38-、Lymphocytes/CD3+/CD4+/Tfh(CD185+CD279+)、Lymphocytes/CD3+/CD8+、Lymphocytes/CD3+/CD8+/CXCR5+、Lymphocytes/CD3+/CD8+/CD197+,CD45RA+、Lymphocytes/CD3-/Bcells/IgD+,CD27+、Lymphocytes/CD3-/CD56+CD16+/HLA_DR+、Monocytes、Myeloid cells/HLA-DR-/MDSC。

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于質(zhì)譜流式技術(shù)的癌癥篩查模型的建立方法，其特征在于，還包括采用內(nèi)部驗證集、外部驗證集驗證模型。