[發明專利]腎癌預后相關的生物標志物及其應用

在審

• 申請號: 202110731857.0
• 申請日: 2021-06-30
• 公開（公告）號: CN113337612A
• 公開（公告）日: 2021-09-03
• 發明（設計）人: 楊承剛;王丹;劉樂凱
• 申請（專利權）人: 北京泱深生物信息技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;G01N33/574;G16B25/20;G16B40/00;G16H50/20;G16H50/70
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.一種用于腎癌預后的生物標志物群，其特征在于，所述生物標志物群包括AR、BIRC5、IL20RB和/或ACVRL1。

2.檢測樣本中權利要求1所述的生物標志物群的試劑在制備腎癌預后的診斷產品中的應用。

3.根據權利要求2所述的應用，其特征在于，所述試劑包括通過數字成像技術、蛋白免疫技術、染料技術、核酸測序技術、核酸雜交技術、色譜技術、質譜技術檢測樣本中生物標志物表達水平的試劑。

4.根據權利要求2所述的應用，其特征在于，所述樣本選自下組：外周血樣本、血清樣本、血漿樣本、尿樣本、唾液樣本和組織樣本。

5.一種腎癌預后的診斷產品，其特征在于，所述診斷產品包括檢測權利要求1所述的生物標志物群的試劑；

優選地，所述診斷產品包括芯片、試劑盒。

6.根據權利要5所述的診斷產品，其特征在于，所述試劑包括檢測所述生物標志物群基因轉錄的RNA的量的試劑；

優選地，所述試劑為檢測所述生物標志物群轉錄的mRNA的量的試劑；

優選地，所述試劑為檢測與所述基因轉錄的mRNA互補的cDNA的量的試劑；

優選地，所述試劑包括探針或引物；

優選地，所述診斷產品還包括總RNA抽提試劑、逆轉錄試劑和/或二代測序試劑。

7.根據權利要求5所述的診斷產品，其特征在于，所述試劑為檢測所述生物標志物群基因編碼的多肽/蛋白的量的試劑；

優選地，所述試劑為抗體、抗體片段或者親和性蛋白。

8.一種腎癌生存期預測裝置，其特征在于，包括：

數據獲取模塊，用于獲取待測癌癥患者的權利要求1所述的生物標志物群基因表達譜數據；

預測模塊，用于將所述基因表達譜數據作為輸入提供給訓練好的預測模型，所述預測模型被訓練基于癌癥患者的基因表達譜數據而對所述癌癥患者的生存期進行預測；

預測結果獲取模塊，用于獲取所述預測模型的輸出，得到待測癌癥患者的生存期預測結果；

優選地，所述預測模型為Cox回歸模型；

優選地，所述Cox回歸模型為LASSOCox回歸模型；

優選地，所述預測模型的公式為其中，N為用于預測預后的基因數，Expi為每個基因的表達水平，Ci為每個基因的回歸系數；當風險評分較高時，患者預后不良；當風險評分較低時，患者預后良好；

優選地，所述基因為AR、BIRC5、IL20RB和ACVRL1；

優選地，所述C1、C2、C3、C4分別為-0.4862、0.43、0.0834、-0.1007。

9.一種計算機設備，包括存儲器和處理器，所述存儲器存儲有程序，所述處理器執行所述程序時實現如下方法：

獲取待測癌癥患者的權利要求1所述的生物標志物群基因表達譜數據；

將所述基因表達譜數據作為輸入提供給訓練好的預測模型；

輸出待測癌癥患者的生存期預測結果；

優選地，所述預測模型為Cox回歸模型；

優選地，所述Cox回歸模型為LASSOCox回歸模型；

優選地，所述預測模型的公式為其中，N為用于預測預后的基因數，Expi為每個基因的表達水平，Ci為每個基因的回歸系數，當風險評分較高時，患者預后不良；當風險評分較低時，患者預后良好；

優選地，所述基因為AR、BIRC5、IL20RB和ACVRL1；

優選地，所述C1、C2、C3、C4分別為-0.4862、0.43、0.0834、-0.1007。

10.一種計算機可讀存儲介質，其上存儲有程序，其特征在于，所述程序被執行時實現如下方法：

獲取待測癌癥患者的權利要求1所述的生物標志物群基因表達譜數據；

將所述基因表達譜數據作為輸入提供給訓練好的預測模型；

輸出待測癌癥患者的生存期預測結果；

優選地，所述預測模型為Cox回歸模型；

優選地，所述Cox回歸模型為LASSOCox回歸模型；

優選地，所述預測模型的公式為其中，N為用于預測預后的基因數，Expi為每個基因的表達水平，Ci為每個基因的回歸系數；所述基因為AR、BIRC5、IL20RB和ACVRL1；

優選地，所述C1、C2、C3、C4分別為-0.4862、0.43、0.0834、-0.1007。