[發(fā)明專(zhuān)利]與肉雞飼料轉(zhuǎn)化效率性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用

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• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202110933014.9
• 申請(qǐng)日: 2021-08-13
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN113699250A
• 公開(kāi)（公告）日: 2021-11-26
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 鄭麥青;趙桂蘋(píng);文杰;崔煥先;劉冉冉;劉麗;杜永旺;李森
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/6888
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京路浩知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002
• 代理人: 孫怡

本發(fā)明涉及分子標(biāo)記技術(shù)領(lǐng)域，具體公開(kāi)了與肉雞飼料轉(zhuǎn)化效率性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用。本發(fā)明中，所述分子標(biāo)記包括rs14219226，其含有肉雞2號(hào)染色體上第90,963,291bp處多態(tài)性為C/T的核苷酸序列；rs14342189，其含有肉雞3號(hào)染色體上第38,794,074bp處多態(tài)性為C/T的核苷酸序列；rs318129041，其含有肉雞4號(hào)染色體上第35,414,875bp處多態(tài)性為T(mén)/C的核苷酸序列；rs315853113，其含有肉雞15號(hào)染色體上第4,012,956bp處多態(tài)性為T(mén)/A的核苷酸序列；rs733815383，其含有肉雞18號(hào)染色體上第3,276,056bp處多態(tài)性為C/T的核苷酸序列。本發(fā)明預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性高。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及分子標(biāo)記技術(shù)領(lǐng)域，具體地說(shuō)，涉及與肉雞飼料轉(zhuǎn)化效率性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

肉雞產(chǎn)業(yè)是畜牧業(yè)的重要組成部分，肉雞產(chǎn)業(yè)包括白羽肉雞和黃羽肉雞兩部分。而無(wú)論是白羽肉雞還是黃羽肉雞，都面臨著腹脂沉積過(guò)多的問(wèn)題，腹脂過(guò)度沉積對(duì)肉雞的生產(chǎn)和消費(fèi)都帶來(lái)了巨大的影響，如降低胴體中瘦肉比例、降低飼料轉(zhuǎn)化效率等。飼料成本占肉雞生產(chǎn)成本的70％，尤其是市場(chǎng)行情變動(dòng)易導(dǎo)致飼料原料的價(jià)格飛漲，因此降低腹脂沉積，提高飼料利用效率，減少飼養(yǎng)成本是肉雞育種中的重要目標(biāo)。

在2001年Meuwissen等提出利用覆蓋全基因組范圍內(nèi)的高密度分子標(biāo)記進(jìn)行個(gè)體育種值估計(jì)的方法。在2006年，Schaeffer等在奶牛的研究當(dāng)中，使用基因組選擇與后裔測(cè)定方案進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)基因組選擇提高了近2倍的遺傳進(jìn)展，減少了92％的飼養(yǎng)成本。選擇合適的計(jì)算模型對(duì)肉雞的育種工作是至關(guān)重要的，基因組選擇有不同模型，其預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性也各有優(yōu)劣。為減少基因分型的成本，有學(xué)者提出了結(jié)合系譜信息的一步法。而現(xiàn)在，結(jié)合先驗(yàn)信息的基因組選擇被證實(shí)有利于提高預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性。整合生物學(xué)先驗(yàn)GS研究的一個(gè)關(guān)鍵問(wèn)題就是選擇合適的先驗(yàn)信息。理論上，任何能夠影響表型的各組學(xué)數(shù)據(jù)都可以成為GS的生物學(xué)先驗(yàn)信息，因而先驗(yàn)信息可包括基因組、表觀組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、代謝組以及功能注釋等信息。袁澤湖的研究發(fā)現(xiàn)，添加前期基于高密度分子標(biāo)記的GWAS結(jié)果，可以提高GBLUP、BayesR等方法的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性。

脂類(lèi)為生物體供應(yīng)能量，但脂肪沉積過(guò)多會(huì)對(duì)黃羽肉雞的生產(chǎn)性能產(chǎn)生負(fù)面影響，如誘發(fā)健康問(wèn)題、降低飼料利用效率等。從大量的研究報(bào)道及選擇的實(shí)際效果來(lái)看，對(duì)雞體內(nèi)脂肪沉積控制的常規(guī)選擇是從直接選擇和間接選擇兩個(gè)方面進(jìn)行：直接選擇，即對(duì)腹部脂肪重或腹脂率進(jìn)行選擇；間接選擇，即尋求活體度量體脂或腹脂量的間接選擇指標(biāo)對(duì)其選擇，以最終實(shí)現(xiàn)對(duì)雞體內(nèi)脂肪沉積的控制。在肉雞的實(shí)際生產(chǎn)當(dāng)中，還是以直接法選擇全同胞個(gè)體屠宰測(cè)定腹脂重和腹脂率為主。有必要對(duì)更快速、有效的選擇方法進(jìn)行進(jìn)一步研究。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供一種與肉雞飼料轉(zhuǎn)化效率性狀顯著相關(guān)的SNP分子標(biāo)記及高效肉雞選育方法。

高效肉雞指飼料利用效率高、腹脂率低的優(yōu)質(zhì)肉雞。

剩余采食量(Residual Feed Intake，RFI)定義為實(shí)際采食量與預(yù)期采食量之差，將能量分為維持能和代謝能，在個(gè)體中的表現(xiàn)的主要是個(gè)體代謝效率上的差異，與體重等生產(chǎn)指標(biāo)不存在相關(guān)性，可以作為一個(gè)很好的指標(biāo)衡量飼料效率。腹脂率為高遺傳力性狀，剩余采食量為低遺傳力性狀，二者之間呈強(qiáng)的正相關(guān)。

針對(duì)育種和生產(chǎn)實(shí)踐需求，本發(fā)明使用雙性狀模型進(jìn)行選擇選育，以快大型黃羽肉雞種為素材，通過(guò)腹脂和剩余采食量的表型和全基因組SNP測(cè)定，篩選并獲得顯著影響黃羽肉雞腹脂和剩余采食量的SNP標(biāo)記。通過(guò)在GBLUP方法估計(jì)中增加顯著SNP權(quán)重的方法，提高育種值估計(jì)的準(zhǔn)確性。為實(shí)現(xiàn)腹脂和剩余采食量的早期選擇和性狀相關(guān)等位基因的快速純和，加快遺傳選擇進(jìn)展提供技術(shù)支撐。

具體地，本發(fā)明的技術(shù)方案如下：