[發(fā)明專(zhuān)利]基于深度學(xué)習(xí)的外泌體粒徑分析裝置及方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202110948240.4 | 申請(qǐng)日: | 2021-08-18 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN113689456B | 公開(kāi)(公告)日: | 2023-07-25 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 蘇絢濤;王卓 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人: | 山東大學(xué) |
| 主分類(lèi)號(hào): | G06T7/20 | 分類(lèi)號(hào): | G06T7/20;G06T7/11;G06T7/00;G06N3/02;G06V10/774;G06V10/82;G01N15/02 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 基于 深度 學(xué)習(xí) 外泌體 粒徑 分析 裝置 方法 | ||
本發(fā)明提供基于深度學(xué)習(xí)的外泌體粒徑分析裝置及方法,屬于外泌體檢測(cè)識(shí)別設(shè)備技術(shù)領(lǐng)域,包括:激發(fā)模塊對(duì)激光進(jìn)行整形,形成射入待檢測(cè)外泌體樣本的激發(fā)光片;檢測(cè)模塊將激發(fā)光片透射過(guò)待檢測(cè)外泌體樣本,形成外泌體側(cè)向散射光;采集模塊獲取外泌體布朗運(yùn)動(dòng)的視頻;分析模塊結(jié)合所述視頻,利用深度學(xué)習(xí)算法進(jìn)行外泌體顆粒的定位,獲取外泌體顆粒運(yùn)動(dòng)軌跡,計(jì)算顆粒的粒徑。本發(fā)明避免了背景干擾和雜散光影響,具有較好的信噪比;成本低,避免了交叉污染問(wèn)題和樣品浪費(fèi);不會(huì)導(dǎo)致顆粒尺寸過(guò)分高估;不需要標(biāo)記大尺寸磁珠,簡(jiǎn)化了標(biāo)記步驟和成本;提高了顆粒定位精度,無(wú)需進(jìn)行連續(xù)的參數(shù)調(diào)整,減少了主觀因素的影響,保證了結(jié)果的魯棒性和適用性。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及外泌體檢測(cè)識(shí)別設(shè)備技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種基于深度學(xué)習(xí)的外泌體粒徑分析裝置及方法。
背景技術(shù)
外泌體是含有蛋白質(zhì)和核酸的囊泡,大小在40-200nm之間,其可由多種細(xì)胞類(lèi)型和細(xì)胞系分泌,如腫瘤細(xì)胞、干細(xì)胞和神經(jīng)細(xì)胞等,廣泛存在于大多數(shù)如血液、尿液、腹水等體液環(huán)境中。
外泌體在各種生物過(guò)程中起到重要作用,其含的有蛋白質(zhì),脂質(zhì),核酸和糖等生物活性分子在轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞時(shí)具有相應(yīng)的功能,起著細(xì)胞與細(xì)胞間通訊的重要作用,能夠與相鄰細(xì)胞相互作用或進(jìn)入循環(huán)調(diào)節(jié)遠(yuǎn)處細(xì)胞。腫瘤細(xì)胞來(lái)源的外泌體可以通過(guò)與成纖維細(xì)胞、正常細(xì)胞、免疫細(xì)胞、腫瘤細(xì)胞、血管內(nèi)皮細(xì)胞等細(xì)胞進(jìn)行相互作用來(lái)達(dá)到調(diào)節(jié)腫瘤微環(huán)境、促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng);誘使腫瘤位置及轉(zhuǎn)移地區(qū)的血管生成;誘導(dǎo)腫瘤轉(zhuǎn)移,增加腫瘤侵襲性;提高腫瘤對(duì)放射和化學(xué)療法的耐受性的目的;外泌體參與了肝癌的進(jìn)展,可能是肝癌的內(nèi)在標(biāo)志物。
透射電子顯微鏡和原子力顯微鏡可以有效觀察單個(gè)高分辨率外泌體。但是,這些方法缺乏統(tǒng)計(jì)結(jié)果,操作復(fù)雜,儀器和測(cè)量?jī)r(jià)格高。動(dòng)態(tài)光散射和納米顆粒跟蹤分析技術(shù)是外泌體統(tǒng)計(jì)分析最常用的技術(shù),但它們需要昂貴的專(zhuān)業(yè)設(shè)備和經(jīng)驗(yàn)豐富的專(zhuān)業(yè)人員。傳統(tǒng)流式細(xì)胞儀對(duì)光散射的最低檢測(cè)限為200~500nm,改造后的最低檢測(cè)限可低至100nm。使用流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)外泌體的常用方法是在外泌體上標(biāo)記較大尺寸的磁珠,不僅標(biāo)記磁珠步驟復(fù)雜繁瑣,而且標(biāo)記所用試劑的成本也較高。
由于納米顆粒布朗運(yùn)動(dòng)特性,很多時(shí)候外泌體分析離不開(kāi)納米顆粒跟蹤技術(shù),而納米粒子跟蹤的另一個(gè)關(guān)鍵問(wèn)題是粒子的定位。由于成像質(zhì)量的影響,納米顆粒可能會(huì)形成復(fù)雜的圖像,不利于精確定位。傳統(tǒng)的定位方法主要依賴(lài)像素強(qiáng)度分布信息,如最大值法和徑向?qū)ΨQ(chēng)中心法。這些方法的主觀性等局限性阻礙了它們?cè)诩{米顆粒跟蹤復(fù)雜場(chǎng)景中的應(yīng)用。此外,傳統(tǒng)方法在使用過(guò)程中還需要不斷調(diào)整參數(shù)。特別是在復(fù)雜的場(chǎng)景中,參數(shù)的調(diào)整具有很強(qiáng)的主觀性,會(huì)導(dǎo)致不同的結(jié)果。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的在于提供一種可實(shí)現(xiàn)納米顆粒的尺寸識(shí)別的基于深度學(xué)習(xí)的外泌體粒徑分析裝置及方法,以解決上述背景技術(shù)中存在的至少一項(xiàng)技術(shù)問(wèn)題。
為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采取了如下技術(shù)方案:
一方面,本發(fā)明提供一種基于深度學(xué)習(xí)的外泌體粒徑分析裝置,包括:
激發(fā)模塊,用于對(duì)激光進(jìn)行整形,形成射入待檢測(cè)外泌體樣本的激發(fā)光片;
檢測(cè)模塊,用于將激發(fā)光片透射過(guò)待檢測(cè)外泌體樣本,形成外泌體側(cè)向散射光;
采集模塊,用于獲取外泌體布朗運(yùn)動(dòng)的視頻;
分析模塊,用于結(jié)合所述圖像,進(jìn)行外泌體顆粒的定位,獲取外泌體顆粒運(yùn)動(dòng)軌跡,計(jì)算顆粒的粒徑。
優(yōu)選的,所述分析模塊包括定位單元、追蹤單元以及計(jì)算單元;
所述定位單元,用于利用訓(xùn)練好的深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò),對(duì)所述圖像進(jìn)行處理,獲取外泌體顆粒的定位信息;其中,所述訓(xùn)練好的深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)由訓(xùn)練集訓(xùn)練得到,所述訓(xùn)練集包括多個(gè)外泌體模擬圖像以及用于標(biāo)注圖像中外泌體顆粒中心區(qū)域位置的金標(biāo)注;
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