[發(fā)明專(zhuān)利]一種位于SREBF2基因的與番鴨性早熟性狀相關(guān)的SNP分子標(biāo)記及應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202210225015.2
• 申請(qǐng)日: 2022-03-07
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN114369670B
• 公開(kāi)（公告）日: 2022-09-09
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 聶慶華;張思雨;徐海平;郭利金;吳瑞權(quán)
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/6888
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京東方盛凡知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11562
• 代理人: 許佳

本發(fā)明公開(kāi)了一種位于SREBF2基因的與番鴨性早熟性狀相關(guān)的SNP分子標(biāo)記及應(yīng)用，涉及生物技術(shù)領(lǐng)域；所述分子標(biāo)記為SNP1、SNP2、SNP3和SNP4；所述SNP1位于SEQIDNO:1所示序列的68bp，堿基為C或T；所述SNP2位于SEQIDNO:1所示序列的409bp，堿基為T(mén)或C；所述SNP3位于SEQIDNO:1所示序列的415bp，堿基為G或A；所述SNP4位于SEQIDNO:1所示序列的636bp，堿基為G或A。本發(fā)明發(fā)現(xiàn)了SREBF2基因的4個(gè)SNP位點(diǎn)，并將其與番鴨性早熟性狀關(guān)聯(lián)分析，為分子標(biāo)記輔助選擇提供新的SNP分子標(biāo)記。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，特別是涉及一種位于SREBF2基因的與番鴨性早熟性狀相關(guān)的SNP分子標(biāo)記及應(yīng)用。

背景技術(shù)

繁殖性能與番鴨的飼養(yǎng)成本息息相關(guān)，番鴨產(chǎn)蛋量越高，意味著飼養(yǎng)成本更低，能夠帶來(lái)更高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。同時(shí)番鴨蛋也是非常好的蛋白質(zhì)商品，番鴨蛋富含鈣、鋅和鐵，更適合用于烘焙。開(kāi)產(chǎn)日齡、產(chǎn)蛋量、蛋重和受精率等是番鴨繁殖性能的關(guān)鍵指標(biāo)，繁殖性狀作為復(fù)雜的微效多基因控制的數(shù)量遺傳性狀，不僅受到許多基因的調(diào)控，還受到飼養(yǎng)條件等環(huán)境因素的影響。多個(gè)繁殖性能指標(biāo)中，開(kāi)產(chǎn)日齡的遺傳力較高，規(guī)模化養(yǎng)殖能夠很好的控制飼養(yǎng)環(huán)境以便符合番鴨的生理需求，從基因上進(jìn)行改良能夠帶來(lái)更好的效果。開(kāi)產(chǎn)日齡早代表著性早熟，性早熟個(gè)體在飼養(yǎng)周期內(nèi)更早的進(jìn)入產(chǎn)蛋高峰，產(chǎn)蛋周期內(nèi)產(chǎn)生更多的種蛋，帶來(lái)更高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。而開(kāi)產(chǎn)日齡晚則意味著性晚熟，會(huì)導(dǎo)致受精率降低，產(chǎn)蛋高峰持續(xù)時(shí)間短，較早的進(jìn)入衰退期，不利于產(chǎn)蛋周期內(nèi)種蛋的獲取。因此在育種過(guò)程中，根據(jù)開(kāi)產(chǎn)日齡進(jìn)行選擇有利于提高番鴨的繁殖性能。

單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms，SNP)是指基因組水平上由于隨機(jī)的某個(gè)單核苷酸的變異引起的DNA序列的多態(tài)性，廣泛存在于動(dòng)植物基因組中?；蛲怙@子和內(nèi)含子的SNP可能會(huì)影響基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控，轉(zhuǎn)錄本剪接，蛋白質(zhì)翻譯和剪輯修飾等，從而影響基因的表達(dá)效率，進(jìn)而對(duì)表觀性狀產(chǎn)生影響。因此SNP定位表型性狀后，可作為分子標(biāo)記用于分子標(biāo)記輔助育種選擇。

目前可用于番鴨育種選擇，尤其是對(duì)于繁殖性狀育種選擇的分子標(biāo)記較少，大大限制了番鴨繁殖性能的育種進(jìn)展。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供一種位于SREBF2基因的與番鴨性早熟性狀相關(guān)的SNP分子標(biāo)記及應(yīng)用，以解決上述現(xiàn)有技術(shù)存在的問(wèn)題，本發(fā)明發(fā)現(xiàn)了SREBF2基因的4個(gè)SNP位點(diǎn)，并將其與番鴨性早熟性狀關(guān)聯(lián)分析，為分子標(biāo)記輔助選擇提供新的SNP分子標(biāo)記。

為實(shí)現(xiàn)上述目的，本發(fā)明提供了如下方案：

本發(fā)明提供一種與番鴨性早熟性狀相關(guān)的SNP分子標(biāo)記，所述分子標(biāo)記為SNP1、SNP2、SNP3和SNP4；所述SNP1位于SEQ ID NO:1所示序列的68bp，堿基為C或T；所述SNP2位于SEQ ID NO:1所示序列的409bp，堿基為T(mén)或C；所述SNP3位于SEQ ID NO:1所示序列的415bp，堿基為G或A；所述SNP4位于SEQ ID NO:1所示序列的636bp，堿基為G或A。

進(jìn)一步地，所述SNP1的基因型為CC、TT或CT；所述SNP2的基因型為T(mén)T、CC或TC；所述SNP3的基因型為GG、AA或GA；所述SNP4的基因型為GG、AA或GA。

本發(fā)明還提供一種利用的SNP分子標(biāo)記鑒別番鴨性早熟性狀的方法，其特征在于，包括以下步驟：

(1)提取待測(cè)番鴨基因組DNA，進(jìn)行PCR擴(kuò)增，獲得核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的擴(kuò)增產(chǎn)物；

(2)對(duì)所述擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序；

(3)上述的SNP1、SNP2、SNP3和SNP4組成單倍型塊，當(dāng)所述單倍型塊的基因型為AATT/AATT，則番鴨開(kāi)產(chǎn)日齡早。

進(jìn)一步地，在步驟(1)中，所述PCR擴(kuò)增的引物對(duì)序列為SEQ ID NO:2-3所示序列。