[發明專利]一種與母豬繁殖性狀有關的分子標記及篩選方法和應用

有效

• 申請號: 202210235823.7
• 申請日: 2022-03-11
• 公開（公告）號: CN114292928B
• 公開（公告）日: 2022-06-03
• 發明（設計）人: 趙云翔;張瑞琪;馬姝;高廣雄;李智麗;周玉;孫艷梅;何健
• 申請（專利權）人: 佛山科學技術學院
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 廣州新諾專利商標事務所有限公司 44100
• 代理人: 許英偉

本發明涉及一種與母豬繁殖性狀有關的分子標記及篩選方法和應用，涉及豬遺傳基因技術領域。該分子標記為SNP分子標記，位于豬1號染色體96673697bp位置或豬10號染色體58587289bp位置，豬參考基因組為Sscrofa11.1；豬1號染色體96673697bp位置為CT突變的突變位點，豬10號染色體58587289bp位置為CT突變的突變位點。該分子標記不同基因型母豬的繁殖性狀有極顯著的差異，根據該分子標記選留母豬，能夠留用產仔總數和活仔總數高的母豬，有利于改善母豬的繁殖性狀，提高母豬的產仔性能。

技術領域

本發明涉及豬遺傳基因技術領域，特別是涉及一種與母豬繁殖性狀有關的分子標記及篩選方法和應用。

背景技術

我國養豬歷史悠久，而養豬的終端產品主要是豬肉，是日常生活中最常見的肉制品，產量位于肉制品之首。在實際育種工作中，產總仔數和產活仔數是評定母豬生產最重要的指標，同時也是母豬重要的繁殖性狀和經濟性狀之一，直接影響豬場的經濟效益。影響母豬繁殖性能的因素有品種、年齡、環境、飼養管理、激素水平、營養和遺傳，其中遺傳是主要因素，規模化豬場要挑選出繁殖性能較高的優良品種進行繁育。

豬的繁殖性狀是由多基因控制，使用傳統的QTL定位法具有適合稀有基因的研究并且群體可控制，目的性和結果預期性強的特點，但其檢測到的QTL個數有限，只涉及到分離群體中雙親存在差異的位點，而且無法檢測到復等位基因和定位分辨率低。這種方法的較適合用于檢測重組事件少的人為雜交構建的群體中。

如何提高母豬窩均產仔數及產仔活數，充分發揮母豬的生產性能，增加養殖場經濟效益，成為了養豬生產中的重點。

發明內容

針對上述問題，本發明提供一種與母豬繁殖性狀有關的分子標記，該分子標記不同基因型母豬的繁殖性狀有極顯著的差異，根據該分子標記選留母豬，能夠留用產仔總數和活仔總數高的母豬，有利于改善母豬的繁殖性狀，提高母豬的產仔性能。

為了達到上述目的，本發明提供一種與母豬繁殖性狀有關的分子標記，該分子標記為SNP分子標記，所述SNP分子標記位于豬1號染色體96673697bp位置或豬10號染色體58587289bp位置，豬參考基因組為Sscrofa11.1；所述豬1號染色體96673697bp位置為CT突變的突變位點，所述豬10號染色體58587289bp位置為CT突變的突變位點。

本發明人通過對兩個品種母豬（長白豬和大白豬）混合的純種豬產仔均勻度進行全基因組關聯分析，成功篩選出影響母豬繁殖性狀的遺傳分子標記ASGA0100031和WU_10.2_10_64348824；上述遺傳分子標記ASGA0100031位于豬1號染色體96673697bp位置，而豬1號染色體96673697bp位置為CT突變的突變位點；上述遺傳分子標記WU_10.2_10_64348824位于豬10號染色體58587289bp位置，而豬10號染色體58587289bp位置為CT突變的突變位點，上述分子標記的不同基因型母豬的繁殖性狀有極顯著差異。

即本發明公開了一種用于評估母豬繁殖性狀的分子標記，可根據該分子標記評估母豬的繁殖性狀，并根據評估結果留用產仔總數和活仔總數高的母豬，提高母豬的產仔性能。

本發明還公開了一種用于評價母豬繁殖性狀的分子標記序列，該分子標記序列為所述突變位點的上下游100±20bp序列。

在其中一個實施例中，所述分子標記序列如下所示：

5’-TCCCCACTTCTGTAAAATGAGTAACAGCTATACTACATTGGGCTACTGTGATGATTAAATACAAGTCTTTCAGAACCAAAAAGCTTCAGGTACAGATCTG（SEQ ID NO:1）-E-ACCCCACTGTCACTGGTAGGGTTGTCTCTGAGTGGACACTTGCACGTGATGTTCTTTGAGATTTCTCAAAGGCAGGTATGAACTTATTTACAAGAACCAA -3’ （SEQ ID NO:2），其中E為突變位點；