[發(fā)明專利]一種基于唾液特異性巖藻糖基化結(jié)構(gòu)糖譜及其檢測方法和應(yīng)用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202111259337.0 | 申請日: | 2021-10-28 |
| 公開(公告)號: | CN113960232A | 公開(公告)日: | 2022-01-21 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 楊霜;蔣軍紅;高子媛 | 申請(專利權(quán))人: | 蘇州大學(xué) |
| 主分類號: | G01N30/72 | 分類號: | G01N30/72;G01N30/06;C12P19/18;C12P19/28 |
| 代理公司: | 蘇州翔遠(yuǎn)專利代理事務(wù)所(普通合伙) 32251 | 代理人: | 陸金星 |
| 地址: | 215137 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 唾液 特異性 巖藻糖基化 結(jié)構(gòu) 及其 檢測 方法 應(yīng)用 | ||
1.一種基于唾液特異性巖藻糖基化結(jié)構(gòu)糖譜,其特征在于,包括如下通式結(jié)構(gòu):
其中,
F為巖藻糖;
G為半乳糖;
M為甘露糖;
N為乙酰氨基葡糖;
α1,2代表G單糖的碳2與F單糖的碳1連接;
α1,3代表N單糖的碳3與F單糖的碳1連接;
α1,6代表N單糖的碳6與F單糖的碳1連接。
2.一種基于唾液特異性巖藻糖基化結(jié)構(gòu)糖譜的檢測方法,其特征在于,包括步驟:
1)從蛋白質(zhì)中提取聚糖;
2)確定聚糖巖藻糖鏈接的方法;
3)唾液特異性巖藻糖基化結(jié)構(gòu)糖譜的檢測。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的一種基于唾液特異性巖藻糖基化結(jié)構(gòu)糖譜的檢測方法,其特征在于:步驟1)中,所述從蛋白質(zhì)中提取聚糖包括:
(1)填充移液管制備:
將微米級多孔篩板加入空心移液管;
將表面修飾有醛基的納米級多孔微米球形樹脂填充到空心移液管,填充后空心移液管稱為填充移液管;
將另一個微米級多孔篩板加入至所述填充移液管中,將醛基樹脂固定于所述填充移液管中;
(2)蛋白固相結(jié)合
將蛋白質(zhì)溶于去離子水中,用塑料離心管存放溶解后的蛋白質(zhì);
將所述溶解后的蛋白質(zhì)加熱變性,冷卻至室溫后加入二硫蘇糖醇還原,最后加入碘乙酰胺將蛋白質(zhì)烷基化,獲得樣本;
通過洗脫和離心將反應(yīng)緩沖液替換為PBS,同時加入氰硼氫化鈉室溫反應(yīng),將蛋白與固相形成的-C=N-還原成-C-N-共價鍵;
將所述填充移液管上的樣本清洗;
(3)N-聚糖制備
在所述填充移液管中加入N-糖苷酶,使用碳酸氫銨緩沖溶液,將N-聚糖從所述填充移液管樹脂上固定的蛋白質(zhì)酶解至碳酸氫銨緩沖溶液中;
通過離心收集上清液,再加入稀釋乙腈洗脫填充移液管樹脂,并收集上清液,重復(fù)此步驟一次;
將所有收集的上清液合并,取其中部分用質(zhì)譜儀器分析聚糖成分和豐度。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種基于唾液特異性巖藻糖基化結(jié)構(gòu)糖譜的檢測方法,其特征在于,在步驟(2)中所述通過洗脫和離心將反應(yīng)緩沖液替換為PBS,同時加入氰硼氫化鈉室溫反應(yīng),將蛋白與固相形成的-C=N-還原成-C-N-共價鍵之前還包括:調(diào)節(jié)樣本pH值至10,加入檸檬酸鈉和醋酸鈉配制的緩沖液,反應(yīng)使蛋白質(zhì)N-端和/或賴氨酸與固相樹脂上的醛基反應(yīng)結(jié)合;再加入氰硼氫化鈉到所述樣本中反應(yīng),將-C=N-還原形成-C-N-共價鍵。
5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種基于唾液特異性巖藻糖基化結(jié)構(gòu)糖譜的檢測方法,其特征在于,在步驟(3)之前還包括確定α1,2巖藻糖、α1,3巖藻糖和α1,6巖藻糖中的任意一種或多種。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種基于唾液特異性巖藻糖基化結(jié)構(gòu)糖譜的檢測方法,其特征在于,所述確定α1,2巖藻糖包括:加入α1-2巖藻糖苷酶到所述填充移液管樹脂固相中,將α1,2巖藻糖酶解;通過所述酶解反應(yīng),將α1,2巖藻糖從聚糖上酶切,所得聚糖分子量如果相差一個巖藻糖,則推斷含有一個α1,2巖藻糖,如果相差兩個巖藻糖分子量,則推斷含有兩個α1,2巖藻糖,以此類推;如果α1-2巖藻糖苷酶酶切后聚糖仍含有巖藻糖,則推斷該聚糖可含有α1,3巖藻糖和/或核心α1,6巖藻糖。
7.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種基于唾液特異性巖藻糖基化結(jié)構(gòu)糖譜的檢測方法,其特征在于,所述確定α1,3巖藻糖包括:在所述填充移液管樹脂固相中加入α1-2,3,4巖藻糖苷酶,將α1,3巖藻糖酶解;通過所述酶解反應(yīng)將α1,3巖藻糖從聚糖上酶切,所得聚糖分子量如果相差一個巖藻糖,則推斷含有一個α1,3巖藻糖,如果相差兩個巖藻糖分子量,則推斷含有兩個α1,3巖藻糖,以此類推;如果α1-2,3,4巖藻糖苷酶酶切后聚糖仍含有巖藻糖,則推斷該聚糖可能為核心α1,6巖藻糖。
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