[發明專利]用于鑒定婁門鴨品種的SNP位點組合及其鑒定方法

有效

• 申請號: 202110825345.0
• 申請日: 2021-07-21
• 公開（公告）號: CN113308559B
• 公開（公告）日: 2023-07-18
• 發明（設計）人: 劉宏祥;沈永杰;章雙杰;李慧芳;王靖;阮麗莎;朱春紅;許冰斌;朱杰;朱靜;宋衛濤;陳維;于書云;陶志云;徐文娟
• 申請（專利權）人: 江蘇省家禽科學研究所;昆山市畜牧獸醫站
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11;G16B20/20
• 代理公司: 北京東正專利代理事務所(普通合伙) 11312
• 代理人: 劉瑜冬

1.一種用于鑒定婁門鴨品種的引物組合，其特征在于，所述引物組合為用于擴增SNP位點的引物組合；所述SNP位點為如下的LM1P位點到LM11P位點：

LM1P位于NC_040047.1染色體上第7884538位，其脫氧核苷酸為C或T；

LM2P位于NC_040047.1染色體上第50172915位，其脫氧核苷酸為G或A；

LM3P位于NC_040047.1染色體上第88344831位，其脫氧核苷酸為C或G；

LM4P位于NC_040048.1染色體上第93613586位，其脫氧核苷酸為G或C；

LM5P位于NC_040053.1染色體上第27582986位，其脫氧核苷酸為C或T；

LM6P位于NC_040053.1染色體上第33918341位，其核苷酸堿基為T或G；

LM7P位于NC_040057.1染色體上第18621687位，其核苷酸堿基為A或G；

LM8P位于NC_040057.1染色體上第20312796位，其核苷酸堿基為T或A；

LM9P位于NC_040058.1染色體上第5857153位，其核苷酸堿基為A或G；

LM10P位于NC_040059.1染色體上第10958839位，其核苷酸堿基為G或A；

LM11P位于NC_040063.1染色體上第11389726位，其核苷酸堿基為G或A。

各引物的序列為：

LM1F：5’TAGTTCCGCAGCCTTGTTTTC3’

LM1R：5’GCTTTGGGTCTTAGTGTCCA3’

LM2F：5’CGACAACAGCAAAAGAGAGTGT3’

LM2R：5’ACTTTGATAATGGCAGACCCGA3’

LM3F：5’GGGCCCCTGAAACTGAAGAAAG3’

LM3R：5’GCTAAAGTGCCAGCGATCAG3’

LM4F：5’GCATTGAAACAAGCTGCCCA3’

LM4R：5’CAGGTGACCACCCAACCTAC3’

LM5F：5’ACGGTGCTGACAAGCTCTTT3’

LM5R：5’TGAACATCCCTGTTCGGGTG3’

LM6F：5’ACAGTCATTGGAAACAGGGCT3’

LM6R：5’TGGGGAAAGACCCACTTGTT3’

LM7F：5’AGGCGCTAAGAAACTACTCGT3’

LM7R：5’AGCAGAGACAGTTCAAGGGC3’

LM8F：5’TCCCAGTCGGCATCAGTTTT3’

LM8R：5’TTATTCACCGTGGGCAGCAG3’

LM9F：5’AATTCAGGCAGGAGATGGCA3’

LM9R：5’CCTGGGGAAAGCAACAGGAA3’

LM10F：5’GAGCCAGAGGCAAAGGGAAT3’

LM10R：5’GTGCATCGTGTCTTCTCCCT3’

LM11F：5’GGCCATCCTCAGTGGCTATT3’

LM11R：5’TGGACTTGGGACCTGTTTGG3’。

2.權利要求1所述引物組合在婁門鴨品種鑒定中的應用。

3.一種婁門鴨品種的鑒定方法，其特征在于，包括以下步驟：

(1)提取待測鴨基因組總DNA；

(2)根據所選SNP位點，利用權利要求1的引物進行PCR擴增；

(3)將PCR擴增產物測序后、判斷基因型；

(4)根據基因型結果，判斷個體是否屬于婁門鴨品種；

所述步驟(4)中，根據貝葉斯定理判定該個體屬于婁門鴨的概率,計算公式如下：

其中，p_i表示SNP組合中第i個SNP中婁門鴨品種對應基因型的頻率，q_i表示SNP組合中第i個SNP中其他品種對應基因型的頻率；

若P_LM大于0.95，則判定待測鴨為婁門鴨。