[發明專利]一種用于檢測新型冠狀病毒Omicron突變株的試劑盒

在審

• 申請號: 202210094440.2
• 申請日: 2022-01-26
• 公開（公告）號: CN114317831A
• 公開（公告）日: 2022-04-12
• 發明（設計）人: 陳林潔;呂建新;方權;王震;金大智
• 申請（專利權）人: 杭州醫學院
• 主分類號: C12Q1/70
• 分類號: C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11
• 代理公司: 北京東方盛凡知識產權代理事務所(普通合伙) 11562
• 代理人: 許佳

本發明公開了一種用于檢測新型冠狀病毒Omicron突變株的試劑盒，屬于病毒檢測領域。本發明公開了用于檢測新型冠狀病毒Omicron突變株的引物組和分子信標，引物組包括新型冠狀病毒S蛋白Omicron突變株特異性識別引物對和穩定引物，該引物組可以特異性擴增出S蛋白Omicron突變株片段；同時在引物對界定的擴增子區域內設計特異性識別分子信標，用于檢測PCR擴增產物；本發明提供了基于Omicron突變株特異性突變位點的PCR技術和分子信標雜交檢測Omicron突變株的引物組和分子信標，并構建了試劑盒和檢測方法，具有靈敏度高，識別能力強，操作方便、檢測速度快、結果準確等優點，適用于臨床中大規模應用。

技術領域

本發明涉及病毒檢測領域，特別是涉及一種用于檢測新型冠狀病毒 Omicron突變株的試劑盒。

背景技術

Omicron突變毒株與野生型病毒相比，具有更高的傳播能力和感染能力以及帶來了臨床特征的變化。這些變化同時也給現行的診斷、治療和疫苗帶來了新的挑戰。因此，對新型冠狀病毒S蛋白編碼基因型的快速鑒定不僅有利于臨床的診斷和治療，更有利于對疫情的防控。

目前用于新型冠狀病毒突變株鑒定的方法主要是DNA測序技術。然而該方法具有明顯的不足之處：DNA測序技術雖然準確，但是耗時過長、花費高，并不適用于快速檢測的要求。臨床上迫切需要一種準確的、靈敏度高的、操作簡便的新型冠狀病毒突變株的檢測手段。ARMS-PCR(突變擴增系統)是在基礎性PCR技術上發展起來的新技術，其基本設計思路是將特異性突變位點置于引物的3’端，而不是中間位置，再利用耐熱Taq DNA 聚合酶缺乏3’→5’核酸外切酶活性的特性，引物與模板互補配對過程中，若3’端堿基對形成錯配，鏈延伸反應就會因3′,5′-磷酸二酯鍵形成障礙而受阻，其擴增結果為：野生型模板擴增受阻，而突變型模板產物放大，因而可用于SNP分型檢測。鑒于目前新型冠狀病毒Omicron的存在，提供一種快速、準確、靈敏度高的新型冠狀病毒突變株鑒定方法非常必要。

發明內容

本發明的目的是提供一種用于檢測新型冠狀病毒Omicron突變株的試劑盒，以解決上述現有技術存在的問題，該試劑盒包括3對新型冠狀病毒 S蛋白Omicron突變株特異性識別引物和分子信標，本發明基于PCR技術和分子信標雜交檢測新冠病毒突變株，不僅靈敏度高，識別能力強，還具有操作方便、檢測速度快、結果準確等優點，適用于臨床中大規模應用。

為實現上述目的，本發明提供了如下方案：

本發明提供一種用于檢測新型冠狀病毒Omicron突變株的引物組和分子信標，所述引物組包括：

NL211-212I INS214EPE_F:TTATAGTGCGTGAGCCAGAAGAT；

NL211-212I INS214EPE_R:GCTGTCCAACCTGAAGAAG；

NL211-212I INS214EPE_stable:CTCAGGGTTTTTCGGCTTTAGAAC；

S371LS373PS375F_F:CTATATAATCTCGCACCATTTTTC；

S371LS373PS375F_R:CTGACTTCATCACCTCTAAT；

S371LS373PS375F_stable:AAGTGTTATGGAGTGTCTCCTACT；

Q493RG496SQ498R_F:CTTTACGATCATATAGTTTTCG；

Q493RG496SQ498R_R:TGGTGCATGTAGAAGTTC；

所述分子信標包括：

NL211-212I INS214EPE_B: