[發(fā)明專利]一種基于胸部CT影像的肺實(shí)質(zhì)自動(dòng)分割方法在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202110960219.6 | 申請(qǐng)日: | 2021-08-20 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN113706492A | 公開(kāi)(公告)日: | 2021-11-26 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 邢文宇;侯東妮;朱志斌;童琳;他得安 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 復(fù)旦大學(xué) |
| 主分類號(hào): | G06T7/00 | 分類號(hào): | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/136;G06T7/187;G06T7/62;G06T7/66;G06K9/62 |
| 代理公司: | 上海德昭知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31204 | 代理人: | 郁旦蓉 |
| 地址: | 200433 *** | 國(guó)省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 胸部 ct 影像 實(shí)質(zhì) 自動(dòng) 分割 方法 | ||
本發(fā)明提供一種基于胸部CT影像的肺實(shí)質(zhì)自動(dòng)分割方法,由于采用了自動(dòng)種子點(diǎn)提取方法來(lái)提取種子點(diǎn),采用了區(qū)域生長(zhǎng)方法以及孔洞填充方法來(lái)提取得到胸腔輪廓,采用了面積閾值方法來(lái)去除兩個(gè)連通域中的氣管區(qū)域,從而得到肺實(shí)質(zhì)區(qū)域,進(jìn)一步地,還將得到的肺實(shí)質(zhì)區(qū)域以及對(duì)應(yīng)的胸部CT影像作為一一對(duì)應(yīng)的標(biāo)簽和圖像,組成訓(xùn)練集,基于該訓(xùn)練集進(jìn)行分割網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練,得到訓(xùn)練好的肺實(shí)質(zhì)分割網(wǎng)格模型,用于后續(xù)從新的胸部CT影像中提取肺實(shí)質(zhì)區(qū)域,因此,該方法能夠自動(dòng)獲取分割標(biāo)簽,不再需要人工進(jìn)行標(biāo)注,減少了人工工作量,提高了效率,并且獲取的分割標(biāo)簽具有較高的一致性。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于醫(yī)學(xué)影像處理領(lǐng)域,具體涉及一種基于胸部CT影像的肺實(shí)質(zhì)自動(dòng)分割方法。
背景技術(shù)
CT影像為臨床上診斷肺部疾病的重要技術(shù)手段,尤其對(duì)于肺癌而言,早期的肺結(jié)節(jié)等征象發(fā)現(xiàn)及分析,可以提早進(jìn)行臨床干預(yù)治療,降低疾病惡化的風(fēng)險(xiǎn)。目前臨床上對(duì)肺結(jié)節(jié)的分析主要依靠臨床醫(yī)生根據(jù)大量的二維CT切片圖像進(jìn)行分析,效率較低,而且容易錯(cuò)失部分關(guān)鍵信息,造成漏診、誤診等現(xiàn)象發(fā)生,因此,實(shí)現(xiàn)包含肺結(jié)節(jié)的肺實(shí)質(zhì)區(qū)域的三維重建則顯得十分重要。肺實(shí)質(zhì)作為評(píng)估與研究疾病的關(guān)鍵區(qū)域,其準(zhǔn)確的分割與重建對(duì)進(jìn)一步的研究肺部各器官功能的組織與病變至關(guān)重要。
傳統(tǒng)的肺實(shí)質(zhì)分割方式需要人工進(jìn)行干預(yù),目前,可以采用深度學(xué)習(xí)模型方法進(jìn)行肺實(shí)質(zhì)的分割,但是對(duì)于分割標(biāo)簽的獲取往往需要臨床醫(yī)生通過(guò)手工進(jìn)行標(biāo)注,工作量大且效率較低。同時(shí),分割標(biāo)簽可能來(lái)自多位醫(yī)生,由于多位醫(yī)生存在相關(guān)醫(yī)學(xué)經(jīng)驗(yàn)、判斷標(biāo)準(zhǔn)等方面的差異,也會(huì)對(duì)標(biāo)簽的一致性造成一定影響。
發(fā)明內(nèi)容
為解決上述問(wèn)題,提供一種基于胸部CT影像的肺實(shí)質(zhì)自動(dòng)分割方法,本發(fā)明采用了如下技術(shù)方案:
本發(fā)明提供了一種基于胸部CT影像的肺實(shí)質(zhì)自動(dòng)分割方法,用于從胸部CT影像中提取得到肺實(shí)質(zhì)區(qū)域,其特征在于,包括步驟S1,使用種子點(diǎn)提取方法從胸部CT影像中選取種子點(diǎn);步驟S2,基于種子點(diǎn),使用區(qū)域生長(zhǎng)方法以及孔洞填充方法提取得到胸腔輪廓;步驟S3,在胸腔輪廓的范圍內(nèi)進(jìn)行連通域分析,判斷是否存在兩個(gè)面積相近的連通域;步驟S4,當(dāng)步驟S3判斷為否時(shí),使用角點(diǎn)檢測(cè)方法對(duì)胸腔輪廓進(jìn)行分離,得到兩個(gè)連通域;步驟S5,使用面積閾值方法分別去除兩個(gè)連通域中的氣管區(qū)域,得到肺實(shí)質(zhì)區(qū)域;步驟S6,將肺實(shí)質(zhì)區(qū)域作為標(biāo)簽,將肺實(shí)質(zhì)區(qū)域?qū)?yīng)的胸部CT影像作為與標(biāo)簽對(duì)應(yīng)的圖像,組成訓(xùn)練集,基于該訓(xùn)練集進(jìn)行分割網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練,得到訓(xùn)練好的肺實(shí)質(zhì)分割網(wǎng)格模型,并使用肺實(shí)質(zhì)分割網(wǎng)格模型來(lái)從新的胸部CT影像中提取肺實(shí)質(zhì)區(qū)域。
本發(fā)明提供的基于胸部CT影像的肺實(shí)質(zhì)自動(dòng)分割方法,還可以具有這樣的技術(shù)特征,其中,種子點(diǎn)提取方法包括以下步驟:步驟A1,使用具有預(yù)定尺寸及預(yù)定步長(zhǎng)的滑窗對(duì)胸部CT影像進(jìn)行全局遍歷,判斷每個(gè)滑窗內(nèi)的圖像的平均像素灰度值是否高于設(shè)定閾值,當(dāng)判斷為是時(shí),將滑窗作為初步選定滑窗;步驟A2,對(duì)每個(gè)初步選定滑窗以及和初步選定滑窗鄰接的四個(gè)滑窗進(jìn)行相似性測(cè)度計(jì)算,判斷該初步選定滑窗和四個(gè)鄰接的滑窗是否都具有高相似性,當(dāng)判斷為是時(shí),提取初步選定滑窗的質(zhì)心作為種子點(diǎn)。
本發(fā)明提供的基于胸部CT影像的肺實(shí)質(zhì)自動(dòng)分割方法,還可以具有這樣的技術(shù)特征,其中,相似性測(cè)度計(jì)算包括灰度相似性計(jì)算、紋理相似性計(jì)算以及結(jié)構(gòu)相似性計(jì)算,灰度相似性計(jì)算采用了均值差分算法進(jìn)行計(jì)算:
紋理相似性計(jì)算采用了熵差分算法進(jìn)行計(jì)算:
結(jié)構(gòu)相似性計(jì)算采用了基于哈希編碼的漢明值進(jìn)行計(jì)算:
式中,N為圖像的尺度,X為中間區(qū)域圖像的像素灰度值,Yn為X的領(lǐng)域圖像的像素灰度值,Ex、Ey為圖像熵,i為像素的灰度值,j為領(lǐng)域圖像的灰度均值,Pij為圖像取灰度值ij的概率。
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