[發(fā)明專利]磁珠輔助的等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)miRNA的方法在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202210181781.3 | 申請(qǐng)日: | 2022-02-25 |
| 公開(公告)號(hào): | CN115820814A | 公開(公告)日: | 2023-03-21 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 黃晉;劉振翔;石慧;王柯敏 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 湖南大學(xué) |
| 主分類號(hào): | C12Q1/6844 | 分類號(hào): | C12Q1/6844 |
| 代理公司: | 湖南兆弘專利事務(wù)所(普通合伙) 43008 | 代理人: | 陳暉 |
| 地址: | 410082 湖*** | 國省代碼: | 湖南;43 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 輔助 等溫 擴(kuò)增 檢測(cè) mirna 方法 | ||
本發(fā)明公開了一種磁珠輔助的等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)miRNA的方法,包括以下步驟:將HP探針偶聯(lián)至鏈霉親和素包被的磁珠表面;將磁珠修飾的HP探針、靶標(biāo)Target、靶標(biāo)miRNA序列混合形成反應(yīng)體系,進(jìn)行等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng);收集修飾的磁珠的熒光信號(hào)。本發(fā)明提供的一種磁珠輔助的等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)miRNA的方法,該方法利用磁珠將待檢測(cè)靶標(biāo)從復(fù)雜環(huán)境中分離,利用等溫?cái)U(kuò)增實(shí)現(xiàn)miRNA的循環(huán),實(shí)現(xiàn)miRNA的放大檢測(cè)。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,尤其涉及一種磁珠輔助的等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)miRNA的方法。
背景技術(shù)
生物標(biāo)志物(Biomarker)是一種生化指標(biāo),它的改變可以表示系統(tǒng)、器官、組織、細(xì)胞和亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的結(jié)構(gòu)或功能的變化或可能產(chǎn)生的變化。對(duì)于生物標(biāo)志物進(jìn)行檢測(cè),可以反映人生理過程的改變,從而對(duì)疾病進(jìn)行早期診斷;可以得出所使用的藥物對(duì)疾病的干預(yù)程度以及在藥物靶點(diǎn)確定等方面進(jìn)行應(yīng)用。生物標(biāo)志的種類較多,常見的生物標(biāo)志物有蛋白質(zhì)、核酸等。
MicroRNA,是一種長度為19~24個(gè)左右核苷酸的小RNA。它可以通過與信使RNA結(jié)合來調(diào)節(jié)特定基因的表達(dá),從而作用于mRNA,抑制其翻譯等。因此,對(duì)生物的生理過程有著重要的影響。研究表明,miRNA的異常表達(dá)與多種癌癥的產(chǎn)生與發(fā)展相關(guān),可用作癌癥的疾病標(biāo)志物,用于癌癥的檢測(cè)與診治。但它們通常以較低的豐度存在于細(xì)胞、外泌體或體液等復(fù)雜樣品中,因此其檢測(cè)面臨著“能否測(cè)得到”和“能否測(cè)得準(zhǔn)”的問題。
因此為了保證復(fù)雜樣品檢測(cè)的順利進(jìn)行,需要將目標(biāo)物與其他干擾組分分離。常見的復(fù)雜生物樣品的分離方式包括磁分離、色譜分離、毛細(xì)管電泳分離等。磁珠中由于具有較高的磁鐵含量,與外部磁場(chǎng)響應(yīng)速度快;可以在磁珠表面進(jìn)行生物修飾從而與多種待測(cè)物結(jié)合以及操作簡單等特點(diǎn),在樣品處理和生物分析檢測(cè)等方面應(yīng)用廣泛。
miRNA的長度極短、含量極低和序列同源性高,在檢測(cè)中提出了巨大的挑戰(zhàn)。傳統(tǒng)的核酸檢測(cè)金標(biāo)準(zhǔn)是定量PCR(qPCR),但它需要復(fù)雜的反應(yīng)程序和特定的儀器。而等溫?cái)U(kuò)增已經(jīng)成為用于miRNA檢測(cè)的一種強(qiáng)大的核酸定量方法,與PCR相比,等溫?cái)U(kuò)增無需精確控制溫度循環(huán)即可進(jìn)行,可以在簡單的條件下快速有效地?cái)U(kuò)增目標(biāo)核酸或識(shí)別信號(hào),提高檢測(cè)靈敏度。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明要解決的技術(shù)問題是針對(duì)miRNA存在豐度低及其他物質(zhì)干擾問題,提供的一種磁珠輔助的等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)miRNA的方法,該方法利用磁珠將待檢測(cè)靶標(biāo)從復(fù)雜環(huán)境中分離,利用等溫?cái)U(kuò)增實(shí)現(xiàn)miRNA的循環(huán),實(shí)現(xiàn)miRNA的放大檢測(cè)。
為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供了一種磁珠輔助的等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)miRNA的方法,包括以下步驟:
S1、將HP探針偶聯(lián)至鏈霉親和素包被的磁珠表面;
S2、將磁珠修飾的HP探針、靶標(biāo)Target、靶標(biāo)miRNA序列混合形成反應(yīng)體系,進(jìn)行等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng);
S3、收集修飾的磁珠的熒光信號(hào)。
上述的方法,進(jìn)一步的,所述HP探針的DNA序列如SEQ ID NO.1所示。
上述的方法,進(jìn)一步的,所述HP探針采用可以與鏈霉親和素包被的磁珠偶聯(lián)的生物素修飾。
上述的方法,進(jìn)一步的,所述HP探針中間修飾有FAM熒光基團(tuán)和BHQ淬滅基團(tuán)。
上述的方法,進(jìn)一步的,所述靶標(biāo)Target序列的DNA序列如SEQ ID NO.2所示。
上述的方法,進(jìn)一步的,所述S2中所述等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)的條件為:
在37℃下分別孵育150~240min。
上述的方法,進(jìn)一步的,所述S3中,收集修飾的磁珠的熒光信號(hào),設(shè)置激發(fā)波長為488nM,收集波長范圍為505~525nm,收集磁珠的熒光信號(hào)。
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