[發(fā)明專(zhuān)利]慢傳輸便秘標(biāo)志微生物及其應(yīng)用在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202111492678.2 | 申請(qǐng)日： | 2021-12-08 |
| 公開(kāi)（公告）號(hào)： | CN114410809A | 公開(kāi)（公告）日： | 2022-04-29 |
| 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人： | 鄭智俊;秦楠;劉強(qiáng) | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人： | 上海金翌生物科技有限公司 |
| 主分類(lèi)號(hào)： | C12Q1/689 | 分類(lèi)號(hào)： | C12Q1/689;C12Q1/6883;C12R1/145;C12R1/01 |
| 代理公司： | 北京清亦華知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 趙靜 |
| 地址： | 201203 上海市浦*** | 國(guó)省代碼： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 傳輸 便秘 標(biāo)志 微生物 及其 應(yīng)用 | ||
1.一種試劑盒，其特征在于，包括適于檢測(cè)標(biāo)志微生物中的至少一種菌種的試劑，所述標(biāo)志微生物由以下菌種組成：哈氏梭菌(Clostridium hathewayi)、毛螺科菌(Lachnospiraceae bacterium)3157FAA CT1、新屬種(Subdoligranulum unclassified)、白粉科菌(Erysipelotrichaceae bacterium)2244A、帕梅萊亞戈?duì)柖嗄岚褪暇?Gordonibacterpamelaeae)、艾克曼菌(Akkermansia muciniphila)、共生梭菌(Clostridium symbiosum)。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的試劑盒，其特征在于，包括適于檢測(cè)所述標(biāo)志微生物中全部所述菌種的試劑。
3.試劑在制備試劑盒中的用途，所述試劑適于檢測(cè)標(biāo)志微生物中的至少一種菌種，所述試劑盒用于診斷慢傳輸便秘或者檢測(cè)慢傳輸便秘的治療效果，所述標(biāo)志微生物由以下菌種組成：哈氏梭菌(Clostridium hathewayi)、毛螺科菌(Lachnospiraceae bacterium)3157FAA CT1、新屬種(Subdoligranulum unclassified)、白粉科菌(Erysipelotrichaceaebacterium)2244A、帕梅萊亞戈?duì)柖嗄岚褪暇?Gordonibacterpamelaeae)、艾克曼菌(Akkermansia muciniphila)、共生梭菌(Clostridium symbiosum)。
4.一種確定個(gè)體是否患有慢傳輸便秘的方法，其特征在于，包括：
(1)確定所述個(gè)體的糞便樣本中標(biāo)志微生物的豐度；
(2)將步驟(1)中得到的所述豐度與預(yù)定的閾值進(jìn)行比較，以便確定所述個(gè)體是否患有慢傳輸便秘；
其中，所述標(biāo)志微生物由以下菌種組成：哈氏梭菌(Clostridium hathewayi)、毛螺科菌(Lachnospiraceae bacterium)3157FAA CT1、新屬種(Subdoligranulumunclassified)、白粉科菌(Erysipelotrichaceae bacterium)2244A、帕梅萊亞戈?duì)柖嗄岚褪暇?Gordonibacterpamelaeae)、艾克曼菌(Akkermansia muciniphila)、共生梭菌(Clostridium symbiosum)。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法，其特征在于，步驟(1)進(jìn)一步包括：
獲得所述個(gè)體的糞便樣本中的核酸測(cè)序數(shù)據(jù)；
將所述測(cè)序數(shù)據(jù)與參考基因組進(jìn)行比對(duì)；
基于所述比對(duì)的結(jié)果，確定所述標(biāo)志微生物的豐度。
6.一種確定個(gè)體是否患有慢傳輸便秘的裝置，其特征在于，包括：
豐度確定單元，用于確定所述個(gè)體的糞便樣本中標(biāo)志微生物的豐度；
比較單元，用于將所得到的所述豐度與預(yù)定的閾值進(jìn)行比較，以便確定所述個(gè)體是否患有慢傳輸便秘；
其中，所述標(biāo)志微生物由以下菌種組成：哈氏梭菌(Clostridium hathewayi)、毛螺科菌(Lachnospiraceae bacterium)3157FAA CT1、新屬種(Subdoligranulumunclassified)、白粉科菌(Erysipelotrichaceae bacterium)2244A、帕梅萊亞戈?duì)柖嗄岚褪暇?Gordonibacterpamelaeae)、艾克曼菌(Akkermansia muciniphila)、共生梭菌(Clostridium symbiosum)。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的裝置，其特征在于，所述豐度確定單元適于通過(guò)下列步驟確定所述豐度：
獲得所述個(gè)體的糞便樣本中的核酸測(cè)序數(shù)據(jù)；
將所述測(cè)序數(shù)據(jù)與參考基因組進(jìn)行比對(duì)；
基于所述比對(duì)的結(jié)果，確定所述標(biāo)志微生物的豐度。
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