[發明專利]一種基于固相富集結合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法在審
| 申請號: | 202111487621.3 | 申請日: | 2021-12-08 |
| 公開(公告)號: | CN114354778A | 公開(公告)日: | 2022-04-15 |
| 發明(設計)人: | 楊霜;李佳佳 | 申請(專利權)人: | 蘇州大學 |
| 主分類號: | G01N30/02 | 分類號: | G01N30/02;G01N30/06;G01N30/12;G01N30/86 |
| 代理公司: | 蘇州翔遠專利代理事務所(普通合伙) 32251 | 代理人: | 陸金星 |
| 地址: | 215137 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 富集 結合 糖肽 切分 tn 抗原 方法 | ||
本發明公開了一種基于固相富集結合O?糖肽酶切分析Tn抗原的方法,包括步驟:蛋白提取和濃度測量;蛋白酶解;多肽純化;固相結合;唾液酸處理;N聚糖切除;OpeRATOR酶切;O?Glycoprotease酶切;LC?MS分析。該方法能夠在固相上耦合糖肽,使用兩種O?糖肽酶切O?糖肽來鑒定Tn抗原的O?糖基化位點和Tn抗原的表達量,用作癌癥診斷的生物標志物。
技術領域
本發明屬于生物分子分析試劑技術領域,具體涉及固相偶聯糖肽和采用O-糖肽酶切富集Tn抗原的分析方法。
背景技術
Tn抗原(O-GalNAc)是一種與腫瘤相關的碳水化合物,在大多數癌組織表面高表達。它的分子量小、結構簡單、通常表達在細胞表面,可被免疫系統識別為外來物。因此,檢測Tn抗原的表達不僅反映免疫抑制微環境的情況,并且可作為癌癥的診斷標志物-特別是早期階段的特征,也可顯示腫瘤的進展以及預后狀況。目前對于Tn抗原的檢測手段主要有單克隆抗體、凝集素富集以及點擊化學等。這些方法大多缺乏特異性和靈敏度,易造成結果的假陽性和假陰性率,且步驟繁瑣、成本高。點擊化學的催化效率低且重現性差。無銅點擊化學生物素方法,所用試劑較為昂貴且疊氮化物劇毒、易爆炸。目前缺乏一種高效便捷的方法能夠檢測Tn抗原的表達及鑒定其在標志物中的特異性位點。
因此,有必要研發一種基于固相富集結合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法來解決現有技術中鑒定Tn抗原糖蛋白標志物的問題。
發明內容
本發明目的是提供一種基于固相富集結合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法。
本發明的一種技術方案是:
一種基于固相富集結合O-糖肽酶切分析Tn抗原的方法,包括步驟:
1)蛋白提取和濃度測量;
2)蛋白酶解;
3)多肽純化;
4)固相結合;
5)唾液酸處理;
6)N聚糖切除;
7)OpeRATOR酶切;
8)O-Glycoprotease酶切;
9)LC-MS分析。
進一步的,在步驟1)中,所述蛋白提取和濃度測量包括:在細胞中依次加入RIPA裂解液、蛋白酶抑制劑和EDTA后,使用超聲破碎儀破碎,冷卻,重復操作直至樣本溶液澄清,離心,取上層清液并用1×Tris稀釋,使用Pierce BCA蛋白定量分析試劑盒測試蛋白的濃度。
進一步的,在步驟2)中,所述蛋白酶解包括步驟:
(1)根據測定的蛋白的濃度,從上層清液中取蛋白,使得所述蛋白的總量在400-600ug,溶于尿素,輕微振蕩,直至蛋白完全溶解,獲得樣品溶液;
(2)向所述樣品溶液中加入總體積1/10的TCEP,孵育;
(3)向所述樣品溶液中加入總體積1/10的IAA,置于暗箱中孵育;
(4)向所述樣品溶液中加入HPLC水,使得所述樣品溶液中尿素的濃度<1.6M,調節所述樣品溶液的pH至7-9;
(5)向所述樣品溶液中加入胰蛋白酶,使得所述樣品溶液的蛋白量與所述胰蛋白酶的體積比為50:1~40:1,孵育過夜。
進一步的,在步驟3)中,所述多肽純化包括步驟:
(1)向所述樣品溶液中加入甲酸,使所述樣品溶液的pH<3;
(2)將所述樣品溶液加入預先處理的C18萃取柱中,重復操作;
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