[發明專利]蘇氏圓腹鯰生長性狀相關的SNP分子標記及其應用

在審

• 申請號: 202111122922.6
• 申請日: 2021-09-24
• 公開（公告）號: CN113981104A
• 公開（公告）日: 2022-01-28
• 發明（設計）人: 劉文生;蔣亮森;阮灼豪;盧志強;黎遺富;張細權
• 申請（專利權）人: 華南農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 廣州粵高專利商標代理有限公司 44102
• 代理人: 趙崇楊

本發明公開了蘇氏圓腹鯰生長性狀相關的SNP分子標記及其應用。本發明給出的SNP分子標記位點和單倍型分子標記，與蘇氏圓腹鯰的生長特性密切相關，可運用到蘇氏圓腹鯰的分子標記輔助選育中，便于對蘇氏圓腹鯰進行早期選擇，從而縮短世代間隔，提高群體選種的準確性和育種進程。

技術領域

本發明屬于魚類分子標記輔助育種選育技術領域。更具體地，涉及一種與蘇氏圓腹鯰生長性狀相關的SNP分子標記及其應用。

背景技術

蘇氏圓腹鯰(Pangasianodon hypophthalmus)又稱淡水虎鯊、虎頭鯊、巴沙魚，隸屬鯰形目，芒鯰屬，為無鱗魚類，是東南亞國家重要的淡水養殖品種，具有生長快、耐低氧、無肌間小刺等特點。近年來，蘇氏圓腹鯰在我國的消費需求不斷增長，但多依賴國外進口，國內的養殖技術還不能完全滿足市場的需求，且出現了苗種混雜等種質衰退現象，嚴重影響蘇氏圓腹鯰養殖產業的健康發展，因此，對蘇氏圓腹鯰進行選擇育種具有重要意義。

單核甘酸多態性(SNP)是動物基因組中普遍存在的一種分子標記，主要是指在基因組水平上由單個核甘酸的變異(包括缺失、顛換、插入和轉換)所引起的DNA序列多態性，是可遺傳的變異中最常見的一種變異。SNP與生物遺傳高度相關，位于基因啟動子區或編碼區等功能區的多態性可能直接引起生物體疾病或其他性狀的改變。

生長激素受體(GHR)是細胞因子受體超家族的一員，處于GH/IGF生長軸上，其通過調節上下游相關基因的表達調控動物生長發育，對生長發育功能起重要作用。生長激素(GH)對動物生長的促進作用離不開GHR，GHR的遺傳多態性可能會影響GH的正常功能，進而影響個體的生長發育、體重、身長等生長性狀。GHR基因研究其多態性和篩選生長相關分子標記的報道主要集中在家禽上，在魚類中的研究相對較少。

阮瑞霞等公開了吉富羅非魚兩種生長激素受體基因的分離及與增重相關的SNPs位點，其從吉富羅非魚中分離得到的兩個生長激素受體基因與尼羅羅非魚(EF052861，AY973233)相似性較高(阮瑞霞,俞菊華,李紅霞,等.吉富羅非魚兩種生長激素受體基因的分離及與增重相關的SNPs位點[J].動物學雜志,2011,046(003):37-46.)。其雖公開了吉富羅非魚生長激素受體基因以及從中獲得的SNP位點，但不同魚類的生長激素受體基因存在差異，蘇氏圓腹鯰的GHR基因中是否存在與生長性狀相關的SNP位點是未知的。目前也還未有關于在蘇氏圓腹鯰中尋找鑒定GHR基因，以及與生長性狀相關的SNP分子標記或單倍型分子標記的報道。

發明內容

本發明要解決的技術問題是克服現有上述技術的缺陷和不足，提供一種與蘇氏圓腹鯰生長性狀相關的SNP分子標記及其應用。

本發明的第一個目的是提供與蘇氏圓腹鯰生長性狀相關的SNP分子標記。

本發明的第二個目的是提供一種與蘇氏圓腹鯰生長性狀相關的單倍型分子標記。

本發明的第三個目的是提供與蘇氏圓腹鯰生長性狀相關的SNP分子標記以及單倍型分子標記在蘇氏圓腹鯰分子標記輔助選育中的應用。

本發明的第四個目的是提供一種用于檢測所述SNP分子標記或所述單倍型分子標記的引物。

本發明的第五個目的是提供一種用于檢測所述SNP分子標記或所述單倍型分子標記的試劑盒。

本發明上述目的通過以下技術方案實現：

本發明獲得了源于蘇氏圓腹鯰生長激素受體(GHR)基因的SNP分子標記位點和單倍型分子標記，所述分子標記的序列如SEQ ID NO.1所示。本發明通過將所得SNP位點與單倍型分子標記與主要生長性狀進行關聯分析，給出了可作為蘇氏圓腹鯰生長相關的分子育種標記位點，為輔助蘇氏圓腹鯰進行選育提供分子機制，可縮短育種年限，使優良性狀得到充分發揮與利用。

本發明提供了一種與蘇氏圓腹鯰生長性狀相關的SNP分子標記，所述SNP分子標記的序列如SEQ ID NO.1所示。