[發(fā)明專利]一種基于深度學(xué)習(xí)的3D心室核磁共振視頻分割優(yōu)化系統(tǒng)在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202210035567.7 | 申請日: | 2022-01-13 |
| 公開(公告)號: | CN114359310A | 公開(公告)日: | 2022-04-15 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 董舜杰;潘子宣;卓成;付鈺 | 申請(專利權(quán))人: | 浙江大學(xué) |
| 主分類號: | G06T7/11 | 分類號: | G06T7/11;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司: | 杭州求是專利事務(wù)所有限公司 33200 | 代理人: | 劉靜 |
| 地址: | 310058 浙江*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 深度 學(xué)習(xí) 心室 核磁共振 視頻 分割 優(yōu)化 系統(tǒng) | ||
1.一種基于深度學(xué)習(xí)的3D心室核磁共振視頻分割優(yōu)化系統(tǒng),其特征在于,該系統(tǒng)包括3D心室核磁共振MRI視頻數(shù)據(jù)預(yù)處理模塊、可變形卷積的深度注意力網(wǎng)絡(luò)DeU-Net和圖像檢測模塊;
所述3D心室核磁共振MRI視頻數(shù)據(jù)預(yù)處理模塊對現(xiàn)有的3D心室MRI視頻數(shù)據(jù)集中各幀MRI圖像做歸一化處理;輸入到可變形卷積的深度注意力網(wǎng)絡(luò)DeU-Net;
所述可變形卷積的深度注意力網(wǎng)絡(luò)DeU-Net包括深度時(shí)空可變形卷積融合模塊TDAM,增強(qiáng)可變形卷積注意力網(wǎng)絡(luò)EDAN和概率噪聲校正模塊PNCM:
所述深度時(shí)空可變形卷積融合模塊TDAM:該模塊包含一個(gè)U-Net網(wǎng)絡(luò)和一個(gè)可變形卷積層;U-Net網(wǎng)絡(luò)以3D心室MRI視頻數(shù)據(jù)集作為輸入,輸出為MRI視頻段中圖像的高維特征補(bǔ)償區(qū)域,可變形卷積層以3D心室MRI視頻數(shù)據(jù)集和高維特征補(bǔ)償區(qū)域?yàn)檩斎耄玫窖a(bǔ)償后的圖像的高維特征;
所述增強(qiáng)可變形卷積注意力網(wǎng)絡(luò)EDAN:該模塊包含一個(gè)下采樣通道和一個(gè)上采樣通道。EDAN以TDAM輸出的圖像的高維特征作為輸入,經(jīng)過L層下采樣得到特征經(jīng)過卷積得到上采樣通道中第L層的原始特征與拼接后得到和共同輸入到DeConv(a)模塊,所述DeConv(a)模塊通過可變形卷積得到偏移ΔL和融合后的第L層特征具體計(jì)算為:
上采樣通道第i層的原始特征均與下采樣通道中對應(yīng)層的特征拼接得到Δi+1,共同輸入DeConv(b)模塊,其中i∈[1,L-1];最終得到上采樣通道最后一層的融合后的特征
所述DeConv(b)模塊包含多尺度注意力模塊MSAM和一個(gè)可變形卷積層;與Δi+1拼接后在進(jìn)行卷積得到Δi,MSAM的輸入為與Δi進(jìn)行可變形卷積后的特征x(H×W)和卷積后的特征其中H和W分別代表輸入特征的高度和寬度;MSAM的計(jì)算公式為:
其中k和j為輸入x,y以及輸出z的索引,k∈[1,H],σ(·)為用來歸一化的標(biāo)量函數(shù),φ(·)為計(jì)算x和y之間配對相關(guān)性的函數(shù);θ(·)為特征轉(zhuǎn)換函數(shù);
將進(jìn)行雙線性插值后的特征與z以及x(H×W)進(jìn)行拼接,之后卷積得到
所述概率噪聲校正模塊PNCM:該模塊包括一個(gè)由卷積層構(gòu)成的共享權(quán)重的孿生神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、兩個(gè)由全連接層構(gòu)成的獨(dú)立的特征提取層和重參數(shù)操作。孿生神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)以TDAM輸出的圖像的高維特征作為輸入,其輸出分別輸入到兩個(gè)特征提取層進(jìn)行特征提取,一個(gè)特征提取層輸出為輸入圖像的高維特征的均值,另一個(gè)特征提取層輸出為輸入圖像的高維特征的方差,將方差通過重參數(shù)操作加上均值后生成嵌入向量作為最終輸出;
所述圖像檢測模塊用于3D心室區(qū)域分割,利用訓(xùn)練好的可變形卷積的深度注意力網(wǎng)絡(luò)DeU-Net計(jì)算測試集3D心室MRI圖像的概率熱圖。具體為,將EDAN得到的特征圖與PNCM得到的嵌入向量拼接后,通過卷積層得到概率熱圖。通過分割概率對每一張心室MRI圖像對應(yīng)的概率熱圖進(jìn)行分割,獲得分割結(jié)果,即左心室區(qū)域、心肌區(qū)域和右心室區(qū)域。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于深度學(xué)習(xí)的3D心室核磁共振視頻分割優(yōu)化系統(tǒng),其特征在于,所述數(shù)據(jù)增強(qiáng)模塊在圖像處理過程中,通過旋轉(zhuǎn)、調(diào)節(jié)對比度以及縮放的方式擴(kuò)充數(shù)據(jù)集,將3D心室MRI視頻分為x,y,z,t四個(gè)方向,其中x,y,z代表空間坐標(biāo)系,t代表時(shí)間軸,選用x-y平面的視頻幀。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于深度學(xué)習(xí)的3D心室核磁共振視頻分割優(yōu)化系統(tǒng),其特征在于,在各幀MRI圖像輸入Deformable U-Net網(wǎng)絡(luò)前,選用目標(biāo)幀沿時(shí)間t軸方向的前后r幀作為Deformable U-Net網(wǎng)絡(luò)輸入,即2r+1幀MRI圖像。
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