[發明專利]一種基于計算機的化學反應參數計算方法在審
| 申請號： | 202210086028.6 | 申請日： | 2022-01-25 |
| 公開（公告）號： | CN114334023A | 公開（公告）日： | 2022-04-12 |
| 發明（設計）人： | 馬瑩瑩 | 申請（專利權）人： | 內蒙古工業大學 |
| 主分類號： | G16C10/00 | 分類號： | G16C10/00;G16C20/10;G16B5/00 |
| 代理公司： | 陜西銘一知識產權代理有限公司 61287 | 代理人： | 李天麗 |
| 地址： | 010051 內蒙古自治*** | 國省代碼： | 內蒙古;15 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 基于 計算機 化學反應 參數 計算方法 | ||
【權利要求書】：
1.一種基于計算機的化學反應參數計算方法，其特征在于，步驟包括：
S1、在蛋白質晶體結構文件中收集蛋白質的初始結構，在蛋白質晶體結構文件的基礎上得到催化酶的初始結構文件；
S2、將蛋白質初始結構文件導入AMBER軟件，進行分子動力學模擬，模擬蛋白環境；
S3、將不同外在環境作為干擾條件，記錄不同干擾條件下蛋白質結構的變化；
S4、將分子動力學模擬后的蛋白質結構文件導入高斯軟件；利用高斯軟件對結構進行優化；
S5、根據設計的酶催化反應路線，優化反應物、過渡態、中間體以及產物的結構，并得到其相應的能量；
S6、利用高斯軟件計算不同模擬環境下的反應能壘。
2.根據權利要求1所述的一種基于計算機的化學反應參數計算方法，其特征在于：所述催化酶包括動物自身分泌的酶和通過藥物攝入的酶。
3.根據權利要求1所述的一種基于計算機的化學反應參數計算方法，其特征在于：所述S1中數據采集對象包括細菌和病毒。
4.根據權利要求1所述的一種基于計算機的化學反應參數計算方法，其特征在于：所述化學反應模擬過程中的能壘計算公式為：Ebarrier＝ETS-ERe；
其中，ETS應該為過渡態的能量，ERe表示反應物能量。
5.根據權利要求1所述的一種基于計算機的化學反應參數計算方法，其特征在于：所述干擾條件包括：溫度干擾、酸堿度干擾、藥物干擾。
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