[發明專利]棉花抗黃萎病主效QTL位點緊密連鎖的KASP引物和應用在審
| 申請號： | 202210425374.2 | 申請日： | 2022-04-22 |
| 公開（公告）號： | CN114891912A | 公開（公告）日： | 2022-08-12 |
| 發明（設計）人： | 趙云雷;王紅梅;王桂峰;陳偉;魏學文;邢曉飛;蘆建華;趙佩;桑曉慧;張杰;秦都林 | 申請（專利權）人： | 中國農業科學院棉花研究所;山東省農業技術推廣中心（山東省農業農村發展研究中心） |
| 主分類號： | C12Q1/6895 | 分類號： | C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04 |
| 代理公司： | 北京天奇智新知識產權代理有限公司 11340 | 代理人： | 于益 |
| 地址： | 455000 河*** | 國省代碼： | 河南;41 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 棉花 黃萎病 qtl 緊密 連鎖 kasp 引物 應用 | ||
1.一種棉花抗黃萎病主效QTL位點緊密連鎖的KASP引物，其特征在于：所述KASP引物序列如SEQ ID NO：265-282所示；
其中，KASP-Z407標記的等位基因特異引物如SEQ ID NO：265-266所示，公共引物如SEQID NO：267所示；
KASP-Z367標記的等位基因特異引物如SEQ ID NO：268-269所示，公共引物如SEQ IDNO：270所示；
KASP-Z324標記的等位基因特異引物如SEQ ID NO：271-272所示，公共引物如SEQ IDNO：273所示；
KASP-Z427標記的等位基因特異引物如SEQ ID NO：274-275所示，公共引物如SEQ IDNO：276所示；
KASP-Z005標記的等位基因特異引物如SEQ ID NO：277-278所示，公共引物如SEQ IDNO：279所示；
KASP-Z428標記的等位基因特異引物如SEQ ID NO：280-281所示，公共引物如SEQ IDNO：282所示。
2.根據權利要求1所述的棉花抗黃萎病主效QTL位點緊密連鎖的KASP引物，其特征在于：抗黃萎病主效QTL位點分別為qVW-D05-1、qVW-D05-2、qVW-D05-3和qVW-A01-1；
其中，qVW-D05-1的連鎖群為LG_D05.1，位置為53.7998cM，2LOD置信區間為KASP-Z367-KASP-Z407-SWU18948，0.51cM，72,511bp；
qVW-D05-2的連鎖群為LG_D05.2，位置為4.0000cM，2LOD置信區間為GH265-SWU17703-SWU17712，1.51cM，239,195bp；
qVW-D05-3的連鎖群為LG_D05.2，位置為2.0000cM，2LOD置信區間為SWU17713-KASP-Z324-DPL0063，1.01cM，122,962bp；
qVW-A01-1的連鎖群為LG_A01.1，位置為5.2cM，2LOD置信區間為KASP-Z427-KASP-Z005-KASP-Z428，0.51cM，14,954bp。
3.根據權利要求2所述的棉花抗黃萎病主效QTL位點緊密連鎖的KASP引物，其特征在于：KASP-Z367標記的連鎖位置為53.5400cM，物理位置為62,509,658bp，QTL間距為0.2598cM；
KASP-Z407標記的連鎖位置為53.7900cM，物理位置為62,575,437bp，QTL間距為0.0098cM；
KASP-Z324標記的連鎖位置為2.03cM，物理位置為2,434,594bp，QTL間距為0.03cM；
KASP-Z427標記的連鎖位置為4.76cM，物理位置為116,707,120bp，QTL間距為0.44cM；
KASP-Z005標記的連鎖位置為5.27cM，物理位置為116,722,074bp，QTL間距為0.07cM；
KASP-Z428標記的連鎖位置為5.27cM，物理位置為116,718,068bp，QTL間距為0.07cM。
4.權利要求1-3任一所述的棉花抗黃萎病主效QTL位點緊密連鎖的KASP引物的應用，其特征在于：進行單個抗黃萎病主效QTL的分子標記輔助篩選，篩選抗病純合等位基因型的材料和感病純合等位基因型的材料。
5.權利要求1-3任一所述的棉花抗黃萎病主效QTL位點緊密連鎖的KASP引物的應用，其特征在于：進行多個抗黃萎病主效QTL的分子聚合篩選，篩選聚合多個抗黃萎病主效QTL位點的材料。
6.權利要求1-3任一所述的棉花抗黃萎病主效QTL位點緊密連鎖的KASP引物的應用，其特征在于：對感黃萎病的棉花品種進行抗黃萎病性狀的快速分子改良。
7.權利要求1-3任一所述的棉花抗黃萎病主效QTL位點緊密連鎖的KASP引物的應用，其特征在于：篩選得到含有抗黃萎病QTL的抗病自交系RIL-2、RIL-5、RIL-8、RIL-10、RIL-12、RIL-13、RIL-14、RIL-19、RIL-31、RIL-32、RIL-68、RIL-69、RIL-78、RIL-82、RIL-89、RIL-90、RIL-92、RIL-96、RIL-97、RIL-109、RIL-114、RIL-125、RIL-131、RIL-132、RIL-143、RIL-133、RIL-150、RIL-218。
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