[發(fā)明專利]一種用于人腺病毒7型檢測的探針、試劑盒及其使用方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110793218.7 | 申請日: | 2021-07-13 |
| 公開(公告)號: | CN113355324A | 公開(公告)日: | 2021-09-07 |
| 發(fā)明(設計)人: | 曹現濤;陸亞平;魏光;李彬;李拼 | 申請(專利權)人: | 國藥(武漢)醫(yī)學實驗室有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12Q1/70;C12Q1/6844 |
| 代理公司: | 深圳市科進知識產權代理事務所(普通合伙) 44316 | 代理人: | 魏毅宏 |
| 地址: | 430000 湖北省武漢市東湖新技術開發(fā)區(qū)*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 病毒 檢測 探針 試劑盒 及其 使用方法 | ||
本發(fā)明提供了一種用于人腺病毒7型檢測的探針、試劑盒及其使用方法。該試劑盒為基于MIRA熒光法的人腺病毒7型核酸檢測試劑盒。其中,MIRA的引物是根據腺病毒7型hexon基因特異序列設計的,本發(fā)明提供了一種快速、特異、靈敏、無需復雜儀器設備的核酸檢測試劑盒及其使用方法。
技術領域
本發(fā)明屬于分子診斷生物學技術領域,涉及一種用于人腺病毒7型檢測的探針、試劑盒及其使用方法。
背景技術
人腺病毒(human adenovirus,HAdV)是無包膜的雙鏈DNA病毒,根據感染性中和反應,HAdV可分為57個血清型,又根據核酸的同源性、纖維蛋白的特異性和抗原決定簇,目前鑒定的57個血清型又分為A~G 7個亞屬,A、F和G主要引起消化道感染、腹瀉,C、E和部分B亞屬主要引起呼吸道感染,其他B亞屬主要引起尿路感染,D亞屬只要引起角膜炎和結膜炎。并且由于其基因組的重組和變異,新的型別還在不斷地出現,某些型別可引起爆發(fā)流行。人感染HAdV可導致多種疾病,包括上呼吸道感染、支氣管炎、肺炎、結膜炎、急性出血性膀胱炎等。急性呼吸道感染患者陽性率為5.7%-6.36%。報道顯示HAdV感染人群主要集中3~6歲,中位年齡為4歲6月。5歲以下兒童占58.73%。學齡前兒童檢出率最高,其次是嬰幼兒和學齡兒童。傳播途徑主要是經空氣飛沫傳播。因此,準確鑒定和區(qū)分人腺病毒的血清型對于確定和優(yōu)化治療方案以及抑制病原菌的傳播具有重要意義。
傳統的檢測方法包括病毒分離鑒定、免疫熒光和普通PCR檢測法,存在成本高、耗時長,有假陽性等問題,不能及時為防疫部門提供病原學依據。為此我們根據人腺病毒7型六鄰體(hexon)基因高度保守區(qū)設計引物和MIRA探針,建立一種快速、特異、敏感的腺病毒檢測方法,對快速預警腺病毒爆發(fā)具有重要意義。
近年來,分子生物學方法不斷被應用到呼吸道病原體的快速檢測中,呼吸道病原體的實驗室診斷方法取得了很大的進展,核酸檢測已經成為了呼吸道病原體實驗室診斷的發(fā)展方向。相對于傳統的實驗室檢測法,分子診斷技術具有無可比擬的檢測速度、特異性和靈敏度,已成為實驗室診斷的新標準。
MIRA(Multienzyme Isothermal Rapid Amplification)技術是一種多酶恒溫核酸快速擴增技術,基本原理是:在常溫恒溫下,重組酶和引物形成蛋白/單鏈核苷酸的復合體Rec/ssDNA,在輔助蛋白和單鏈結合蛋白SSB的幫助下,侵入雙鏈DNA模板;在侵入位點形成D-loop區(qū)域,并開始對DNA雙鏈進行掃描;待找到與引物互補的目的區(qū)域后,復合體Rec/ssDNA解體的同時,聚合酶也結合到引物的3’末端,開始鏈的延伸,這個過程迅速高效地循環(huán),從而完成目的片段超快速擴增。熒光檢測則依賴核酸外切酶的作用,加入根據模版設計的特異的分子探針,使用熒光監(jiān)測設備實現對目標片段擴增過程的實時監(jiān)控。MIRA技術具有快速、簡便、無需特殊儀器等優(yōu)點,目前已被應用于多種重要疾病病原體的檢測中。
針對現有技術中存在的問題,本發(fā)明研發(fā)并評估了多酶快速恒溫擴增熒光MIRA法作為人腺病毒7型核酸檢測的試劑盒。
發(fā)明內容
因此,本發(fā)明為了解決上述技術問題中的至少一個,提供了一種用于人腺病毒7型檢測的探針、試劑盒及其使用方法,該試劑盒能夠節(jié)約反應時間,反應溫度要求低。
根據本公開的第一方面,提供了一種引物組合,用于擴增包括腺病毒7型hexon基因序列的擴增片段,其特征在于,包括第一引物和第二引物,其中,
所述第一引物的序列為:
ATCATCACCACGCCGCCGCAGCAGAGGAGAAAG;
所述第二引物的序列為:
GTGTCTGTTGCACGGGCGAACTGCACCAGACCC。
在一些可能的實施方式中,還包括第三引物,所述第三引物的序列為:
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