[發明專利]潰瘍性結腸炎標志微生物及其應用

在審

• 申請號: 202111490285.8
• 申請日: 2021-12-08
• 公開（公告）號: CN114891901A
• 公開（公告）日: 2022-08-12
• 發明（設計）人: 王廣冬;萬佳渭;劉強
• 申請（專利權）人: 上海銳翌生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;G16B30/10;G16B20/30;C12R1/01;C12R1/46;C12R1/07;C12R1/06
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 趙靜

1.一種試劑盒，其特征在于，包括適于檢測第一生物集中的至少一種菌種的試劑，所述第一微生物集由以下菌種組成：遠緣鏈球菌(Streptococcus sobrinus)、土壤芽孢桿菌(Solibacillus silvestris)、明串珠菌(Leuconostoc sp.DORA_2)、屎腸球菌(Enterococcus faecium)、藍絲菌(Cyanothece sp.CCY0110)、黃色柄桿菌(Caulobactersp.Root656)、芽孢桿菌(Bacillus sp.Soil531)和節桿菌(Arthrobacter sp.Soil736)。

2.根據權利要求1所述的試劑盒，其特征在于，進一步包括適于檢測擬桿菌(Bacteroidales bacterium)H5的試劑。

3.根據權利要求1所述的試劑盒，其特征在于，包括適于檢測所述第一微生物集中全部所述菌種的試劑。

4.試劑在制備試劑盒中的用途，所述試劑適于檢測第一微生物集中的至少一種菌種，所述試劑盒用于診斷潰瘍性結腸炎或者檢測潰瘍性結腸炎的治療效果，所述第一微生物集由以下菌種組成：遠緣鏈球菌(Streptococcus sobrinus)、土壤芽孢桿菌(Solibacillussilvestris)、明串珠菌(Leuconostoc sp.DORA_2)、屎腸球菌(Enterococcus faecium)、藍絲菌(Cyanothece sp.CCY0110)、黃色柄桿菌(Caulobacter sp.Root656)、芽孢桿菌(Bacillus sp.Soil531)和節桿菌(Arthrobacter sp.Soil736)。

5.根據權利要求4所述的用途，其特征在于，所述試劑進一步適于檢測擬桿菌(Bacteroidales bacterium)H5。

6.一種用于預防或者治療潰瘍性結腸炎的藥物組合物或者食品組合物，其特征在于，含有擬桿菌(Bacteroidales bacterium)H5。

7.一種確定個體是否患有潰瘍性結腸炎的方法，其特征在于，包括：

(1)確定所述個體的糞便樣本中標志微生物的豐度，所述標志微生物包括第一微生物集和擬桿菌(Bacteroidales bacterium)H5中的至少一種菌種；

(2)將步驟(1)中得到的所述豐度與預定的閾值進行比較，以便確定所述個體是否患有潰瘍性結腸炎；

其中，所述第一微生物集由以下菌種組成：遠緣鏈球菌(Streptococcus sobrinus)、土壤芽孢桿菌(Solibacillus silvestris)、明串珠菌(Leuconostoc sp.DORA_2)、屎腸球菌(Enterococcus faecium)、藍絲菌(Cyanothece sp.CCY0110)、黃色柄桿菌(Caulobactersp.Root656)、芽孢桿菌(Bacillus sp.Soil531)和節桿菌(Arthrobacter sp.Soil736)。

8.根據權利要求7所述的方法，其特征在于，步驟(1)進一步包括：

獲得所述個體的糞便樣本中的核酸測序數據；

將所述測序數據與參考基因組進行比對；

基于所述比對的結果，確定所述標志微生物的豐度。