[發明專利]與海洋球石藻病毒感染評估有關的microRNA標志物及其應用

在審

• 申請號: 202210358127.5
• 申請日: 2022-04-06
• 公開（公告）號: CN114672582A
• 公開（公告）日: 2022-06-28
• 發明（設計）人: 劉靜雯;張恩權;魏澤華;李桂玲;李健
• 申請（專利權）人: 集美大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/70;C12N15/11;C12R1/94
• 代理公司: 廈門創象知識產權代理有限公司 35232
• 代理人: 王鳳玲;尤懷成

本發明提供了一種與海洋球石藻病毒感染評估有關的microRNA標志物及其應用，該microRNA標志物包括ehx?miR20?5p、ehv?miR1?3p、ehv?miR2?3p、ehv?miR3?3p、ehv?miR4?3p、ehv?miR5?3p、ehv?miR6?5p、ehv?miR7?5p中的一種或幾種，這些標志物可以特異性地表征病毒感染的整個過程，對球石藻赤潮預警以及評估自然海域中該藻病毒的感染活性具有潛在的應用價值。

技術領域

本發明涉及與海洋球石藻病毒感染評估有關的microRNA標志物及其應用。

背景技術

海洋球石藻是一種全球廣泛分布且具有重要生態功能的真核微型浮游植物，其中球石藻Emilinia huxleyi(Eh)具有形成“球石?！焙透弋a二甲基硫化物(DMSP)的能力，且幾乎每年都在大洋，尤其是高緯度海域中形成大面積赤潮，該藻形成的赤潮的迅速大規模消亡被證實是特異性病毒(E.huxleyi virus,EhVs)感染和裂解所致。EhVs是一種大型核質雙鏈DNA病毒，屬于球石藻病毒屬(Coccolithoviruses)。該病毒與宿主之間具有高度的特異性，即只感染E.huxleyi，且病毒在感染過程中存在屬內競爭。上述特征對浮游植物多樣性和種群結構具有很大影響，改變著我們對浮游植物種群動力學過程的認識。因此，EhV-Eh的互作過程是影響海洋碳、硫生物地化循環及全球氣候變化的重要環節，并在重塑海洋生物群落結構、地質演變中具有重要地位。

另外，在E.huxleyi的生命周期中，特別是被病毒感染條件下能夠大量產生一種“粘性”膠質物質，即透明聚合物顆粒(Transparent exopolymer particles,TEP)。TEP與其他一些胞外聚合物是海底“海雪”的重要組成部分。球石藻病毒感染早期，聚合物中約75％是被感染的宿主藻細胞、感染中期和晚期包含的感染細胞則分別為50％和0％，這些被病毒感染的細胞富集的聚集物可以捕獲新產生的病毒粒子，將它們輸出到真光層以外，并在赤潮期間阻止病毒的進一步傳播，病毒-球石藻-TEP釋放增加這一耦合過程促進了向下的碳通量增加，從而促進了碳沉降和生物泵的效率。可見球石藻病毒的感染活性、感染狀態及其感染規模在評估E.huxleyi-EhV體系對生物泵(BP)和微型生物碳泵(MCP)效率的貢獻中具有重要意義。

miRNA與其作用的靶基因是響應生物和非生物環境脅迫的重要調控因子。miRNA作為關鍵因子在復雜的病毒-宿主互作網絡中調控病毒的復制、免疫逃逸及宿主抗病毒等過程。特別是作為一種小的非編碼RNA，其檢測方法準確簡單，目前已成為哺乳動物病毒感染診斷及治療的新手段。然而，對于miRNA在海洋浮游植物生物及非生物脅迫中的作用了解較少。

發明內容

本發明旨在至少在一定程度上解決上述技術中的技術問題之一。

為此，在本發明的第一個方面中，本發明提出了一種與海洋球石藻病毒感染評估有關的microRNA標志物，包括ehx-miR20-5p、ehv-miR1-3p、ehv-miR2-3p、ehv-miR3-3p、ehv-miR4-3p、ehv-miR5-3p、ehv-miR6-5p、ehv-miR7-5p中的一種或幾種；ehx-miR20-5p的核苷酸入列如SEQ ID NO：1所示，ehv-miR1-3p的核苷酸入列如SEQ ID NO：2所示，ehv-miR2-3p的核苷酸入列如SEQ ID NO：3所示，ehv-miR3-3p的核苷酸入列如SEQ ID NO：4所示，ehv-miR4-3p的核苷酸入列如SEQ ID NO：5所示，ehv-miR5-3p的核苷酸入列如SEQ IDNO：6所示，ehv-miR6-5p的核苷酸入列如SEQ ID NO：7所示，ehv-miR7-5p的核苷酸入列如SEQ ID NO：8所示。

根據本發明的實施例的一種與海洋球石藻病毒感染評估有關的microRNA標志物，宿主基因組編碼的ehx-miR20-5p和7條病毒基因組編碼的miRNAs可以特異性地表征病毒感染的整個過程(即感染早期、中期和晚期)，這些miRNA作為響應病毒感染的標志物，在評估自然海域球石藻病毒的感染活性中具有潛在的應用價值。