[發明專利]水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP標記開發及其應用

在審

• 申請號: 202111336313.0
• 申請日: 2021-11-12
• 公開（公告）號: CN114164292A
• 公開（公告）日: 2022-03-11
• 發明（設計）人: 陳春;郭新亞;陳衛軍
• 申請（專利權）人: 江蘇省農業科學院宿遷農科所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 上海怡恩專利代理事務所(普通合伙) 31336
• 代理人: 牟俊玲

1.水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP標記開發，其特征在于：所述分子標記是與水稻稻瘟病抗性基因Pid4緊密連鎖的KASP標記KASP_Pid4，所述KASP_Pid4是水稻基因組中的一個InDel位點，其核苷酸種類為+或-，為序列表中SEQ ID No.4的第101位核苷酸。

2.根據權利要求1所述的水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP標記開發的應用，其特征在于：所述與水稻稻瘟病抗性基因Pid4緊密連鎖的KASP分子標記在C1、C2、C3或C4中的應用；

所述C1為檢測水稻基因組中KASP_Pid4位點的多態性或基因型的物質在鑒定或輔助鑒定水稻稻瘟病抗性中的應用；

所述C2為檢測水稻基因組中KASP_Pid4位點的多態性或基因型的物質在制備鑒定或輔助鑒定抗稻瘟病水稻產品中的應用；

所述C3為檢測水稻基因組中KASP_Pid4位點的多態性或基因型的物質在水稻輔助育種或制備水稻輔助育種產品中的應用；

所述C4為檢測水稻基因組中KASP_Pid4位點的多態性或基因型的物質在選育抗稻瘟病水稻資源中的應用。

3.根據權利要求1所述的水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP標記開發的應用，其特征在于：還提供一種鑒定或輔助鑒定水稻稻瘟病抗性的方法，包括檢測待測水稻的基因型，根據待測水稻的基因型鑒定或輔助鑒定水稻稻瘟病抗性；所述基因型為水稻基因組中KASP_Pid4位點的基因型；所述記KASP_Pid4位點是水稻基因組中的一個InDel位點，其核苷酸種類為+或-，為序列表中SEQ ID No.4的第101位核苷酸；

其中，所述KASP_Pid4位點的基因型為++基因型時，水稻為感稻瘟病或者候選為感稻瘟病；所述KASP_Pid4位點的基因型為--基因型或者+-基因型時，水稻為抗稻瘟病或者候選為抗稻瘟病；其中，所述++基因型表示水稻基因組中所述KASP_Pid4位點的核苷酸種類為+的純合型；所述--基因型表示水稻基因組中所述KASP_Pid4位點的核苷酸種類為-的純合型；所述+-基因型表示水稻基因組中所述KASP_Pid4位點的核苷酸種類為+和-的雜合型。

4.根據權利要求3所述的水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP標記開發的應用，其特征在于：所述檢測水稻基因組中KASP_Pid4位點的多態性或基因型的物質在A1、A2、A3或A4中的應用；

所述A1為檢測水稻基因組中KASP_Pid4位點的多態性或基因型的物質在鑒定或輔助鑒定抗稻瘟病水稻中的應用；

所述A2為檢測水稻基因組中KASP_Pid4位點的多態性或基因型的物質在制備鑒定或輔助鑒定抗稻瘟病水稻產品中的應用；

所述A3為檢測水稻基因組中KASP_Pid4位點的多態性或基因型的物質在水稻輔助育種或制備水稻輔助育種產品中的應用；

所述A4為檢測水稻基因組中KASP_Pid4位點的多態性或基因型的物質在選育抗稻瘟病水稻資源中的應用。

5.根據權利要求1所述的水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP標記開發的應用，其特征在于：還提供一種選育抗稻瘟病水稻資源的方法，包括選擇KASP_Pid4位點的基因型--或基因型為+-的水稻進行育種，其中，所述KASP_Pid4位點是水稻基因組中的一個InDel位點，其核苷酸種類為+或-，為序列表中SEQ ID No.4的第101位核苷酸；所述--基因型表示水稻基因組中所述KASP_Pid4位點的核苷酸種類為-的純合型；所述+-基因型表示水稻基因組中所述KASP_Pid4位點的核苷酸種類為+和-的雜合型。

6.根據權利要求1所述的水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP標記開發的應用，其特征在于：提供含有檢測水稻基因組中KASP_Pid4位點的多態性或基因型的物質的產品，該產品包括檢測與水稻稻瘟病抗性相關的單核苷酸多態性或基因型的產品、鑒定或輔助鑒定水稻稻瘟病抗性的產品、用于水稻輔助育種的產品、用于選育抗稻瘟病水稻資源的產品中的任一種。