[發明專利]FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA聯合作為肺腺癌生物標志物的用途有效
| 申請號: | 202111375737.8 | 申請日: | 2021-11-19 |
| 公開(公告)號: | CN114032308B | 公開(公告)日: | 2022-11-29 |
| 發明(設計)人: | 產天龍;徐祎春;韓峻松;袁箐;蘇軍;周佳菁 | 申請(專利權)人: | 上海生物芯片有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 上海光華專利事務所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 許亦琳;余明偉 |
| 地址: | 201203 上海市浦東新區中國*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | fam83a kpna2 krt6a ldha 聯合 作為 腺癌 生物 標志 用途 | ||
1.FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA作為肺腺癌標志物在制備肺腺癌預后評估的產品中的應用,所述肺腺癌預后評估的產品采用cox回歸分析方法,預測FAM83A、KPNA2、KRT6A、LDHA共表達的聯合效應對病人預后風險的影響。
2.用于檢測FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA的物質在制備肺腺癌預后評估的產品中的應用,所述肺腺癌預后評估的產品采用cox回歸分析方法,預測FAM83A、KPNA2、KRT6A、LDHA共表達的聯合效應對病人預后風險的影響。
3.如權利要求2所述的應用,其特征在于,所述物質包括如下1)~4)中的一項或多項:
1)序列如SEQ ID NO.1所示的FAM83A基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.2所示的FAM83A基因定量PCR反向引物;
2)序列如SEQ ID NO.3所示的KPNA2基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.4所示的KPNA2基因定量PCR反向引物;
3)序列如SEQ ID NO.5所示的KRT6A基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.6所示的KRT6A基因定量PCR反向引物;
4)序列如SEQ ID NO.7所示的LDHA基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.8所示的LDHA基因定量PCR反向引物。
4.一種肺腺癌預后評估的產品,其特征在于,所述產品包括檢測FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA的物質,所述肺腺癌預后評估的產品采用cox回歸分析方法,預測FAM83A、KPNA2、KRT6A、LDHA共表達的聯合效應對病人預后風險的影響。
5.如權利要求4所述的產品,其特征在于,所述物質包括如下1)~4)中的一項或多項:
1)序列如SEQ ID NO.1所示的FAM83A基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.2所示的FAM83A基因定量PCR反向引物;
2)序列如SEQ ID NO.3所示的KPNA2基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.4所示的KPNA2基因定量PCR反向引物;
3)序列如SEQ ID NO.5所示的KRT6A基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.6所示的KRT6A基因定量PCR反向引物;
4)序列如SEQ ID NO.7所示的LDHA基因定量PCR正向引物和如SEQ ID NO.8所示的LDHA基因定量PCR反向引物。
6.如權利要求4或5所述的產品,其特征在于,所述產品為試劑盒;和/或,所述預后包括肺腺癌復發及預后的輔助判斷。
7.一種對肺腺癌進行診斷和/或進行預后評估的系統,其特征在于,所述系統包括:
cox模型方程獲得模塊:提供cox模型方程,所述cox模型方程是根據FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA的表達水平,調用R平臺coxph,進行多因素生存預測分析,得到cox模型方程;
cox模型預測值和風險中位值獲得模塊:根據測序方法獲得的待測樣本的FAM83A、KPNA2、KRT6A和LDHA的表達量,代入所述cox模型方程,得到cox模型預測值,即cox模型風險值,同時獲得cox模型風險中位值;
預測模塊:如果cox模型風險值大于所述cox模型風險中位值,即預測為肺腺癌高風險,反之,則預測為肺腺癌低風險。
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