[發明專利]PRUNE1基因檢測在多發性骨髓瘤患者預后中的應用

有效

• 申請號: 202110794277.6
• 申請日: 2021-07-14
• 公開（公告）號: CN113512589B
• 公開（公告）日: 2023-03-10
• 發明（設計）人: 劉澎;徐佳岱;王亞文
• 申請（專利權）人: 復旦大學附屬中山醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 上海申匯專利代理有限公司 31001
• 代理人: 翁若瑩

本發明涉及一種PRUNE1基因檢測在多發性骨髓瘤患者預后中的應用，屬于生物醫藥技術領域。本發明提供一種檢測PRUNE1基因拷貝數在伴有1q21擴增的多發性骨髓瘤患者預后中的應用，通過檢測PRUNE1的拷貝數，預測患者的預后。通過對PRUNE1基因拷貝數分析，將伴有1q21gain(CKS1B gain)的MM患者的生存預后更好地分層，協助臨床醫生更好地判斷患者的預后，以便制定更精細化的臨床診療策略。

技術領域

本發明涉及一種PRUNE1基因檢測在多發性骨髓瘤患者預后中的應用，屬于生物醫藥技術領域。

背景技術

多發性骨髓瘤(Multiple myeloma,MM)是一種因骨髓中克隆性漿細胞或漿母細胞異常增殖并分泌大量無效單克隆抗體所致的血液系統惡性腫瘤。MM的異質性很強，這種疾病目前被認為是無法治愈的。染色體1q21拷貝數擴增(1q21Gain)是MM中最常見的細胞遺傳學異常之一，尤其是在非白色人種患者群體中。據文獻報道，約30-50％的初診MM患者可檢測出1q21 Gain，在復發難治MM患者中其陽性率甚至可達到70％。但是，雖然具有如此高的陽性率，1q21 Gain在MM中的預后價值地位始終存在爭議，直至今日尚無定論。所以，本技術領域亟需一種對MM患者預后進行判斷的方法。

發明內容

本發明的目的是為解決如何對伴有1q21 Gain的MM患者進行預后分層的技術問題。

為達到解決上述問題的目的，本發明所采取的技術方案是提供一種檢測PRUNE1基因拷貝數在伴有1q21 Gain的MM患者預后中的應用，通過檢測PRUNE1的拷貝數，預測患者的預后。

優選地，所述檢測PRUNE1的拷貝數，是在伴有1q21 Gain的MM患者的CD138+漿細胞中進行檢測。

本發明提供一種檢測PRUNE1基因拷貝數在伴有1q21 Gain的MM患者預后中的應用具體應用在制備預測MM患者預后的檢測試劑盒或基因探針中的應用。

相比現有技術，本發明具有如下有益效果：

本發明提供的一種檢測PRUNE1基因拷貝數在伴有1q21擴增的MM患者預后中的應用，通過對PRUNE1基因拷貝數分析，可進一步將伴有1q21 gain(CKS1Bgain)的MM患者的生存預后更好地分層，協助臨床醫生更好地判斷患者的預后，以便制定更精細化的臨床診療策略。

附圖說明

圖1為單因素生存分析聯合Lasso回歸分析圖；明確染色體1q21上的編碼基因RNA表達值對伴有1q21 Gain的MM患者生存的預后意義。

將處于染色體1q21上的215個編碼基因RNA表達值結合MMRF CoMMpass中伴有1q21gain患者的生存數據(總體生存期，Overall Survival，OS和無疾病進展期，ProgressionFree Survival，PFS)進行單因素生存分析后，將具有統計學意義的基因進一步進行Lasso回歸分析；其中A圖為13個基因對OS有顯著統計學意義，B圖為5個基因對PFS有顯著統計學意義。(RNA表達值作為輸入自變量，患者的生存值作為目標因變量。左圖為交叉驗證，右圖為線性回歸，每一條曲線代表了每一個自變量系數的變化軌跡，縱坐標是系數的值，下橫坐標是log(λ)，上橫坐標是此時模型中非零系數的個數。)

圖2為RNA表達值和DNA拷貝數之間的相關性分析圖。將經過多因素Cox回歸分析后挑選出的4個基因的RNA表達值與同一患者的該基因DNA拷貝數(CN,Copy number)進行Pearson相關性分析圖。每個方框中的數字代表相關性系數，帶有背景色的方框代表RNA表達值與同一患者的該基因DNA拷貝數有顯著統計學相關性(p0.05)，顏色越深p值越小。