[發(fā)明專利]櫻花SSR分子標記引物及在20個櫻花品種鑒定中的應用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202111194838.5 | 申請日: | 2021-10-13 |
| 公開(公告)號: | CN113684308A | 公開(公告)日: | 2021-11-23 |
| 發(fā)明(設計)人: | 蔣冬月;沈鑫;孫澤碩;李因剛 | 申請(專利權)人: | 浙江省林業(yè)科學研究院 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京華際知識產(chǎn)權代理有限公司 11676 | 代理人: | 袁瑞紅 |
| 地址: | 310023 浙*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 櫻花 ssr 分子 標記 引物 20 品種 鑒定 中的 應用 | ||
本發(fā)明公開了櫻花SSR分子標記引物及在20個櫻花品種鑒定中的應用,通過從尾葉櫻基因組數(shù)據(jù)中獨立開發(fā)了櫻花品種SSR相關的分子標記引物,對開發(fā)的16對SSR引物進行擴增及多態(tài)性篩選,最終選擇引物ZJF01和ZJF02進行24個品種的鑒定,結果驗證通過2對引物組合就能將其中的20個櫻花品種進行區(qū)分鑒定,可見,本發(fā)明能夠采用很少的引物組合就能鑒別出20個櫻花品種,豐富了櫻花品種分子標記鑒定的類型,由于選用的引物對少,可以大大提高鑒定效率。
技術領域
本發(fā)明屬于生物技術領域,具體涉及櫻花SSR分子標記引物及在20個櫻花品種鑒定中的應用。
背景技術
櫻花為薔薇科(Rosaceae)李屬(Prunus sensu lato)櫻亞屬植物(subgenusCerasus)的統(tǒng)稱。櫻花是世界著名觀花喬木,盛開時繁花滿樹,末花時落英繽紛;作為經(jīng)濟價值較高的果木和高雅的園林花木,具有廣闊的開發(fā)利用前景。近百年來,通過自然變異篩選和人工雜交培育出600多個櫻花園藝品種。但是,由于許多品種間形態(tài)相似性較高、品種來源記載不詳、同物異名與異物同名現(xiàn)象頻發(fā);且多數(shù)櫻花先花后葉,花葉不同期,易于雜交,形態(tài)變異豐富多樣,生活史長、花期相對較短,缺乏快速準確的鑒定方法(王賢榮,2014,Shi et al.,2013)。
近百年來,人們通過自然變異篩選和雜交培育的方式獲得了600多個櫻花園藝品種(袁冬明等,2018)。針對這些園藝品種,分類學家先后根據(jù)樹形、花、果、葉、冬芽等形態(tài)特性提出三級、五級分類標準及花期、花色分類標準(時玉娣,2007,藤木俊雄,2009,張瓊等,2012)。由于不同學者對形態(tài)性狀的判斷標準不一樣,品種間性狀交叉、重疊及在不同環(huán)境中具有很強的可塑性,造成形態(tài)學鑒定的困難,從而造成品種名混淆,同物異名、異物同名等現(xiàn)象時常發(fā)生。
隨著分子生物學的興起,分類學家開始使用不同的DNA分子標記研究櫻花種質(zhì)資源的多樣性及親緣關系。研究人員利用RFLP、AFLP等分子標記區(qū)分歐洲甜櫻桃(P.avium)與歐洲酸櫻桃(P.cerasus)(Badenes and Parfitt,1995;Hisayo et al.,2003;Zamani andBouzari,2012),利用SSR、ISSR和SCAR標記區(qū)分櫻桃(P.pseudocerasus)、歐洲甜櫻桃、草原櫻桃(P.fruticosa)、山櫻花(P.serrulata)等(Cantini,2001;Khadivi-Khub et al.,2014;Barac et al.,2014;Kato et al.,2014;Zhang and Gu,2016;趙慶杰等,2016;宗宇等,2016)。但是,由于櫻花品種繁多,已有的分子標記分辨率低,不足以鑒定區(qū)分全部品種,因此,持續(xù)不斷開發(fā)新的分子標記,對于櫻花品種鑒定是非常必要的。SSR標記因其多態(tài)性高、穩(wěn)定性好、多等位基因、共顯性、數(shù)量豐富、基因組覆蓋性好和操作簡單等優(yōu)點(Powellet al,1996)廣泛用于遺傳多樣性、品種指紋圖譜繪制、品種鑒定、遺傳圖譜、目的基因定位等領域。本研究從尾葉櫻基因組數(shù)據(jù)中開發(fā)櫻花品種SSR相關分子標記,并研究其在櫻花品種鑒定中的應用,對櫻花品種鑒定以及分子標記輔助育種具有重要意義。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的之一在于提供一種櫻花SSR分子標記引物。
本發(fā)明的目的之二在于提供櫻花SSR分子標記引物在櫻花品種鑒定中的作用。
本發(fā)明目的之三在于提供一種鑒定櫻花的試劑盒。
為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供如下技術方案:
櫻花SSR分子標記引物,所述分子標記引物包括如下兩對,其正向引物和反向引物的核苷酸序列具體如下:
(1)ZJF01:正向引物序列為F:GATGTAGAGGGAGGTTCTGTATTTG(如SEQ ID NO.1所示),反向引物序列為R:ACGGATCTAGTGAGGGATGGGTATG(如SEQ ID NO.2所示);
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