[發(fā)明專利]農(nóng)作物育種材料來源系譜追溯方法及裝置有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202210407868.8 | 申請日: | 2022-04-19 |
| 公開(公告)號: | CN114512177B | 公開(公告)日: | 2022-07-22 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 趙向宇;王開義;劉忠強;韓焱云 | 申請(專利權(quán))人: | 北京市農(nóng)林科學(xué)院信息技術(shù)研究中心 |
| 主分類號: | G16B10/00 | 分類號: | G16B10/00;G16B25/10;G16B50/00 |
| 代理公司: | 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002 | 代理人: | 郭亮 |
| 地址: | 100097 北京市海淀區(qū)*** | 國省代碼: | 北京;11 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 農(nóng)作物 育種 材料 來源 系譜 追溯 方法 裝置 | ||
1.一種農(nóng)作物育種材料來源系譜追溯方法,其特征在于,包括:
獲取育種材料數(shù)據(jù)集,所述育種材料數(shù)據(jù)集記錄所有育種材料的遺傳關(guān)系;所述育種材料數(shù)據(jù)集,包括:育種材料標(biāo)識、育種材料對應(yīng)的母本材料標(biāo)識和父本材料標(biāo)識;
根據(jù)育種材料數(shù)據(jù)集中各育種材料的母本材料或父本材料已知或未知的情況,分別篩選子集,并相應(yīng)更新各子集的育種材料來源父本和來源母本信息;
根據(jù)目標(biāo)育種材料,遞歸查找每個材料的來源父母本信息,構(gòu)建來源系譜樹;
所述根據(jù)育種材料數(shù)據(jù)集中各育種材料的母本材料或父本材料已知或未知的情況,分別篩選子集,并相應(yīng)更新各子集的育種材料來源父本和來源母本信息,包括:
以母本、父本材料標(biāo)識都不為空為條件,篩選育種材料數(shù)據(jù)集M中的育種材料加入材料子集A中,并更新材料子集A中所有材料的來源父母本信息為各自材料的父母本;
以母本材料標(biāo)識為空作為條件,篩選育種材料數(shù)據(jù)集中的未知來源育種材料,并加入材料子集U;
以父本材料標(biāo)識為空,母本材料標(biāo)識為U中的材料作為條件,篩選材料子集M-A-U中的材料加入材料子集B中,并更新材料子集B中的所有材料來源母本信息為各材料的母本;
以父本材料標(biāo)識為空,母本材料的來源母本非空作為條件,篩選材料子集C中的材料加入材料子集C’中,并更新材料子集C’中的所有材料的來源父母本信息為各材料母本的來源父母本;其中,材料子集C根據(jù)M-A-U-B得到;
將材料子集C’中的材料從材料子集C中移出,更新材料子集C;
若更新后的材料子集C為空集則結(jié)束,否則重復(fù)上述以父本材料標(biāo)識為空,母本材料來源母本非空作為條件,篩選材料子集C中的材料加入材料子集C’中,并更新材料子集C的過程;
所述根據(jù)育種材料數(shù)據(jù)集中各育種材料的母本材料或父本材料已知或未知的情況,分別篩選子集之前,還包括:
根據(jù)育種材料數(shù)據(jù)集M篩選親本材料集合中存在但后代材料集合中不存在的材料,構(gòu)成材料集合Q,并將Q以M相同的數(shù)據(jù)形式對M進(jìn)行擴充;其中,各育種材料構(gòu)成后代材料集合O,父本母本材料構(gòu)成親本材料集合P。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的農(nóng)作物育種材料來源系譜追溯方法,其特征在于,所述獲取育種材料數(shù)據(jù)集,包括:
根據(jù)育種材料標(biāo)識、育種材料對應(yīng)的母本材料標(biāo)識和父本材料標(biāo)識,構(gòu)建三元數(shù)據(jù)形式數(shù)據(jù)集;
其中,自交材料只記錄母本材料標(biāo)識,父本材料標(biāo)識為空;未知來源材料的母本材料和父本材料標(biāo)識對應(yīng)的數(shù)據(jù)位置為空。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的農(nóng)作物育種材料來源系譜追溯方法,其特征在于,所述根據(jù)目標(biāo)育種材料,遞歸查找材料來源父母本信息,構(gòu)建來源系譜樹,包括:
將目標(biāo)材料作為根節(jié)點,初始化來源系譜樹,將根節(jié)點加入待擴展節(jié)點集合;
從所述待擴展節(jié)點集合中取任意節(jié)點作為當(dāng)前節(jié)點,查詢當(dāng)前節(jié)點的來源母本和來源父本信息,并將對應(yīng)信息標(biāo)注于來源系譜樹中;
將當(dāng)前節(jié)點的來源母本和來源父本加入待擴展節(jié)點集合中,將當(dāng)前節(jié)點從待擴展節(jié)點集合中移除;其中,若來源母本或來源父本信息為空,則跳過;
若待擴展節(jié)點集合為空集則結(jié)束,否則重復(fù)上述從所述待擴展節(jié)點集合中取任意節(jié)點作為當(dāng)前節(jié)點,直至將所有節(jié)點從待擴展節(jié)點集合中移除的過程。
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