[發(fā)明專利]微生物信息的解讀方法及裝置、設(shè)備及存儲介質(zhì)

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202210315360.5
• 申請日: 2022-03-28
• 公開（公告）號: CN114783525A
• 公開（公告）日: 2022-07-22
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 卓超;王艷;梁小丹;李映華;吳楠;朱翰偉;梁碧嬋;張逸喬;張楠;陳思彤
• 申請（專利權(quán)）人: 廣州金域醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中心有限公司;成都培華生物科技有限公司
• 主分類號: G16B40/20
• 分類號: G16B40/20;G06K9/62
• 代理公司: 深圳中細(xì)軟知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 44528
• 代理人: 袁文英

本發(fā)明實(shí)施例公開了一種微生物信息的解讀方法及裝置、設(shè)備及存儲介質(zhì)，該方法包括：獲取用戶在客戶端輸入的微生物信息以及標(biāo)本信息；利用預(yù)設(shè)的邏輯分類樹、微生物信息以及標(biāo)本信息，確定微生物信息中的微生物分類信息；若微生物分類信息包括可能致病菌，則根據(jù)可能致病菌對應(yīng)的目標(biāo)微生物確定邏輯分類樹中與目標(biāo)微生物對應(yīng)的待詢問問題，并將待詢問問題返回至客戶端；根據(jù)回答以及邏輯分類樹對目標(biāo)微生物進(jìn)行微生物分類，確定目標(biāo)微生物的目標(biāo)分類信息；根據(jù)微生物分類信息以及目標(biāo)分類信息，確定微生物信息中的各個微生物對應(yīng)的微生物分類結(jié)果，并將微生物分類結(jié)果返回至客戶端。通過上述方法，可以提高對于微生物分類的準(zhǔn)確度。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及微生物檢驗(yàn)技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種微生物信息的解讀方法及裝置、設(shè)備及存儲介質(zhì)。

背景技術(shù)

利用高通量基因測序技術(shù)，對疑難重癥的感染患者的各種標(biāo)本中的全部微生物進(jìn)行DNA和/或RNA測序，通過微生物專用數(shù)據(jù)庫比對和智能化算法分析，從而得到微生物的種屬信息，指導(dǎo)臨床更有針對性的開展治療，有助于實(shí)現(xiàn)感染性疾病的精準(zhǔn)治療。

以宏基因組檢測(mNGS)為例，從mNGS的技術(shù)原理上講，生信技術(shù)上的數(shù)據(jù)過濾以及各類數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建在大多數(shù)情況下無法解決多種病原體同時檢測的問題，也就是說無法區(qū)別出檢測報(bào)告單中的真正致病菌。

目前mNGS報(bào)告單解讀準(zhǔn)確度仍更多取決于醫(yī)生經(jīng)驗(yàn)、且耗時長，臨床醫(yī)生尤其是基層醫(yī)生結(jié)合宏基因檢測報(bào)告及必要臨床信息的綜合解讀能力不足。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的主要目的在于提供一種微生物信息的解讀方法及裝置、設(shè)備及存儲介質(zhì)，可以解決現(xiàn)有技術(shù)中的醫(yī)生對微生物的解讀能力不足的問題。

為實(shí)現(xiàn)上述目的，本發(fā)明第一方面提供一種微生物信息的解讀方法，所述方法包括：

獲取用戶在客戶端輸入的微生物信息以及標(biāo)本信息；

利用預(yù)設(shè)的邏輯分類樹、所述微生物信息以及標(biāo)本信息，確定所述微生物信息中的微生物分類信息，所述微生物分類信息包括微生物信息中的各個微生物與微生物類別的對應(yīng)關(guān)系，所述微生物類別包括致病菌、可能致病菌或背景菌，所述邏輯分類樹包括若干基于專家知識及臨床經(jīng)驗(yàn)構(gòu)建的分類規(guī)則；

若所述微生物分類信息包括可能致病菌，則根據(jù)所述可能致病菌對應(yīng)的目標(biāo)微生物確定所述邏輯分類樹中與所述目標(biāo)微生物對應(yīng)的待詢問問題，并將所述待詢問問題返回至所述客戶端；

接收所述客戶端返回的所述用戶基于所述待詢問問題作出的回答，并根據(jù)所述回答以及所述邏輯分類樹對所述目標(biāo)微生物進(jìn)行微生物分類，確定所述目標(biāo)微生物的目標(biāo)分類信息；

根據(jù)所述微生物分類信息以及目標(biāo)分類信息，確定所述微生物信息中的各個微生物對應(yīng)的微生物分類結(jié)果，并將所述微生物分類結(jié)果返回至所述客戶端。

在一種可行實(shí)現(xiàn)方式中，所述待詢問問題至少包括檢驗(yàn)報(bào)告信息，則所述根據(jù)所述回答以及所述邏輯分類樹對所述目標(biāo)微生物進(jìn)行微生物分類，確定所述目標(biāo)微生物的目標(biāo)分類信息，包括：

對所述回答進(jìn)行語義分析，提取所述回答中與所述目標(biāo)微生物對應(yīng)的目標(biāo)檢驗(yàn)報(bào)告信息，所述目標(biāo)檢出信息包括特異序列數(shù)、相對豐度及覆蓋度中一種或幾種；

根據(jù)所述目標(biāo)檢驗(yàn)報(bào)告信息以及所述邏輯分類樹對所述目標(biāo)微生物進(jìn)行微生物分類，確定所述目標(biāo)微生物的目標(biāo)分類信息。

在一種可行實(shí)現(xiàn)方式中，所述待詢問問題至少包括臨床檢查信息，則所述根據(jù)所述回答以及所述邏輯分類樹對所述目標(biāo)微生物進(jìn)行微生物分類，確定所述目標(biāo)微生物的目標(biāo)分類信息，包括：

對所述回答進(jìn)行語義分析，提取所述回答中的目標(biāo)臨床檢查信息，所述目標(biāo)臨床檢查信息至少包括臨床體檢項(xiàng)目、儀器體檢項(xiàng)目或?qū)嶒?yàn)室體檢項(xiàng)目中的一種或多種的檢查信息；