[發(fā)明專(zhuān)利]核酸產(chǎn)品和用于α-地中海貧血單體型分析的試劑盒

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202111611600.8
• 申請(qǐng)日: 2021-12-27
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN114196749B
• 公開(kāi)（公告）日: 2023-09-19
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 李文;黃玉娟;冒燕;王敏;梁波
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 蘇州貝康醫(yī)療器械有限公司
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/6883
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 華進(jìn)聯(lián)合專(zhuān)利商標(biāo)代理有限公司 44224
• 代理人: 張靈莉

本發(fā)明涉及一種核酸產(chǎn)品和用于α?地中海貧血單體型分析的試劑盒。該核酸產(chǎn)品包括十組引物對(duì)，對(duì)應(yīng)地?cái)U(kuò)增以下十個(gè)STR位點(diǎn)：D16S521、D16S3399、HBA220831、HBA572、HBA1654275、HBA2001727、D16S291、D16S475、D16S3065和D16S423。利用上述核酸產(chǎn)品對(duì)α?地中海貧血單體型分析的成功率和準(zhǔn)確率高、能對(duì)目標(biāo)突變位點(diǎn)進(jìn)行分析且能發(fā)現(xiàn)新發(fā)突變。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，特別是涉及一種核酸產(chǎn)品和用于α-地中海貧血單體型分析的試劑盒。

背景技術(shù)

α-地中海貧血(簡(jiǎn)稱α-地貧)是一種常見(jiàn)的單基因遺傳病，主要是由于α-珠蛋白基因上的改變引發(fā)血紅蛋白合成障礙從而引起的慢性進(jìn)行性加重溶血性貧血。α地貧是地中海貧血的一種常見(jiàn)類(lèi)型，屬于常染色體不完全顯性遺傳疾病。

目前預(yù)防和控制地中海貧血的診斷方法包括產(chǎn)前診斷和胚胎植入前遺傳學(xué)診斷(PGD)。前者是在不同孕周進(jìn)行絨毛膜取絨毛或羊膜腔穿刺抽取羊水或臍帶血等方法對(duì)已孕胚胎進(jìn)行基因診斷，而PGD是將常規(guī)產(chǎn)前診斷提早到胚胎于子宮著床之前進(jìn)行活檢和遺傳學(xué)分析，選擇無(wú)遺傳性疾病的胚胎植入子宮腔內(nèi)，從而獲得正常胎兒的診斷方法。

臨床上在進(jìn)行α-地貧PGD時(shí)會(huì)容易導(dǎo)致誤診，故在進(jìn)行α-地貧PGD時(shí)常加入上下游的單核苷酸多態(tài)性(SNP)或者短串聯(lián)重復(fù)序列(STR)位點(diǎn)作為遺傳標(biāo)記，進(jìn)行連鎖分析從而降低等位基因脫扣(ADO)和污染引起的誤診率。

目前應(yīng)用于α-地貧PGD單體型分析的方法主要是基于二代測(cè)序(NGS)的SNP單體型分析技術(shù)。SNP單體型分析技術(shù)是對(duì)發(fā)育至第5天或者第6天的囊胚行活檢，對(duì)活檢細(xì)胞進(jìn)行全基因組擴(kuò)增，將致病基因突變作為目標(biāo)區(qū)域，在該基因突變上下游選擇數(shù)十至上百個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)作為連鎖遺傳標(biāo)記，通過(guò)二代測(cè)序技術(shù)進(jìn)行胚胎植入前單體型分析和染色體非整倍體篩查。

基于二代測(cè)序的SNP單體型分析技術(shù)雖然能用于連鎖分析的位點(diǎn)通常為數(shù)十至上百個(gè)，可提供更準(zhǔn)確、更全面的信息，但對(duì)于α-地中海貧血單體型分析而言，其可用于分型的SNP位點(diǎn)數(shù)目少，雜合度低，且容易發(fā)生等位基因脫扣現(xiàn)象，對(duì)于分型的成功率及準(zhǔn)確性無(wú)法保障，且其操作需要經(jīng)文庫(kù)構(gòu)建和高通量測(cè)序，步驟繁瑣、成本高、數(shù)據(jù)分析時(shí)間長(zhǎng)，不易臨床推廣。

發(fā)明內(nèi)容

基于此，有必要提供一種核酸產(chǎn)品及用于α-地中海貧血單體型分析的試劑盒，利用該核酸產(chǎn)品對(duì)α-地中海貧血單體型分析，成功率和準(zhǔn)確率高。

一種核酸產(chǎn)品，包括十組引物對(duì)，所述十組引物對(duì)用于對(duì)應(yīng)地?cái)U(kuò)增以下十個(gè)STR位點(diǎn)：D16S521、D16S3399、HBA220831、HBA572、HBA1654275、HBA2001727、D16S291、D16S475、D16S3065和D16S423。

經(jīng)本申請(qǐng)研究發(fā)現(xiàn)，D16S521、D16S3399、HBA220831、HBA572、HBA1654275、HBA2001727、D16S291、D16S475、D16S3065和D16S423這十個(gè)STR位點(diǎn)具有高度多態(tài)性，用于α-地中海貧血的單體型分析(例如胚胎植入前的α-地中海貧血的單體型分析)時(shí)，每個(gè)家系至少有四個(gè)有效STR位點(diǎn)，并且分析的準(zhǔn)確率高，成本低。此外，通過(guò)上述STR位點(diǎn)進(jìn)行單體型分析結(jié)合家系基因型信息，還可以對(duì)胚胎樣本進(jìn)行植入前遺傳學(xué)診斷。。