[發(fā)明專(zhuān)利]識(shí)別分子屬性的方法、訓(xùn)練識(shí)別模型的方法和裝置在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202110738193.0 | 申請(qǐng)日: | 2021-06-30 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN113823360A | 公開(kāi)(公告)日: | 2021-12-21 |
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| 主分類(lèi)號(hào): | G16C20/20 | 分類(lèi)號(hào): | G16C20/20 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 識(shí)別 分子 屬性 方法 訓(xùn)練 模型 裝置 | ||
1.一種識(shí)別分子屬性的方法,其特征在于,包括:
獲取分子的分子表達(dá)式;
基于所述分子表達(dá)式,獲取所述分子的距離矩陣;其中,所述距離矩陣用于表征所述分子中的原子的三維結(jié)構(gòu)坐標(biāo)之間的距離;
基于所述距離矩陣構(gòu)建所述分子的分子拓?fù)鋱D;
以所述分子拓?fù)鋱D為輸入,利用識(shí)別模型識(shí)別所述分子的屬性。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述分子中原子個(gè)數(shù)為n,n為正整數(shù);
其中,所述基于所述分子表達(dá)式,獲取所述分子的距離矩陣,包括:
針對(duì)n個(gè)原子中的第i個(gè)原子,計(jì)算所述第i個(gè)原子與所述n個(gè)原子中除所述第i個(gè)原子之外的其他原子之間的距離,以得到所述n個(gè)原子中的每一個(gè)原子的對(duì)應(yīng)的n-1個(gè)距離;
基于所述n個(gè)原子中的每一個(gè)原子的對(duì)應(yīng)的n-1個(gè)距離,得到所述分子的距離矩陣;
其中,所述基于所述距離矩陣構(gòu)建所述分子的分子拓?fù)鋱D,包括:
基于所述距離矩陣獲取所述分子的接觸矩陣;其中,所述接觸矩陣中的任意一個(gè)數(shù)值用于表征n個(gè)原子中與所述任意一個(gè)數(shù)值對(duì)應(yīng)的兩個(gè)原子之間的距離是否滿(mǎn)足預(yù)設(shè)條件;
基于所述接觸矩陣構(gòu)建所述分子拓?fù)鋱D。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述基于所述n個(gè)原子中的每一個(gè)原子的對(duì)應(yīng)的n-1個(gè)距離,得到所述分子的距離矩陣,包括:
基于所述n個(gè)原子中的每一個(gè)原子的對(duì)應(yīng)的n-1個(gè)距離,構(gòu)建n*n矩陣;
將所述n*n矩陣,確定為所述距離矩陣。
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述基于所述距離矩陣獲取所述分子的接觸矩陣,包括:
針對(duì)所述距離矩陣中的任意一個(gè)數(shù)值,若所述任意一個(gè)數(shù)值小于或等于預(yù)設(shè)閾值,將所述任意一個(gè)數(shù)值修改為第一數(shù)值;若所述任意一個(gè)數(shù)值大于所述預(yù)設(shè)閾值,將所述任意一個(gè)數(shù)值修改為第二數(shù)值;
其中,所述第一數(shù)值用于表征所述任意一個(gè)數(shù)值對(duì)應(yīng)的兩個(gè)原子之間距離滿(mǎn)足預(yù)設(shè)條件,所述第二數(shù)值用于表征所述任意一個(gè)數(shù)值對(duì)應(yīng)的兩個(gè)原子之間的距離不滿(mǎn)足預(yù)設(shè)條件。
5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述基于所述接觸矩陣構(gòu)建所述分子拓?fù)鋱D,包括:
針對(duì)所述接觸矩陣中任意一個(gè)數(shù)值,若所述任意一個(gè)數(shù)值用于表征兩個(gè)原子之間的距離滿(mǎn)足預(yù)設(shè)條件,則連接所述分子拓?fù)鋱D中的所述兩個(gè)原子;若所述任意一個(gè)數(shù)值表征兩個(gè)原子之間的距離不滿(mǎn)足預(yù)設(shè)條件,則不連接所述分子拓?fù)鋱D中所述兩個(gè)原子。
6.根據(jù)權(quán)利要求1至5中任一項(xiàng)所述的方法,其特征在于,所述分子表達(dá)式為簡(jiǎn)化分子線性輸入規(guī)范SMILES表達(dá)式,所述分子的屬性為吸收,分布代謝排泄毒性ADMET性質(zhì)。
7.一種訓(xùn)練識(shí)別模型的方法,其特征在于,包括:
獲取已標(biāo)注有屬性的分子的分子表達(dá)式;
基于所述分子表達(dá)式,獲取所述分子的距離矩陣;其中,所述距離矩陣用于表征所述分子中的原子的三維結(jié)構(gòu)坐標(biāo)之間的距離;
基于所述距離矩陣構(gòu)建所述分子的分子拓?fù)鋱D;
以所述分子拓?fù)鋱D以及所述分子的屬性為輸入,訓(xùn)練識(shí)別模型。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法,其特征在于,所述分子中原子個(gè)數(shù)為n,n為正整數(shù);
其中,所述基于所述分子表達(dá)式,獲取所述分子的距離矩陣,包括:
針對(duì)n個(gè)原子中的第i個(gè)原子,計(jì)算所述第i個(gè)原子與所述n個(gè)原子中除所述第i個(gè)原子之外的其他原子之間的距離,以得到所述n個(gè)原子中的每一個(gè)原子的對(duì)應(yīng)的n-1個(gè)距離;
基于所述n個(gè)原子中的每一個(gè)原子的對(duì)應(yīng)的n-1個(gè)距離,得到所述分子的距離矩陣;
其中,所述基于所述距離矩陣構(gòu)建所述分子的分子拓?fù)鋱D,包括:
基于所述距離矩陣獲取所述分子的接觸矩陣;其中,所述接觸矩陣中的任意一個(gè)數(shù)值用于表征n個(gè)原子中與所述任意一個(gè)數(shù)值對(duì)應(yīng)的兩個(gè)原子之間的距離是否滿(mǎn)足預(yù)設(shè)條件;
基于所述接觸矩陣構(gòu)建所述分子拓?fù)鋱D。
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