[發明專利]重組蛋白結構域增強TET酶及全基因組DNA甲基化檢測方法有效
| 申請號: | 202111477604.1 | 申請日: | 2021-10-18 |
| 公開(公告)號: | CN114195902B | 公開(公告)日: | 2023-06-20 |
| 發明(設計)人: | 侯策;韋磊;江翱;陳晶晶;黃開瑜;滕以剛;曹振;宋東亮 | 申請(專利權)人: | 翌圣生物科技(上海)股份有限公司 |
| 主分類號: | C07K19/00 | 分類號: | C07K19/00;C12N9/10;C12Q1/6886;C40B50/06 |
| 代理公司: | 蘇州根號專利代理事務所(普通合伙) 32276 | 代理人: | 朱華慶 |
| 地址: | 200120 上海市浦*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 重組 蛋白 結構 增強 tet 基因組 dna 甲基化 檢測 方法 | ||
1.一種增強TET酶,其特征在于:為在序列如SEQ?ID?No.6所示的mTET1CD蛋白的氨基端通過GGGS連接肽連接如SEQ?ID?No.1-4中任一項所示的重組蛋白結構域。
2.一種構建全基因組DNA甲基化檢測文庫的方法,其特征在于其步驟包括:
(1)采用權利要求1所述的增強TET酶對模板DNA進行氧化;
(2)還原劑處理,堿中和;
(3)DNA回收,回收產物構成全基因組DNA甲基化檢測文庫。
3.根據權利要求2所述的構建全基因組DNA甲基化檢測文庫的方法,其特征在于:步驟(1)中所述的氧化反應的反應溫度為10-40℃。
4.根據權利要求2所述的構建全基因組DNA甲基化檢測文庫的方法,其特征在于:步驟(1)中所述的氧化反應的反應時間為0.5-2?h。
5.根據權利要求2所述的構建全基因組DNA甲基化檢測文庫的方法,其特征在于:步驟(2)中所述的還原劑包括氫化鋁鋰、氫化硼鋰、醋酸硼氫化鈉、氰基硼氫化鈉、二異丁基氫化鋁、三乙基硼氫化鋰、氨硼烷、吡啶硼烷、2-甲基吡啶硼烷、硼氫化鈉、氨硼烷鋰、吡咯烷并硼氫化鋰、硼烷乙二胺、硼烷二甲胺、硼烷嗎啉絡合物、硼烷三苯基膦、硼烷二苯基膦、硼烷三乙胺、4-甲基嗎啉硼烷、硼烷三甲胺絡合物、5-乙基-2-甲基吡啶硼烷、N,N-二異丙基乙胺硼烷、硼烷四氫呋喃絡合物、硼烷二甲基硫醚絡合物中的一種或多種。
6.根據權利要求2所述的構建全基因組DNA甲基化檢測文庫的方法,其特征在于:步驟(2)中還原劑的處理濃度為100-2000?mM。
7.根據權利要求2所述的構建全基因組DNA甲基化檢測文庫的方法,其特征在于:步驟(2)中還原劑的處理溫度為20-50℃。
8.根據權利要求2所述的構建全基因組DNA甲基化檢測文庫的方法,其特征在于:步驟(2)中還原劑的處理時間為2-24?h。
9.根據權利要求2所述的構建全基因組DNA甲基化檢測文庫的方法,其特征在于:步驟(2)中所述的堿中和使用的是氫氧化鈉或氫氧化鉀,在反應體系中的終濃度為0.5-1.5?M。
10.根據權利要求2所述的構建全基因組DNA甲基化檢測文庫的方法,其特征在于:步驟(3)中所述的DNA回收方式指磁珠法回收、柱法回收或抽提沉淀法回收。
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