[發(fā)明專利]一種基于深度學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)圖像三維自動(dòng)分割方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202210189197.2 | 申請日: | 2022-02-28 |
| 公開(公告)號: | CN114549805A | 公開(公告)日: | 2022-05-27 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 李晉國;孟平;李祎;孫哲;溫蜜;王亮亮;張凱 | 申請(專利權(quán))人: | 上海電力大學(xué) |
| 主分類號: | G06T19/20 | 分類號: | G06T19/20;G06T15/30;G06T7/11;G06T7/00;G06N3/04;G06K9/62;G06V10/774;G06V10/82 |
| 代理公司: | 上海德昭知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31204 | 代理人: | 陳龍梅 |
| 地址: | 201306 上*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 深度 學(xué)習(xí) 醫(yī)學(xué) 圖像 三維 自動(dòng) 分割 方法 | ||
1.一種基于深度學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)圖像三維自動(dòng)分割方法,其特征在于,包括以下步驟:
步驟1,對于待實(shí)現(xiàn)自動(dòng)分割的病灶或器官的病例,采集臨床影像數(shù)據(jù),并對所述影像數(shù)據(jù)進(jìn)行脫敏及規(guī)范化處理;
步驟2,基于所述影像數(shù)據(jù)構(gòu)建訓(xùn)練集;
步驟3,對所述訓(xùn)練集進(jìn)行預(yù)處理及數(shù)據(jù)增強(qiáng),得到規(guī)范化的數(shù)據(jù);
步驟4,設(shè)置超參數(shù),并將所述規(guī)范化的數(shù)據(jù)輸入到三維全自動(dòng)分割網(wǎng)絡(luò)模型中進(jìn)行訓(xùn)練,得到訓(xùn)練完成的分割模型;
步驟5,采集所述影像數(shù)據(jù)作為測試樣本,經(jīng)所述規(guī)范化處理后輸入訓(xùn)練完成的所述分割模型;
步驟6,由步驟4得到的所述分割模型實(shí)現(xiàn)全自動(dòng)特征提取并輸出的病灶或器官的分割結(jié)果。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于深度學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)圖像三維自動(dòng)分割方法,其特征在于:
其中,步驟1中,所述影像數(shù)據(jù)包括:核磁共振影像MRI數(shù)據(jù)、計(jì)算機(jī)斷層影像CT以及正電子發(fā)射斷層影像PET。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于深度學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)圖像三維自動(dòng)分割方法,其特征在于:
其中,步驟2中,所述訓(xùn)練集真值由專業(yè)放射科醫(yī)師逐層對所需分割目標(biāo)進(jìn)行標(biāo)注,
所述訓(xùn)練集包含脫敏的腫瘤或器官原始影像及對腫瘤或器官的人工標(biāo)注結(jié)果。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于深度學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)圖像三維自動(dòng)分割方法,其特征在于:
其中,步驟3中,所述預(yù)處理包含數(shù)據(jù)歸一化處理以及三維數(shù)據(jù)尺寸縮放,
所述數(shù)據(jù)增強(qiáng)包含三維數(shù)據(jù)隨機(jī)裁剪、隨機(jī)水平翻轉(zhuǎn)以及隨機(jī)旋轉(zhuǎn)。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于深度學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)圖像三維自動(dòng)分割方法,其特征在于:
其中,步驟4中,所述超參數(shù)包括:學(xué)習(xí)率、批樣本數(shù)量、梯度下降法迭代的數(shù)量。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于深度學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)圖像三維自動(dòng)分割方法,其特征在于:
其中,步驟4具體分為以下子步驟:
步驟4-1,輸入的所述規(guī)范化的數(shù)據(jù)首先經(jīng)過一個(gè)具有16個(gè)輸出通道及步長為2的1x1卷積層,用于學(xué)習(xí)所述規(guī)范化的數(shù)據(jù)的原始特征;
步驟4-2,其次經(jīng)過第一密集連接塊,包含12個(gè)密集連接,通道增長率為12;
步驟4-3,再次經(jīng)過一個(gè)過渡層,所述過渡層由BN、ReLU、1x1x1的卷積層和2x2x2的最大池化層組成,同時(shí)采用深監(jiān)督方式加強(qiáng)梯度傳播并穩(wěn)定學(xué)習(xí)過程,以2x2x2的反卷積層將所述過渡層連接到輸出層;
步驟4-4,再次經(jīng)過第二密集連接塊,包含12個(gè)密集連接,通道增長率為12;
步驟4-5,經(jīng)過兩個(gè)上采樣確保分割預(yù)測圖的大小與輸入圖像的大小一致,即經(jīng)過BN、ReLU、1x1x1的卷積層和兩個(gè)2x2x2反卷積。上采樣之后是1x1x1的卷積層和softmax層,以生成分割的最終分割圖。
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