[發(fā)明專利]小麥每穗小穗數(shù)及穗粒數(shù)性狀相關(guān)SNP位點(diǎn)及其應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202111027772.0
• 申請(qǐng)日: 2021-09-02
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN113699269B
• 公開(kāi)（公告）日: 2022-09-30
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 劉西崗;張騰騰;張琦;郭琳;李永鵬;景瑞蓮
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 河北師范大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 石家莊輕拓知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 13128
• 代理人: 張培元

1.一種試劑盒，用于檢測(cè)小麥基因組中如下SNP位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性，所述SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第324bp基因起始編碼位點(diǎn)A算起的第1010位堿基；

所述SNP位點(diǎn)處的核苷酸為G或A；所述SNP位點(diǎn)處的核苷酸為G/G純合時(shí)，相對(duì)應(yīng)的基因型是甲；所述SNP位點(diǎn)處的核苷酸為A/A純合時(shí)，相對(duì)應(yīng)的基因型是乙；

所述試劑盒包含SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3組成的引物對(duì)1F和1R，和SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5組成的引物對(duì)2F和2R。

2.一種引物，用于檢測(cè)小麥基因組中如下SNP位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性，所述的SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第324bp基因起始編碼位點(diǎn)A算起的第1010位堿基；所述SNP位點(diǎn)處的核苷酸為G或A；所述SNP位點(diǎn)處的核苷酸為G/G純合時(shí)，相對(duì)應(yīng)的基因型是甲；所述SNP位點(diǎn)處的核苷酸為A/A純合時(shí)，相對(duì)應(yīng)的基因型是乙；

所述引物為SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3組成的引物對(duì)1F和1R，和SEQ ID NO.4和SEQID NO.5組成的引物對(duì)2F和2R。

3.一種鑒定或輔助鑒定小麥穗粒數(shù)性狀的方法，其特征在于：該方法包括如下步驟：

A、對(duì)待測(cè)小麥基因組DNA中任意一段包含如下SNP位點(diǎn)的DNA片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增，并將該P(yáng)CR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行酶切鑒定；所述SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第324bp基因起始編碼位點(diǎn)A算起的第1010位堿基；

B、確定待測(cè)小麥的基因型，所述SNP位點(diǎn)處的核苷酸為G/G純合時(shí)，相對(duì)應(yīng)的基因型是甲；所述SNP位點(diǎn)處的核苷酸為A/A純合時(shí)，相對(duì)應(yīng)的基因型是乙；

C、根據(jù)待測(cè)小麥基因型按照如下標(biāo)準(zhǔn)確定待測(cè)小麥的穗粒數(shù)性狀：基因型甲純合小麥的穗粒數(shù)小于或候選小于基因型乙純合小麥的穗粒數(shù)；

步驟A中：所述的PCR擴(kuò)增的DNA片段為SEQ ID NO.1中5’末端989-1144bp；所述的PCR擴(kuò)增的特異性引物對(duì)為SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3組成的引物對(duì)1F和1R，SEQ ID NO.4和SEQID NO.5組成的引物對(duì)2F和2R；所述的酶切包括以下步驟：以小麥基因組DNA為模板，以引物1F和1R為引物對(duì)擴(kuò)增得到第一PCR產(chǎn)物；將此第一PCR產(chǎn)物稀釋10倍，以其作為模板，以引物2F和2R為引物對(duì)擴(kuò)增得到第二PCR產(chǎn)物；用限制性內(nèi)切酶PstI酶切第二PCR產(chǎn)物；

步驟B中：若第二PCR產(chǎn)物可以被切開(kāi)，則核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)為G/G；若第二PCR產(chǎn)物不能被切開(kāi)，則核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)為A/A。