[發(fā)明專利]一種鑒定早生茶樹的SNP位點及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202210127317.6
• 申請日: 2022-02-11
• 公開（公告）號: CN114350847B
• 公開（公告）日: 2023-09-22
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 譚禮強;崔懂;毛潤錦;王留彬
• 申請（專利權(quán)）人: 四川農(nóng)業(yè)大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京正華智誠專利代理事務(wù)所(普通合伙) 11870
• 代理人: 楊浩林

本發(fā)明提出了一種鑒定早生茶樹的SNP位點及其應(yīng)用，涉及分子標記技術(shù)領(lǐng)域。具體而言，第一、第二和第三個SNP位點位于舒茶早參考基因組的第四染色體的第179776419位、第五染色體的第97586343位，第九染色體的第163016524位，三個SNP位點的上下游500bp的DNA序列分別如SEQ?ID?No.1?3所示。通過對三個SNP位點中的一個、兩個或三個進行基因型分析，并根據(jù)基因型結(jié)果對待選育樣本進行篩選，可以不受環(huán)境和生長時期的影響、有效快速的鑒定出早生茶樹資源。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及分子標記技術(shù)領(lǐng)域，具體而言，涉及一種鑒定早生茶樹的SNP位點及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

春季萌芽期是茶樹最重要的經(jīng)濟性狀之一，一般萌芽期更早的茶樹具有更高的栽培價值。選育和推廣早生、優(yōu)質(zhì)茶樹品種一直是我國茶樹育種工作的重要內(nèi)容之一。一般以茶樹品種一芽一葉期的出現(xiàn)時間比當?shù)亍案６Υ蟀撞琛苯咏钠贩N稱為早生茶樹品種；比“福鼎大白茶”早10天以上稱為特早生茶樹品種。

雖然基于田間直接觀測判斷子代的發(fā)芽期較簡單，但從茶樹種子播種到得到較為可靠的發(fā)芽期觀測結(jié)果需要至少4-6年時間，期間幼齡茶園的管理成本較高，且結(jié)果也會顯著受到每年氣候變化的影響。然而現(xiàn)目前針對早生或特早生茶樹的篩選仍存在技術(shù)難題，而導(dǎo)致育種篩選效果有限，且增加管理的金錢成本和時間成本等。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的第一目的在于提供一種鑒定早生茶樹的SNP位點，可通過該SNP位點解決現(xiàn)目前對早生或特早生茶樹的篩選困難的技術(shù)問題。

本發(fā)明的第二目的在于提供一種鑒定早生茶樹的SNP位點的應(yīng)用。

本發(fā)明解決其技術(shù)問題是采用以下技術(shù)方案來實現(xiàn)的。

一方面，本申請?zhí)峁┝艘环N鑒定早生茶樹的SNP位點，包括第一SNP位點，第一SNP位點位于舒茶早參考基因組(下載地址：hTTp://tpdb.shengxin.ren/，基因組文件名稱：CSS_ChrLev_20200506_Genome.fas.gz)的第四染色體的第179776419位，該位點的核苷酸堿基為A或G。提取待選育樣本的基因組DNA，采用包括PCR擴增和直接測序的方法獲得第一、第二、第三SNP位點的基因型信息，并用于早生型茶樹品種篩選。篩選第一SNP位點基因型為GG、第二SNP位點基因型為CT和/或第三SNP位點基因型為CT的樣本。

可通過對樣本DNA基因組進行擴增后，以篩選出其SNP基因型信息，根據(jù)其SNP基因型信息進行比對，當該第一SNP位點的基因型符合早生茶樹或特早生茶樹的標準后，對其進行篩選，篩選出樣本中含有符合早生茶樹或特早生茶樹標準的位點樣本，從而得到早生茶樹或特早生茶樹種質(zhì)。

另一方面，本申請還提供了一種鑒定早生茶樹的SNP位點在鑒定早生或特早生茶樹種質(zhì)中的應(yīng)用。

相對于現(xiàn)有技術(shù)，本發(fā)明至少具有如下優(yōu)點或有益效果：

本發(fā)明提供了一種鑒定早生茶樹的SNP位點及其應(yīng)用，通過對茶樹的該第一SNP位點進行篩選，能夠在不受環(huán)境和樹齡的影響下、更快捷和便利的篩選出早生或特早生茶樹，從而降低茶樹品種選育過程中的管理成本以及管理難度，并提高早生或特早生茶樹的篩選效率。

具體實施方式

為使本發(fā)明實施例的目的、技術(shù)方案和優(yōu)點更加清楚，下面將對本發(fā)明實施例中的技術(shù)方案進行清楚、完整地描述。實施例中未注明具體條件者，按照常規(guī)條件或制造商建議的條件進行。所用試劑或儀器未注明生產(chǎn)廠商者，均為可以通過市售購買獲得的常規(guī)產(chǎn)品。

需要說明的是，在不沖突的情況下，本申請中的實施例及實施例中的特征可以相互組合。下面將參考具體實施例來詳細說明本發(fā)明。