[發(fā)明專利]蛋白質(zhì)間相互作用的預(yù)測方法、裝置及電子設(shè)備

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202210102489.8
• 申請日: 2022-01-27
• 公開（公告）號: CN116564412A
• 公開（公告）日: 2023-08-08
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 張振中
• 申請（專利權(quán)）人: 京東方科技集團(tuán)股份有限公司
• 主分類號: G16B30/10
• 分類號: G16B30/10;G16B40/00;G06F18/214
• 代理公司: 北京銀龍知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11243
• 代理人: 曹娜

1.一種蛋白質(zhì)間相互作用的預(yù)測方法，其特征在于，包括：

獲取第一蛋白質(zhì)的氨基酸序列，所述第一蛋白質(zhì)的氨基酸序列包括多個第一氨基酸序列；分別獲取每個所述第一氨基酸序列的第一序列信息；

獲取第二蛋白質(zhì)的氨基酸序列，所述第二蛋白質(zhì)的氨基酸序列包括多個第二氨基酸序列；分別獲取每個所述第二氨基酸序列的第二序列信息；

根據(jù)所述第一序列信息以及所述第二序列信息，確定所述第一氨基酸序列與所述第二氨基酸序列之間的序列關(guān)聯(lián)關(guān)系；

根據(jù)所述序列關(guān)聯(lián)關(guān)系，預(yù)測所述第一蛋白質(zhì)與所述第二蛋白質(zhì)之間的相互作用信息。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的預(yù)測方法，其特征在于，所述第一序列信息包括：所述第一氨基酸序列的第一特征信息，以及所述第一蛋白質(zhì)包括的所述第一氨基酸序列的第一數(shù)量信息，

所述第二序列信息包括：所述第二氨基酸序列的第二特征信息，以及所述第二蛋白質(zhì)包括的所述第二氨基酸序列的第二數(shù)量信息，

所述根據(jù)所述第一序列信息以及所述第二序列信息，確定所述第一氨基酸序列與所述第二氨基酸序列之間的序列關(guān)聯(lián)關(guān)系，包括：

確定所述第一數(shù)量信息與所述第二數(shù)量信息之間的第一關(guān)聯(lián)關(guān)系；以及確定所述第一特征信息與所述第二特征信息的第二關(guān)聯(lián)關(guān)系；

根據(jù)所述第一關(guān)聯(lián)關(guān)系及所述第二關(guān)聯(lián)關(guān)系，確定所述序列關(guān)聯(lián)關(guān)系。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的預(yù)測方法，其特征在于，所述確定所述第一數(shù)量信息與所述第二數(shù)量信息之間的第一關(guān)聯(lián)關(guān)系，包括：

根據(jù)預(yù)設(shè)概率分布算法，確定所述第一數(shù)量信息與所述第二數(shù)量信息之間的相似度，得到所述第一關(guān)聯(lián)關(guān)系。

4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的預(yù)測方法，其特征在于，所述確定所述第一特征信息與所述第二特征信息的第二關(guān)聯(lián)關(guān)系，包括：

根據(jù)所述第一特征信息與所述第二特征信息，確定所述第一氨基酸序列與第二氨基酸序列的特征關(guān)聯(lián)關(guān)系；

根據(jù)所述特征關(guān)聯(lián)關(guān)系，確定所述第二關(guān)聯(lián)關(guān)系。

5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的預(yù)測方法，其特征在于，所述第一關(guān)聯(lián)關(guān)系對應(yīng)的數(shù)據(jù)關(guān)系包括：

其中，Φ(K|u_i)表示所述第一關(guān)聯(lián)關(guān)系；K表示所述第二氨基酸序列的數(shù)量；λ(ui)表示ui中所述第一氨基酸序列的數(shù)量的期望；ui表示所述第一蛋白質(zhì)。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的預(yù)測方法，其特征在于，所述第二關(guān)聯(lián)關(guān)系對應(yīng)的數(shù)據(jù)關(guān)系包括：

其中，Y表示所述第二關(guān)聯(lián)關(guān)系；M表示所述第一氨基酸序列的數(shù)量；K表示所述第二氨基酸序列的數(shù)量；null表示預(yù)設(shè)氨基酸序列；表示所述第二蛋白質(zhì)u_j中的第k個所述第二氨基酸序列；

其中，p_ml(w|u_i)表示從所述第一蛋白質(zhì)u_i中選出任意一個所述第一氨基酸序列w的概率；

表示所述預(yù)設(shè)氨基酸序列與之間的條件概率。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的預(yù)測方法，其特征在于，所述序列關(guān)聯(lián)關(guān)系對應(yīng)的數(shù)據(jù)關(guān)系包括：

p(u_j|u_i)＝y(tǒng)Φ(K|u_i)；

其中，p(u_j|u_i)表示所述序列關(guān)聯(lián)關(guān)系；Y表示所述第二關(guān)聯(lián)關(guān)系；Φ(K|u_i)表示第一關(guān)聯(lián)關(guān)系。

8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的預(yù)測方法，其特征在于，確定所述序列關(guān)聯(lián)關(guān)系、根據(jù)所述序列關(guān)聯(lián)關(guān)系，預(yù)測所述第一蛋白質(zhì)與所述第二蛋白質(zhì)之間的相互作用信息，包括：

將所述第一序列信息以及所述第二序列信息輸入至預(yù)設(shè)預(yù)測模型，得到所述第一蛋白質(zhì)與所述第二蛋白質(zhì)之間的相互作用信息。