[發明專利]基于全基因組選擇的馬氏珠母貝金黃殼色性狀良種培育方法

在審

• 申請號: 202110796902.0
• 申請日: 2021-07-14
• 公開（公告）號: CN113373245A
• 公開（公告）日: 2021-09-10
• 發明（設計）人: 鄧岳文;王姿曼;郝瑞娟;楊創業;趙子涵;王慶恒;鄭哲;杜曉東
• 申請（專利權）人: 廣東海洋大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;A01K61/56
• 代理公司: 廣州市南鋒專利事務所有限公司 44228
• 代理人: 千帆

1.一種基于全基因組選擇的馬氏珠母貝金黃殼色性狀良種培育方法，其特征在于：所述培育方法包括以下步驟：

步驟一，馬氏珠母貝金黃殼色性狀測定及參考群體構建；

步驟二，對馬氏珠母貝金黃殼色性狀參考群體進行基因組重測序和全基因組SNP標記鑒定；

步驟三，計算每個SNP標記的效應值，對驗證群進行育種值估計；結合驗證群的表型值，計算其相關性及回歸系數，選出最佳的預測計算模型；

步驟四，利用步驟三選擇的最佳預測模型用于育種群育種值估計，并用于最終的選種。

2.根據權利要求1所述的培育方法，其特征在于：所述步驟一中，對馬氏珠母貝進行金黃殼色性狀測定，依據馬氏珠母貝的金黃殼色性狀構建參考群體。

3.根據權利要求2所述的培育方法，其特征在于：所述步驟二中，利用基因組重測序方法，測序深度大于10×，進行SNP位點標記鑒定，獲得全基因組范圍內超高密度SNP位點。

4.根據權利要求3所述的培育方法，其特征在于：所述步驟三中，利用參考群的表型值和基因型信息，加入到基于rrBLUP、BayesA和BayesB分析方法的基因組預測模型，計算每個SNP標記的育種效應值，將rrBLUP、BayesA和BayesB作為基因組選擇方法的代表，對三種基因組選擇方法的預測準確性進行評估，利用驗證群全基因組SNP分型結果和SNP的效應值，計算驗證群每個個體的育種值；根據驗證群的育種值及表型值，計算兩者的相關性及回歸系數，篩選其中最佳的基因組預測模型。

5.根據權利要求4所述的培育方法，其特征在于：所述步驟四具體為選用步驟三中確定的預測準確性最高的基因組選擇方法，預測育種群體中每個個體的育種值，并根據基因組育種值從高到低進行個體選擇。