[發明專利]兒童克羅恩病標志基因及其應用

在審

• 申請號: 202111672780.0
• 申請日: 2021-12-31
• 公開（公告）號: CN114317717A
• 公開（公告）日: 2022-04-12
• 發明（設計）人: 宋瑞雪;鄭智俊;李婷
• 申請（專利權）人: 青島銳翌精準醫學檢驗有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6869;A61K45/00;A61P1/00;A61P29/00;G16B30/10;A23L33/10
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 黃德海

1.一種試劑盒，其特征在于，包括適于檢測第一基因集中的至少一個基因的試劑，所述第一基因集由以下基因組成：S16_GI_0001907和S24_GI_0000414，其中，所述第一基因集中的基因與SEQ ID NO：1、2所示的核酸序列一一對應，所述第一基因集中的基因與其對應的SEQ ID NO：1、2中的核酸序列具有不小于90％的同一性。

2.根據權利要求1所述的試劑盒，其特征在于，進一步包括適于檢測V1.UC56-1_GL0008645基因的試劑，其中，所述V1.UC56-1_GL0008645基因與SEQ ID NO：3所示的核酸序列對應，所述V1.UC56-1_GL0008645基因與其對應的SEQ ID NO：3所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。

3.根據權利要求1所述的試劑盒，其特征在于，包括適于檢測所述第一基因集中全部所述基因的試劑。

4.試劑在制備試劑盒中的用途，所述試劑適于檢測第一基因集中的至少一種基因，所述試劑盒用于診斷兒童克羅恩病或者檢測兒童克羅恩病的治療效果，所述第一基因集由以下基因組成：

S16_GI_0001907和S24_GI_0000414，其中，所述第一基因集中的基因與SEQ ID NO：1、2所示的核酸序列一一對應，所述第一基因集中的基因與其對應的SEQ ID NO：1、2中的核酸序列具有不小于90％的同一性。

5.根據權利要求4所述的用途，其特征在于，所述試劑進一步適于檢測V1.UC56-1_GL0008645基因，其中，所述V1.UC56-1_GL0008645基因與SEQ ID NO：3所示的核酸序列對應，所述V1.UC56-1_GL0008645基因與其對應的SEQ ID NO：3所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。

6.一種用于預防或者治療兒童克羅恩病的藥物組合物或者食品組合物，其特征在于，含有提高V1.UC56-1_GL0008645基因豐度的物質，其中，所述V1.UC56-1_GL0008645基因與SEQ ID NO：3所示的核酸序列對應，所述V1.UC56-1_GL0008645基因與其對應的SEQ ID NO：3所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。

7.一種確定個體是否患有兒童克羅恩病的方法，其特征在于，包括：

(1)確定所述個體的結腸樣本中標志基因的豐度，所述標志基因包括第一基因集和V1.UC56-1_GL0008645基因中的至少一種基因；

(2)將步驟(1)中得到的所述豐度與預定的閾值進行比較，以便確定所述個體是否患有兒童克羅恩?。?/p>

其中，所述第一基因集由以下基因組成：S16_GI_0001907和S24_GI_0000414，其中，所述第一基因集中的基因與SEQ ID NO：1、2所示的核酸序列一一對應，所述第一基因集中的基因與其對應的SEQ ID NO：1、2中的核酸序列具有不小于90％的同一性；

所述V1.UC56-1_GL0008645基因與SEQ ID NO：3所示的核酸序列對應，所述

V1.UC56-1_GL0008645基因與其對應的SEQ ID NO：3所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。

8.根據權利要求7所述的方法，其特征在于，步驟(1)進一步包括：

獲得所述個體的結腸樣本中的核酸測序數據；

將所述測序數據與參考基因組進行比對；

基于所述比對的結果，確定所述標志基因的豐度。