[發明專利]一種微流控芯片數字PCR熒光圖像識別方法和裝置在審
| 申請號: | 202210454610.3 | 申請日: | 2022-04-28 |
| 公開(公告)號: | CN114792383A | 公開(公告)日: | 2022-07-26 |
| 發明(設計)人: | 王瑩 | 申請(專利權)人: | 深圳市第二人民醫院(深圳市轉化醫學研究院) |
| 主分類號: | G06V10/764 | 分類號: | G06V10/764;G06K9/62;G06T7/66;G06T7/70 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 518035 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 微流控 芯片 數字 pcr 熒光 圖像 識別 方法 裝置 | ||
1.一種微流控芯片數字PCR熒光圖像識別方法,其特征在于,所述方法包括:
S1,獲取微流控芯片數字PCR熒光圖像,并做圖像預處理;
S2,計算微流控芯片中微反應腔室在熒光圖像中投影的中心點位置;
S3,搜索并獲取所有位于中心點位置灰度為白色的像素;
S4,獲取所述位于中心點的白色像素的像素臨近點的灰度;
S5,對灰度為白色的像素臨近點進一步獲取該像素臨近點的外層像素臨近點的灰度迭代至設定閾值;
S6,根據預設數據與迭代次數比較,得到對比結果;
S7,匯總對比結果得到熒光圖像中陽性點的數量。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述預處理熒光圖像,包括對熒光圖像做去噪、傾斜校正和二值化處理。
3.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述獲取微反應腔室在熒光圖像中投影的中心點位置包括:
S20201,以熒光圖像的一角的頂點像素(如左上角或左下角),采用逐行、逐像素掃描;
S20202,統計每行連續灰度為白色像素點組成線段的長度即每一個連續灰度為白色像素線段的像素個數,計算每行灰度為白色連續像素線段長度的平均值或最大值;
S20203,當灰度為白色連續像素組成線段長度的平均值或最大值由持續增大轉為減小時,記錄下該行位置信息;
S20204,以熒光圖像的一角的頂點像素(如左上角或左下角),采用逐列,逐像素掃描,
S20205,統計每列連續灰度為白色像素點組成線段的長度即每一個連續灰度為白色像素組成線段的像素個數,計算每列灰度為白色連續像素組成線段長度的平均值或最大值;
S20206,當灰度為白色連續像素組成線段的長度的平均值或最大值由持續增大轉為減小時,記錄下該列位置信息;
S20207,計算所記錄行位置信息與列位置信息交叉點灰度為白色的像素位置,即為微反應腔室在熒光圖像中投影的中心點位置。
4.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述獲取白色像素中心點的像素臨近點的灰度包括:像素臨近點的灰度為白色的像素臨近點,則迭代獲取該像素臨近點的像素臨近點,至迭代次數不小于設定閾值或像素臨近點均為黑色。
5.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述根據預設數據與迭代次數進行比較,得到對比結果包括:
預設數據為預設迭代次數、預設像素數量、預設圖形面積和預設分支數量中的一種或多種組合。
6.一種微流控芯片數字PCR熒光圖像識別裝置,其特征在于,所述裝置包括:
獲取模塊,用于獲取微流控數字PCR熒光圖像;
預處理模塊,用于對獲取的微流控數字PCR熒光圖像做預處理;
搜索模塊,用于搜索陽性點;
統計分析模塊,用于統計分析搜索的陽性點數量。
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