[發明專利]PTPRD基因突變在預測TP53突變型肺癌患者免疫治療敏感性中的應用

在審

• 申請號: 202110984444.3
• 申請日: 2021-08-25
• 公開（公告）號: CN113564258A
• 公開（公告）日: 2021-10-29
• 發明（設計）人: 董忠誼;吳德華;白雪;蔡曉庭;譚家樂
• 申請（專利權）人: 南方醫科大學南方醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;G01N33/574
• 代理公司: 廣州漢文專利代理事務所(特殊普通合伙) 44508
• 代理人: 鐘秀萍

本發明涉及基因突變在預測肺癌患者免疫治療敏感性中的應用，具體涉及了PTPRD基因突變在預測TP53突變型肺癌患者免疫治療敏感性中的應用以及PTPRD基因突變的檢測產品在制備預測TP53突變型肺癌患者對免疫檢查點抑制劑療法敏感性產品中的應用，所述PTPRD基因突變的存在為TP53突變型肺癌患者對免疫檢查點抑制劑療法敏感的指征。本發明篩選出PTRPD突變基因作為預測TP53突變型肺癌患者中對ICI敏感的群體生物標志物；通過PTRPD突變，能夠預測TP53突變型肺癌患者腫瘤淋巴細胞浸潤和PD?L1表達高低，進而預測ICI敏感的群體，精確篩選更多免疫治療獲益人群。

技術領域

本發明涉及基因突變在預測肺癌患者免疫治療敏感性中的應用，具體涉及了PTPRD基因突變在預測TP53突變型肺癌患者免疫治療敏感性中的應用。

背景技術

肺癌是人類最常見的惡性腫瘤。肺癌的發生發展與驅動基因變異密切相關，基于驅動基因變異所衍生的分子靶向治療在肺癌治療上取得重大突破。然而耐藥問題的出現，限制了患者的持續受益。近年來隨著免疫治療的興起，越來越多的研究發現，在肺癌中驅動基因變異與免疫治療耐藥有著內在關聯，如EGFR突變NSCLC患者免疫治療療效下降，TP53/KRAS突變則顯著增加免疫治療療效。既往的研究已經證明，PD-L1表達、腫瘤突變負荷(tumor mutation burden,TMB)、微衛星不穩定(Microsatellite instability,MSI)及腫瘤浸潤淋巴細胞(Tumorinfiltrating lymphocytes,TIL)等可以有效預測免疫治療療效。但這些預測因子仍存在一些問題：如預測效能、腫瘤異質性、瘤種特異性等。因此，目前關鍵問題仍集中在如何篩選有效預測標志物以提高免疫治療獲益人群。

TP53基因突變是人類多種腫瘤最常見的驅動基因，在NSCLC中TP53突變率高達60％以上。TP53突變腫瘤在發病機制及治療上都非常復雜，既往研究表明肺癌中TP53突變相較于其他肺癌常見驅動突變具有更高的TMB和更高的PD-L1表達，免疫基因表達譜分析顯示TP53突變腫瘤相較于TP53野生型腫瘤，細胞毒活性相關基因表達顯著升高。這些結果提示TP53突變腫瘤可能是一類對ICIs治療相對敏感的腫瘤，然而目前針對TP53突變型NSCLC仍未有有效治療手段。因此，尋找合適的預測標志物，對為TP53突變型NSCLC提供有效免疫干預措施具有重要意義。

發明內容

針對上述問題，本發明的目的是提供PTPRD基因突變在預測TP53突變型肺癌患者免疫治療敏感性中的應用。

為實現上述目的，本發明提供的技術方案如下：

本發明提供一種PTPRD基因突變作為生物標志物在預測TP53突變型肺癌患者對免疫檢查點抑制劑療法敏感性中的應用。

本發明還提供一種PTPRD基因突變的檢測產品在制備預測TP53突變型肺癌患者對免疫檢查點抑制劑療法敏感性產品中的應用，PTPRD基因突變的存在為TP53突變型肺癌患者對免疫檢查點抑制劑療法敏感的指征。

進一步地，所述PTPRD基因突變的存在為TP53突變型肺癌患者對免疫檢查點抑制劑療法敏感的指征通過對TP53基因突變型肺癌腫瘤組織進行基因突變的檢測得到，若PTPRD基因存在基因突變，則患者對對免疫檢查點抑制劑療法敏感度高。

進一步地，所述檢測以ctDNA、腫瘤組織或腫瘤循環細胞為檢測樣品。

進一步地，所述檢測以基因測序、PCR、FISH、免疫組化、ELISA、Western或流式細胞技術為檢測方法。

進一步地，所述免疫檢查點抑制劑為PD1抑制劑和/或PDL1抑制劑。

進一步地，所述突變為點突變；

更進一步地，所述點突變包括但不限于單核苷酸多態性，堿基取代/插入/缺失，或沉默突變。

與現有技術相比，本發明的有益效果為：