[發明專利]一種適用于產孢真菌快速鑒定植物病原菌種類的方法在審
| 申請號: | 202111095911.3 | 申請日: | 2021-09-18 |
| 公開(公告)號: | CN113637734A | 公開(公告)日: | 2021-11-12 |
| 發明(設計)人: | 伏榮桃;盧代華;陳誠;王劍;向運佳;趙黎宇;陳雪娟 | 申請(專利權)人: | 四川省農業科學院植物保護研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6869 | 分類號: | C12Q1/6869;C12Q1/6895;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 成都九鼎天元知識產權代理有限公司 51214 | 代理人: | 劉磊 |
| 地址: | 610066 四*** | 國省代碼: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 適用于 真菌 快速 鑒定 植物 病原菌 種類 方法 | ||
1.一種適用于產孢真菌快速鑒定植物病原菌種類的方法,其特征在于,包括以下步驟:
S1.樣本收集與處理:從發病植物上采集新鮮病害癥狀典型且帶有產孢病原物的樣本,然后從采集的樣本中選取帶有產孢病原物樣本進行殺菌;
S2.病原菌孢子收集:使用步驟S1中產孢病原物樣本制備孢子懸浮液,所述孢子懸浮液作為后續PCR反應中的DNA模板;
S3.PCR反應:采用真菌通用引物ITS4和ITS5對步驟S2中的孢子懸浮液進行PCR擴增,將擴增產物進行瓊脂糖凝膠電泳,檢測擴增產物片段大小;
S4.測序分析確定病原菌種類:將步驟S3中目的片段進行測序,得到的DNA序列在NCBI上進行Blast對比,從而確定導致植物真菌病害的病原菌種類。
2.根據權利要求1所述的一種適用于產孢真菌快速鑒定植物病原菌種類的方法,其特征在于,所述步驟S1中新鮮病害癥狀典型且帶有產孢病原物的樣本為:霉狀物、霜霉狀物、粉狀物、球狀物、銹狀物、棉絮狀物、絮狀物、絲狀物、顆粒狀物或點狀物。
3.根據權利要求1所述的一種適用于產孢真菌快速鑒定植物病原菌種類的方法,其特征在于,所述步驟S1中新鮮病害癥狀典型且帶有產孢病原物的樣本采集后于4℃保存,備用。
4.根據權利要求1所述的一種適用于產孢真菌快速鑒定植物病原菌種類的方法,其特征在于,所述步驟S1中殺菌為使用紫外燈殺菌20-30min。
5.根據權利要求1所述的一種適用于產孢真菌快速鑒定植物病原菌種類的方法,其特征在于,步驟S2中孢子懸浮液制備方法為,用無菌解剖針挑起樣本表面的孢子于EP管中,加入50-100ml無菌水,在振蕩器上震蕩3-5min。
6.根據權利要求5所述的一種適用于產孢真菌快速鑒定植物病原菌種類的方法,其特征在于,所述EP管為1.5ml EP管。
7.根據權利要求1所述的一種適用于產孢真菌快速鑒定植物病原菌種類的方法,其特征在于,所述步驟S3中PCR擴增體系為:ITS4引物和ITS5引物各2.5ul、孢子懸浮液5-6ul、2×Taq Master Mix 25ul,再用ddH2O補足到50ul。
8.根據權利要求1所述的一種適用于產孢真菌快速鑒定植物病原菌種類的方法,其特征在于,所述步驟S3中PCR擴增條件為:96-97℃預變性6-8min,96-97℃變性40-50s,55℃退火30s,72℃延伸45s,35-40個循環;72℃終延伸5-8min。
9.根據權利要求1所述的一種適用于產孢真菌快速鑒定植物病原菌種類的方法,其特征在于,所述步驟S4中的測序結果對比確定病原菌種類的方法為:將測序結果在NCBI上進行Blast對比,匹配長度最長,序列相似率達99%-100%的真菌被判定為被鑒定植物病原菌所屬真菌。
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