[發明專利]一種凡納濱對蝦高繁殖力的分子標記X1W1及其應用

有效

• 申請號: 202210202367.6
• 申請日: 2022-03-02
• 公開（公告）號: CN114592068B
• 公開（公告）日: 2023-05-02
• 發明（設計）人: 隋娟;欒生;孔杰;代平;孟憲紅;羅坤;曹家旺;譚建;陳寶龍
• 申請（專利權）人: 中國水產科學研究院黃海水產研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 青島合創知識產權代理事務所(普通合伙) 37264
• 代理人: 王曉曉

本發明提供了一種凡納濱對蝦高繁殖力的分子標記X1W1及其應用。所述分子標記X1W1的核苷酸序列如SEQ?ID?No.1所示，其中第300位堿基T在凡納濱對蝦群體中的等位基因頻率≥51.67%。本發明還提供了所述的分子標記X1W1的引物，包括核苷酸序列如SEQ?ID?No.2和SEQ?ID?No.3所示的擴增引物以及核苷酸序列如SEQ?ID?No.4所示的延伸引物。凡納濱對蝦高繁殖力分子標記X1W1可以不受生長階段的限制，能夠用于凡納濱對蝦早期選育，快速選育出繁殖性狀優良的親本群體，促進凡納濱對蝦高繁殖力新品種的選育進程。

技術領域

本發明屬于水產動物分子標記輔助育種領域，具體涉及一種凡納濱對蝦高繁殖力的分子標記X1W1及其應用。

背景技術

凡納濱對蝦(Penaeus?vannamei)又稱南美白對蝦、太平洋白蝦，隸屬于節肢動物門(Arthropoda)、甲殼綱(Crustaeea)、十足目(Deeapoda)、對蝦科(Penaeidae)、對蝦屬(Penaeus)，是我國和世界養殖產量最高的對蝦種類，也是單一產值最高的水產養殖種類之一。2020年我國養殖產量超過180萬噸，產值超過700億元，約占世界總產量的40％。我國每年種蝦需求量超過100萬對，苗種需求量超過1.5萬億尾。凡納濱對蝦具有產卵量高，可多次產卵的特性。然而在苗種生產中，雌蝦的繁殖能力存在巨大個體差異。在一個生產周期中，部分雌蝦從未產卵，而有的雌蝦能夠多次產卵。培育高繁殖力(產卵和產卵量)新品種，對于提高育苗效率，節省生產成本具有重要意義。繁殖性狀屬中低遺傳力性狀，傳統的育種方法進展緩慢，借助分子標記輔助育種技術可有效加快選育進程。

作為第三代分子標記，單核苷酸多態性標記(SNP)具有豐富度高、密度大、穩定性強、共顯性等特點，成為目前蝦、蟹等經濟甲殼動物中應用最廣泛的分子標記技術。目前，有關凡納濱對蝦繁殖相關SNP標記的開發較少，并且產業中缺乏可應用于分子標記輔助育種的標記。因此，開發高繁殖力的分子標記對凡納濱對蝦的新品種培育具有重要意義。

發明內容

本發明提供了一種凡納濱對蝦高繁殖力的分子標記X1W1及其應用。分子標記X1W1能夠用于凡納濱對蝦高繁殖力群體的篩選中，其鑒定效率及準確率高。

為實現上述發明目的，本發明采用以下技術方案予以實現：

本發明提供了一種凡納濱對蝦高繁殖力的分子標記X1W1，所述分子標記X1W1的核苷酸序列如SEQ?ID?No.1所示。

進一步的，所述分子標記X1W1的第300位堿基T為候選X1W1_SNP位點。

進一步的，所述堿基T在凡納濱對蝦高繁殖力群體中的等位基因頻率51％。優選的，所述堿基T在凡納濱對蝦高繁殖力群體中的等位基因頻率≥51.67％。

本發明還提供了所述的分子標記X1W1的引物，所述引物包括核苷酸序列如SEQ?IDNo.2和SEQ?ID?No.3所示的擴增引物以及核苷酸序列如SEQ?ID?No.4所示的延伸引物。

本發明還提供了所述的分子標記X1W1或者所述的分子標記X1W1的引物在用于篩選具有高繁殖力的凡納濱對蝦群體中的應用。

進一步的，篩選具有高繁殖力的凡納濱對蝦群體的具體步驟為：提取凡納濱對蝦群體內(家系、品系或地理群體)測試樣品的DNA，并將其作為模板，利用所述引物進行飛行質譜分型，若分型結果中分子標記的第300位堿基T的等位基因頻率≥51.67％，則選擇該凡納濱對蝦群體作為培育凡納濱對蝦高繁殖力的親本。

進一步的，所述凡納濱對蝦家系或群體測試樣品的數量在30尾以上。

進一步的，在飛行質譜分型中，PCR擴增的條件為預變性94℃3min；變性94℃30s，退火56℃25s，延伸72℃30s，共重復40個循環；最后延伸72℃4min；4℃保存。