[發明專利]與海雀稗耐黑痣病性狀相關的SNP分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202210337633.6
• 申請日: 2022-04-01
• 公開（公告）號: CN114540537B
• 公開（公告）日: 2023-04-14
• 發明（設計）人: 廖麗;郝江珊;胡旭;唐敏強;王志勇
• 申請（專利權）人: 海南大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04
• 代理公司: 武漢智嘉聯合知識產權代理事務所(普通合伙) 42231
• 代理人: 姜婷

1.一種與海雀稗耐黑痣病性狀相關的SNP分子標記，其特征在于，所述SNP分子標記的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示，其中，SEQ?ID?NO.1所示序列自5’端起第401位堿基為SNP位點，所述SNP位點為G或T。

2.可識別權利要求1所述SNP分子標記的分子探針。

3.一種用于擴增權利要求1所述SNP分子標記的引物，其特征在于，所述SNP分子標記的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示，且SEQ?ID?NO.1所示序列自5’端起第401位堿基為SNP位點，所述SNP位點為G或T。

4.根據權利要求3所述的引物，其特征在于，所述引物序列如SEQ?ID?NO.2和SEQ?IDNO.3所示。

5.一種鑒定海雀稗黑痣病抗性的方法，其特征在于，包括以下步驟：

S1.提取待測海雀稗材料的基因組DNA；

S2.以S1提取得到的基因組DNA為模板，采用權利要求1所述SNP分子標記的特異性引物進行PCR擴增后測序，或者直接以基因組DNA進行重測序，以獲得包含SEQ?ID?NO.1所示序列的目標片段，并確定待測海雀稗材料在SEQ?ID?NO.1所示序列自5’端起第401位的堿基類型為GG、GT或TT。

6.根據權利要求5所述鑒定海雀稗黑痣病抗性的方法，其特征在于，所述待測海雀稗材料耐黑痣病能力大小與其SNP位點堿基類型的關系為GG﹥GT﹥TT。

7.根據權利要求5所述鑒定海雀稗黑痣病抗性的方法，其特征在于，步驟S2所述擴增的反應體系為：共10μL，50ng/μL模板DNA?1μL，2×PCR?Master?Mix?5μL，10μmol/L正反向引物各0.5μL，ddH₂O余量。

8.一種用于海雀稗黑痣病抗性檢測的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包括權利要求3或4所述引物。

9.權利要求1所述SNP分子標記在海雀稗抗黑痣病分子標記輔助育種中的應用。