[發明專利]一種與斑點叉尾鮰生長相關的SNP標記及其應用

在審

• 申請號: 202111176337.4
• 申請日: 2021-10-09
• 公開（公告）號: CN113789392A
• 公開（公告）日: 2021-12-14
• 發明（設計）人: 鐘立強;王明華;張世勇;姜虎成;陳校輝
• 申請（專利權）人: 江蘇省淡水水產研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 江蘇德善律師事務所 32488
• 代理人: 趙鵬

1.一種斑點叉尾鮰生肌調節因子MyoG基因在親本篩選中的應用。

2.一種影響斑點叉尾鮰生長的SNP標記，其特征在于：所述SNP標記的DNA序列如SEQ IDNO：2所示，其中第391位W為堿基T或A。

3.如權利要求2所述的影響斑點叉尾鮰生長的SNP標記，其特征在于：所述SNP標記，第391位基因型為TT、AA、AT。

4.權利要求2所述的SNP標記在判斷斑點叉尾鮰生長快慢中的應用和/或在篩選快速生長斑點叉尾鮰中的應用。

5.一種斑點叉尾鮰MyoG基因型的判斷方法，其特征在于：

檢測斑點叉尾鮰的SNP標記的第391位堿基處是否為AA基因型，所述SNP標記的DNA序列如SEQ ID NO：2所示；

若為AA基因型，則可作為生長速度快、遺傳穩定的斑點叉尾鮰后備親本。

6.根據權利要求5所述的方法，其特征在于：包括如下步驟，

1）提取斑點叉尾鮰基因組DNA；

2）以提取得到的基因組DNA為模板，PCR檢測所述SNP標記的第391位基因型。

7.根據權利要求6所述的方法，其特征在于：在步驟2）中，所述PCR檢測具體操作為，

用引物F1和R1對斑點叉尾鮰基因組DNA進行PCR擴增，得到PCR產物，

SEQ ID NO：3，F1：5'-TCTTCCCTTCCAGGCTTACA-3'；

SEQ ID NO：4，R1：5'-AGCAGCCGAGGACCTGTAAT-3'。

8.PCR產物經瓊脂糖凝膠電泳檢測后，進行測序分析。

9.根據權利要求7所述的方法，其特征在于：所述初次PCR擴增的反應體系為，

PCR擴增使用即用型UltraTaq酶PCR試劑盒，包括2×UltraTaq Master Mix 20 μl，基因組DNA 2 μl，上下游引物2 μl，ddH₂O 14 μl；

擴增條件為：94℃預變性5min；94℃變性30s，59℃退火30s，72℃延伸60s，30個循環；72℃延伸10min。